TRYB1_HUMAN_31_275

Tryptase alpha/beta-1 [Peptidase S1 family. Tryptase subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains homodimer[show domain annotation]
 • A1 (TRYB1_HUMAN):D: Peptidase S1 (50,58,74:76,78,79,81,82,85,86,114:118,192,196,204,218:224,242:248,253,255)50,58,74:76,78,79,81,82,85,86,114:118,192,196,204,218:224,242:248,253,255
 • A2 (TRYB1_HUMAN):D: Peptidase S1 (50,58,74:76,78,79,81,82,85,86,107,114:118,192,196,204,218:224,242:248,253,255)50,58,74:76,78,79,81,82,85,86,107,114:118,192,196,204,218:224,242:248,253,255

Full PDB list

1a0l,1lto,2bm2,2f9n,2f9o,2f9p,2fpz,2fs8,2fs9,2fww,2fxr,2gdd,2za5,2zeb,2zec,3v7t,4a6l,4mpu,4mpv,4mpw,4mpx,4mqa,5f03 (redundant pocketome entry)

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ligand
A1 A2
V
5
0
F
5
8
H
7
4
C
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5
V
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6
P
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C
2
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R
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3
G
2
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5
[1]3v7t.a 0gx,0gx 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zeb.a 11m,11m 58 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zec.b 11n,11n 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2za5.a 2ff,2ff 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f03.b 5ta 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4a6l.b p43,p43 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bm2.b pm2,pm2 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2fs9.c c4a,c4a 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[1]1a0l.a apa 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1a0l.d apa,apa 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[1]2gdd.b 5am,5am 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[1]2fww.c c1r 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2fpz.a 270 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]1lto.a none . . . . L . . . . T . . I I . T . . . . . . K . . . . . . D . . . . . . . . . L . . . . T . . . I I . T . . . . . . K . . . . . . D . . . . .
[1]2fxr.b c3a,c3a 82 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[2]2f9n.a aceLLar7,aceLLar7 60 . . . . . . . . . T . . I I . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . I I . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2f9o.b none . . . . . . . . . T . . I I . T . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . I I . T . . . . . . K . . . . . . . . . . . .
[2]2f9p.a aceLLar7,aceLLar7 59 . . . . . . . . . T . . I I . T . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . I I . T . . . . . . K . . . . . . . . . . . .
[1]4mpu.a pg4,x2a 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mpu.b pg4,pg4,x2a 90 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mpv.b 2a4 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mpw.b 2aj,pge,pge 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mpx.b 2av,pge,pge 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mqa.b pg4,x00 68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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