UROK_HUMAN_175_427

Urokinase-type plasminogen activator [Peptidase S1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (UROK_HUMAN):D: Peptidase S1 (198,200,206:209,224,225,227:229,235,265,267:272,320,323:326,328,370:376,394:400,405,407,408)198,200,206:209,224,225,227:229,235,265,267:272,320,323:326,328,370:376,394:400,405,407,408

Full PDB list

1c5w,1c5x,1c5y,1c5z,1ejn,1f5k,1f5l,1f92,1fv9,1gi7,1gi8,1gi9,1gj7,1gj9,1gjb,1gjc,1lmw,1o3p,1o5a,1o5b,1o5c,1owd,1owe,1owh,1owi,1owj,1owk,1sc8,1sqa,1sqo,1sqt,1u6q,1vj9,1vja,1w0z,1w10,1w11,1w12,1w13,1w14,2nwn,2o8w,2r2w,2vin,2vio,2vip,2viq,2viv,2viw,2vnt,3ig6,3kgp,3khv,3kid,3mhw,3mwi,3qn7,4fu7,4fu8,4fu9,4fub,4fuc,4fud,4fue,4fuf,4fug,4fuh,4fui,4fuj,4h42,4jk5,4jk6,4jni,4jnl,4mnv,4mnw,4mnx,4mny,4x1r,5hgg (redundant pocketome entry); 1gj8,1gja,1gjd,2o8t,2o8u,3m61,3ox7,3oy5,3oy6,3pb1,4dva,4dw2,4gly,4os1,4os2,4os4,4os5,4os6,4os7,4x0w,4x1n,4x1p,4x1q,4x1s,4xsk,4zhl,4zhm,4zkn,4zko,4zkr,4zks (unprocessed)

Contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
   
ligand
A1
R
1
9
8
H
2
0
0
T
2
0
6
Y
2
0
7
V
2
0
8
C
2
0
9
H
2
2
4
C
2
2
5
I
2
2
7
D
2
2
8
Y
2
2
9
Y
2
3
5
Y
2
6
5
A
2
6
7
D
2
6
8
T
2
6
9
L
2
7
0
A
2
7
1
H
2
7
2
K
3
2
0
S
3
2
3
T
3
2
4
D
3
2
5
Y
3
2
6
Y
3
2
8
D
3
7
0
S
3
7
1
C
3
7
2
Q
3
7
3
G
3
7
4
D
3
7
5
S
3
7
6
V
3
9
4
S
3
9
5
W
3
9
6
G
3
9
7
R
3
9
8
G
3
9
9
C
4
0
0
K
4
0
5
G
4
0
7
V
4
0
8
[1]1gj9.b 134 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1owj.a 155 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sc8.u 2in 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1owk.a 303 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1owi.a 426 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1owd.a 497 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1vja.u 7in 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2viq.a d55 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2viw.a d56 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vnt.a qgg 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w14.u sh1 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1w0z.u si1 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w11.u sk1 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w13.u sm1 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sqa.a ui1 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2viv.a vg2 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fue.a 7up 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ejn.a agb 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vip.a l1r 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fuj.a 1u9 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1o3p.b 655 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fuh.a 1u2 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sqt.a ui3 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fub.a 4up 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1u6q.a 745 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hgg.a DSYA-DHPGLCTSESGRRRYLE,QAP 189 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gj7.b 132 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mny.a 29o,GCQVNYCPP 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fu7.a 1up 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1vj9.u 5in 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fuf.a 8up 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sqo.a ui2 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gi9.b 123 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1o5c.b cr9 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w10.u sj1 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]2r2w.u 4pg 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1o5a.b 696 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mnx.a 29n,LCSDRGCENRWC 115 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fug.a 9up 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h42.u 11e 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w12.u sl1 43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1f92.a ukp 43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ig6.b 438 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gi7.b 120 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kid.u 2bs 15 . - . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3mwi.u b25 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vio.a l1o 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1f5l.a amr 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vin.a 505 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gi8.b bmz 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1c5y.b esp 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3mhw.u abv 10 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fud.a 6up 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fu8.a 2up 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1c5w.b esi 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3qn7.a A-EVDCRGRGSAC-zbr 91 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kgp.a 4az 11 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3khv.a 4al 10 . - . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fv9.a 172 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2o8w.a pl0 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
[1]4jni.u pzh 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1c5z.b bam 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fuc.a 239 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gjc.b 130 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fu9.a 675 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jk5.a C-EVDCRGRdsnSACG,zbr 98 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x1r.u CPAYSAYLDC,pl0 85 . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1o5b.b esi 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jk6.a C-EVDCRGRdbbSACG,zbr 98 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1lmw.b 0gj 25 . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]4mnv.a TCPnh2,TCRQSMCTAR,zbr 106 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]2nwn.a CSWRGLENHRMC 102 . - . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mnw.a QCWDRGCENRKC,zbr 110 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
Similar entries
Feedback