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SRC_HUMAN_253_536

Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src [Protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. SRC subfamily]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (SRC_HUMAN):D: Protein kinase (274:284, 286, 296:300, 305, 307:317, 320, 325:328, 331, 337, 339:348, 350, 351, 357, 377, 380, 385:389, 391:396, 405:414, 419, 423, 426:429, 431, 442, 447)274:284, 286, 296:300, 305, 307:317, 320, 325:328, 331, 337, 339:348, 350, 351, 357, 377, 380, 385:389, 391:396, 405:414, 419, 423, 426:429, 431, 442, 447

Full PDB list

1fmk, 1ksw, 1y57, 1yi6, 1yoj, 1yol, 1yom, 2bdf, 2bdj, 2h8h, 2hwo, 2hwp, 2oiq, 2ptk, 2qi8, 2qlq, 2qq7, 2src, 3d7t, 3dqw, 3dqx, 3el7, 3el8, 3en4, 3en5, 3en6, 3en7, 3f3t, 3f3u, 3f3v, 3f3w, 3f6x, 3g5d, 3g6g, 3g6h, 3geq, 3lok, 3oez, 3of0, 3qlf, 3qlg, 3svv, 3tz7, 3tz8, 3tz9, 3u4w, 3u51, 3uqf, 3uqg, 4agw, 4dgg, 4fic, 4k11, 4lgg, 4lgh, 4mcv, 4mxo, 4mxx, 4mxy, 4mxz, 4o2p, 4u5j, 4ybj, 4ybk, 5bmm, 5d10, 5d11, 5d12, 5j5s, 5k9i, 5swh, 5sys, 5t0p, 5teh, 5xp7 (redundant Pocketome entry)

