VGFR2_HUMAN_808_1171

Vascular endothelial growth factor receptor 2 [Protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. CSF-1/PDGF receptor subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (VGFR2_HUMAN):D: Protein kinase (840:843,848,850,866:868,885,888,889,892,898,899,914,916:923,1019,1024:1027,1035,1044:1049)
804
804,840:843,848,850,866:868,885,888,889,892,898,899,914,916:923,1019,1024:1027,1035,1044:1049

Full PDB list

1vr2,1y6a,1y6b,1ywn,2oh4,2p2h,2p2i,2qu5,2qu6,2rl5,2xir,3b8q,3b8r,3be2,3c7q,3cjf,3cjg,3cp9,3cpb,3cpc,3dtw,3efl,3ewh,3u6j,3vhe,3vhk,3vid,3vnt,3vo3,3wzd,3wze,4ag8,4agc,4agd,4asd,4ase,5ew3 (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
I
8
0
4
L
8
4
0
G
8
4
1
R
8
4
2
G
8
4
3
V
8
4
8
E
8
5
0
A
8
6
6
V
8
6
7
K
8
6
8
E
8
8
5
I
8
8
8
L
8
8
9
I
8
9
2
V
8
9
8
V
8
9
9
V
9
1
4
V
9
1
6
E
9
1
7
F
9
1
8
C
9
1
9
K
9
2
0
F
9
2
1
G
9
2
2
N
9
2
3
L
1
0
1
9
C
1
0
2
4
I
1
0
2
5
H
1
0
2
6
R
1
0
2
7
L
1
0
3
5
I
1
0
4
4
C
1
0
4
5
D
1
0
4
6
F
1
0
4
7
G
1
0
4
8
L
1
0
4
9
[1]2xir.a 00j 34 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vo3.a 0kf 32 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2qu5.a 276 32 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vhe.a 42q 32 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ew3.a 5t2 27 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]2p2i.a 608 30 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3efl.a 706 28 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]3b8r.b 887 31 - . . . - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2p2h.a 994 32 - . . . - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3dtw.a a96 30 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]1y6b.a aax 34 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]1y6a.a aaz 31 - . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]4ase.a av9 32 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cp9.b c19 30 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cpc.b c52 29 - . . - - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3cpb.a c92 27 - . - - - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[2]3cjg.a kim 31 - . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[2]3wzd.a lev 30 - . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2rl5.a 2rl 35 - . . . - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3b8q.a 900 35 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[4]3cjf.a sav 30 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . * . - - .
[1]2qu6.b 857 36 - . . . - . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]2oh4.a gig 36 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vhk.a bpk 22 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ewh.a k11 39 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ywn.a lif 39 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]3vnt.a 0ja 38 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3u6j.a 03x 39 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4agd.a b49 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wze.a bax 32 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3be2.a raj 39 - . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3c7q.a xin 40 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . - -
[1]3vid.a 4tt 17 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]1vr2.a none - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[3]4agc.a axi 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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