THRB_BOVIN_367_518

Prothrombin [Peptidase S1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (THRB_BOVIN):D: Peptidase S1 (391:394,409,410,413,415,416,418,458:462,514,518,544,545,565:571,591:597,599,604)
R: High affinity receptor-binding region which is also known as the TP508 peptide (565:571)
391:394,409,410,413,415,416,418,458:462,514,518,544,545,565:571,591:597,599,604

Full PDB list

1a0h,1avg,1bbr,1etr,1ets,1ett,1hrt,1id5,1mkw,1mkx,1tbq,1tbr,1toc,1ucy,1uvt,1uvu,1vit,1ycp,2a1d,2ody,3pma,3pmb (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
E
3
9
1
L
3
9
2
L
3
9
3
C
3
9
4
H
4
0
9
C
4
1
0
Y
4
1
3
P
4
1
5
W
4
1
6
K
4
1
8
W
4
5
8
K
4
5
9
E
4
6
0
N
4
6
1
L
4
6
2
W
5
1
4
V
5
1
8
R
5
4
4
I
5
4
5
D
5
6
5
A
5
6
6
C
5
6
7
E
5
6
8
G
5
6
9
D
5
7
0
S
5
7
1
V
5
9
1
S
5
9
2
W
5
9
3
G
5
9
4
E
5
9
5
G
5
9
6
C
5
9
7
R
5
9
9
G
6
0
4
[1]1uvu.h dch 20 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1uvt.h i48 27 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1avg.h none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1bbr.k aceDFLAEGGGVR 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1etr.h mit 35 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ets.h mid 37 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ett.h 0zg 30 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hrt.h VVY-L-VCGQ 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1id5.h CNLHRLGG-PVSTRMAC-TAY 140 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tbq.k EPCACPHAL 60 . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tbr.h EPCACPHAL-S 64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1toc.b SLNVLCNNP-V 73 . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ucy.h aceDFLAEGGGVopr-PR 97 . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
[1]1ucy.k aceDFLAEGGGVopr-P 85 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1vit.h H 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ycp.h Y-GVRGP 45 . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2a1d.b 0g6 30 . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[1]2ody.b QRNGFCRL-PER 91 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2ody.d QRNGFCRL-P 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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