THRB_HUMAN_364_622

Prothrombin [Peptidase S1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (THRB_HUMAN):D: Peptidase S1 (388:391,406,407,410,413,415,455,457:459,507,509,511,542,562:568,588:594,596,600:603)
R: High affinity receptor-binding region which is also known as the TP508 peptide (562:568)
388:391,406,407,410,413,415,455,457:459,507,509,511,542,562:568,588:594,596,600:603

Full PDB list

1bhx,1d6w,1d9i,1doj,1eb1,1eoj,1eol,1g37,1h8d,1h8i,1hag,1jwt,1mh0,1nm6,1nt1,1nu9,1sl3,1ta2,1ta6,1vzq,1w7g,1xm1,1z71,1zgi,1zgv,1zrb,2ank,2anm,2bdy,2bvr,2bvs,2bvx,2bxt,2bxu,2cf8,2cf9,2cn0,2hpq,2v3h,2v3o,3c1k,3k65,3nxp,3qlp,3sqe,3sqh,4ax9,4boh,4h6t,4hzh,4i7y,4loy,4lxb,4nze,4nzq,4o03,4rko,4rn6,4ud9,4udw,4ue7,4ueh,4ufd,4ufe,4uff,4ufg,5a2m,5af9,5afy,5afz,5ahg,5e8e,5edk,5edm (redundant pocketome entry); 1a2c,1a3b,1a3e,1a46,1a4w,1a5g,1a61,1abi,1abj,1ad8,1ae8,1afe,1aht,1ai8,1aix,1awf,1awh,1ay6,1b5g,1b7x,1ba8,1bb0,1bcu,1bmm,1bmn,1bth,1c1u,1c1v,1c1w,1c4u,1c4v,1c4y,1c5l,1c5n,1c5o,1ca8,1d3d,1d3p,1d3q,1d3t,1d4p,1de7,1dit,1dm4,1dwb,1dwc,1dwd,1dwe,1dx5,1e0f,1fpc,1fph,1g30,1g32,1ghv,1ghw,1ghx,1ghy,1gj4,1gj5,1hah,1hai,1hao,1hap,1hbt,1hdt,1hgt,1hlt,1hut,1hxe,1hxf,1ihs,1iht,1jmo,1jou,1k21,1k22,1kts,1ktt,1lhc,1lhd,1lhe,1lhf,1lhg,1mu6,1mu8,1mue,1no9,1nrn,1nro,1nrp,1nrq,1nrr,1nrs,1nu7,1ny2,1nzq,1o0d,1o2g,1o5g,1ook,1oyt,1p8v,1ppb,1qbv,1qhr,1qj1,1qj6,1qj7,1qur,1rd3,1riw,1sb1,1sfq,1sg8,1sgi,1shh,1sr5,1t4u,1t4v,1tb6,1tbz,1thp,1thr,1ths,1tmb,1tmt,1tmu,1tom,1tq0,1tq7,1twx,1uma,1uvs,1vr1,1way,1wbg,1xmn,1ype,1ypg,1ypj,1ypk,1ypl,1ypm,1z8i,1z8j,2a0q,2a2x,2afq,2b5t,2c8w,2c8x,2c8y,2c8z,2c90,2c93,2feq,2fes,2gde,2gp9,2h9t,2hgt,2hnt,2hpp,2hwl,2jh0,2jh5,2jh6,2od3,2pgb,2pgq,2pks,2pw8,2r2m,2thf,2uuf,2uuj,2uuk,2zc9,2zda,2zdv,2zf0,2zff,2zfp,2zfq,2zfr,2zg0,2zgb,2zgx,2zhe,2zhf,2zhq,2zhw,2zi2,2ziq,2znk,2zo3,3b23,3b9f,3bef,3bei,3bf6,3biu,3biv,3bv9,3c27,3d49,3da9,3dd2,3dhk,3dt0,3dux,3e6p,3ee0,3egk,3eq0,3f68,3gic,3gis,3hat,3hkj,3htc,3jz1,3jz2,3ldx,3lu9,3p17,3p6z,3p70,3pmh,3po1,3qdz,3qgn,3qto,3qtv,3qwc,3qx5,3r3g,3rlw,3rly,3rm0,3rm2,3rml,3rmm,3rmn,3rmo,3s7h,3s7k,3sha,3shc,3si3,3si4,3sv2,3t5f,3tu7,3u69,3u8o,3u8r,3u8t,3u98,3u9a,3utu,3uwj,3vxe,3vxf,4ayv,4ayy,4az2,4bah,4bak,4bam,4ban,4bao,4baq,4ch2,4ch8,4dih,4dii,4dt7,4dy7,4e05,4e06,4e7r,4h6s,4hfp,4htc,4lz1,4lz4,4mlf,4n3l,4rkj,4thn,4yes,5cmx,5do4,5ew1,5gds,5jdu,5luw,5luy,7kme,8kme (unprocessed)

Contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
   
ligand
A1
E
3
8
8
L
3
8
9
L
3
9
0
C
3
9
1
H
4
0
6
C
4
0
7
Y
4
1
0
W
4
1
3
K
4
1
5
W
4
5
5
E
4
5
7
N
4
5
8
L
4
5
9
L
5
0
7
E
5
0
9
W
5
1
1
I
5
4
2
D
5
6
2
A
5
6
3
C
5
6
4
E
5
6
5
G
5
6
6
D
5
6
7
S
5
6
8
V
5
8
8
S
5
8
9
W
5
9
0
G
5
9
1
E
5
9
2
G
5
9
3
C
5
9
4
R
5
9
6
Y
6
0
0
G
6
0
1
F
6
0
2
Y
6
0
3
[1]2cf9.h 348 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zgi.a 382 32 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bvr.h 4cp 27 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bvx.h 5cb 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jwt.a bli 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxu.h c1d 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxt.h c2d 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2anm.h cdo 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2cf8.h esh 32 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2cn0.h f25 32 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2v3h.h i25 31 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2v3o.h i26 32 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1z71.a l17 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2ank.h n12 34 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4udw.h n6l 28 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1bhx.a r56 31 - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1vzq.h shy 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zrb.a 062 35 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1nt1.a t76 35 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zgv.a 501 24 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1nm6.a l86 36 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5afz.h uet 36 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bdy.a unb 36 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sl3.a 170 37 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ufe.h 3zd 37 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uff.h 6v2 37 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3c1k.a t15 38 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ufg.h d6j 39 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ax9.h n5n 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5a2m.h wx5 39 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1g37.a 110 40 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[1]4loy.h 6xs 39 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5af9.h sjr 17 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lxb.h 7r9 42 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ahg.h y4l 14 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1eoj.a bbsRcpi.tih.doa 56 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5afy.h wce 10 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bvs.h 2ce 37 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ud9.h fqi 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1eol.a bbsRcpi.nle.doa 54 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1d6w.a 00r 37 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1d9i.a 00p 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1doj.a 1z0 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[1]1eb1.h zalPmmo 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h8d.h phw 53 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h8i.h phv 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[1]1nu9.a 0zj,hg,hg,TFD 62 . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[1]1ta2.a 176 34 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ta6.a 177 33 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1w7g.h miu 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1xm1.a gah 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hpq.h 0g7 30 . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3nxp.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3qlp.h 0g6 30 . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[3]3sqe.e none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
[1]4nze.h 2oj 59 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rko.b 0g6 30 . . . . * . . . . . . . . . . - . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
[1]4rn6.a 15u 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
[1]4ue7.h mrz 9 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ueh.h ben 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ufd.h s49 39 . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[4]5edm.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
Similar entries
Feedback