TRYP_PIG_9_231

Trypsin [Peptidase S1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (TRYP_PIG):D: Peptidase S1 (30:33,48,49,51,84,86:89,92,134:136,139,160,163,179:185,199:205,207,210,212)30:33,48,49,51,84,86:89,92,134:136,139,160,163,179:185,199:205,207,210,212

Full PDB list

1aks,1an1,1avw,1avx,1c9p,1eja,1fmg,1fn6,1fni,1h9h,1h9i,1ldt,1mct,1qqu,1s5s,1s6f,1s6h,1s81,1s82,1s83,1s84,1s85,1tfx,1tx6,1uhb,1v6d,1yf4,1z7k,2a31,2a32,3myw,4an7,4doq (redundant pocketome entry); 1ept (unprocessed)

Contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
   
ligand
A1
S
3
0
H
3
1
F
3
2
C
3
3
H
4
8
C
4
9
K
5
1
F
8
4
G
8
6
N
8
7
T
8
8
L
8
9
D
9
2
S
1
3
4
S
1
3
5
G
1
3
6
Y
1
3
9
Y
1
6
0
Q
1
6
3
D
1
7
9
S
1
8
0
C
1
8
1
Q
1
8
2
G
1
8
3
D
1
8
4
S
1
8
5
V
1
9
9
S
2
0
0
W
2
0
1
G
2
0
2
Y
2
0
3
G
2
0
4
C
2
0
5
Q
2
0
7
K
2
1
0
G
2
1
2
[1]2a32.a pg3.pbc 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1s6h.a 4bz 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4doq.a GQCLMLN 51 . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4doq.c YGQCLMLN 63 . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1an1.e KVCACPKILK-C 80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1avw.a P-SPYRIRF 73 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1avx.a P-SPYRIRF-S 79 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1c9p.a DLHCKVK 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1eja.a LHCKVK 46 . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h9h.e GCPRIL-SP 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h9i.e GCPRILI-SP 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ldt.t KKVCACPKILK-C 86 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mct.a RICPRIW 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qqu.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s6f.a sbp 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1s81.a na 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s82.a na,sbe 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1s83.a 4ha 6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s84.a dyb 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1s85.a sbz 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . .
[1]1tfx.a GICRGYIT 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tfx.b ICRGYIT 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tx6.a AVCTRSI-P 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tx6.b F-DKAICTRSN-VPPR 111 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1uhb.a GKDSCQGDS 61 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yf4.a CYFQNCPRGnh2 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1z7k.a ILCNKALN-A-E 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2a31.a pg3 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3myw.a CICTRSM 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3myw.b CDCTKSK-C 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4an7.a P-N-SRARISH 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
Similar entries
Feedback