Pocket contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1
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[1]1y57.a mpz36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yi6.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yoj.b none - - - - - - - - - - - - - - V T A I T L . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]1yom.b p0127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . .
[1]2bdf.a 24a33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bdj.a het34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hwo.a rbs22 . . - . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - .
[1]2hwp.a djk23 . . . . . - . . . . . . . - - . - . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . .
[1]2oiq.a sti37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]2qi8.a none . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]2qlq.a sr227 . . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]2qq7.a sr227 . . . . - . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]3dqw.c ags,mg32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3dqx.b amp23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3el7.a pd336 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - .
[1]3el8.a pd533 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3el8.b none . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3en4.b ks124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3en5.b ks424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - .
[1]3en6.b ks523 . . . - - . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - -
[1]3en7.a abj20 . . . - - - . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]3f3t.a 1au,1au60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3f3t.b none . . . - - - . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3f3u.a 1aw,1aw52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3f3u.b 1aw26 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3f3v.a 1bu38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3f3w.a 1bu38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3f6x.c ihh29 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3g5d.a 1n133 . . . . - - - . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3g6g.b g6g46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . .
[1]3g6h.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3g6h.b g6h46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - .
[1]3geq.b pp221 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - .
[1]3lok.a djk23 . . - - - . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]3oez.a sti37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3of0.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]3qlf.a pd533 . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . .
[1]3qlf.b pd533 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A R - - . .
[1]3qlg.b 1n133 . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3svv.a vsp26 . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]3tz7.a aqb46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]3tz8.b aqm49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3tz9.a aqu37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]3u51.a 08x54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]3uqf.a bk526 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]3uqg.a b5a17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - .
[1]4agw.a ng743 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]4dgg.b i7632 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]4fic.a 0ul16 . . . - - - . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]4lgg.b vgg22 . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]4lgh.a 0jn25 . . . . - - . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - .
[1]4mcv.b 29k33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mxo.a db836 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mxx.a db836 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
[1]4mxy.a db836 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o2p.b 11v34 . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4u5j.a rxt23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ybj.b 4a944 . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]5d10.b 56332 . . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - .
[1]5d11.b 56g32 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]5d12.a g9727 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5k9i.a o4437 . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]5swh.a 71d31 . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - .
[1]5sys.b 72f43 . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - .
[1]5t0p.a 73a31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - .
[1]5teh.a s5637 . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . .
[1]5xp7.b 8c6,mg29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1fmk.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[2]1ksw.a nbs34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2h8h.a h8h38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2src.a anp31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4k11.a 0j924 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4ybk.a 4b735 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[2]5bmm.a fum.alc.pff.ppn.orn52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]1yoj.a none . . . . - - . . . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - .
[3]1yol.a s0332 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - .
[4]3d7t.b stu35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[5]5j5s.a 6g337 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - .
[6]3u4w.a 08l52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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D
3
8
9
R
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1
A
3
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2
A
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N
3
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5
L
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V
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6
D
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7
F
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9
L
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1
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8
I
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9
W
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3
1
F
4
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2
D
4
4
7
[1]1y57.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . . . . . . . . . .
[1]1yi6.b . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . * . . . . . . . .
[1]1yoj.b - - - - - - - - - - - - - - - - - V L . V T R V A I K T L . . . . . . . . . * . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]1yom.b . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . N . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . * * - - - - - - - - - . . . . . .
[1]2bdf.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]2bdj.a . . * . * * . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]2hwo.a . . . . - . . . . . . . . . * . . - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * - - - - - - - - - . . . . .
[1]2hwp.a . . . . * * . - . . . . . . . . - - - - - . . . - * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * - - - - - - - - - . . . . . .
[1]2oiq.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - . . . . . . .
[1]2qi8.a . . * . * . . . . . . . . . * . . - - . . * * . * * . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . - - - - - . . . . .
[1]2qlq.a . . * * . * . . . . * . . . * . . - - - - - - - - . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]2qq7.a . . * . * . - * . . . . . . * . . - - - - - - . * * . . . . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . - - - - - . . . . .
[1]3dqw.c . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . * . . . . . . . .
[1]3dqx.b . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . . - . . . . . . . .
[1]3el7.a . . * . * . - - . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - - - . . . . .
[1]3el8.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]3el8.b . . . . . . . . . . . . . . * . . - . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]3en4.b . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . - - - . . . . . . .
[1]3en5.b . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . * . . . . * . . . . . * * * * - - - - - - - - . . . . .
[1]3en6.b . . . . . - - . . . . . . . * . . - - - - - - - - . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - - - . . . .
[1]3en7.a . . . . . - - - . . . . . . * . . - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]3f3t.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3f3t.b . . . . . - - - . . . . . . * . . - . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]3f3u.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3f3u.b . . * . . . . . . . . . . . * . . - . . . . . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3f3v.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . * * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3f3w.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . * * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3f6x.c . . * . * . . . . . . . . . * . . - . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * . * . . . - - . . . . . . .
[1]3g5d.a . . * . . . - - - . * . . . * . . - . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]3g6g.b . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * - - - - - - - - . . . . . . .
[1]3g6h.a . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - . . . . . . .
[1]3g6h.b . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * * . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . M . . * . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - - . . . . .
[1]3geq.b . . * . * * . . . . * . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . A . . . . . . . * * * * * . . . - - - - . . . . .
[1]3lok.a . . . . - - - . . . . . . . . . . - - - - - - - . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * * * . . - - - - - . . . . .
[1]3oez.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * * . . . I . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3of0.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * * . . * I . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]3qlf.a . . . . * . . . . . . . . . * . . - - - - - . . * . . . * I . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - . . . . . .
[1]3qlf.b . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * A R - - - - - - - . . . . . .
[1]3qlg.b . . * . * . . . . . . . . . * . - . . . . * . . * * . . * I . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]3svv.a . . * . . . - . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . C . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * . * . . - - - - - - . . . . .
[1]3tz7.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]3tz8.b . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . * * * * - - - - - - . . . . . . .
[1]3tz9.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . C . . M . . * . . . . . . . . . . . . * * * * - - - - - - - . . . . . .
[1]3u51.a . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * . - - - - - - - - . . . . . .
[1]3uqf.a . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * - - - - - - - . . . . .
[1]3uqg.a . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * . . . - - - - . . . . .
[1]4agw.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]4dgg.b . . . . . . . * . . . . . . * . . - - - . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * . * * . . - - - - . . . . . .
[1]4fic.a . . . . . - - - . . . . . . . . . - - - - - . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]4lgg.b . . * . - - - - . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . . . . . . . . - . . G . . . . . . . . . M . . . . . * . . . . . . . . . . * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]4lgh.a . . * . . . - - . . . . . . * . . - - - - - - - . * . . * . . . . . . . . . G . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - - . . . . .
[1]4mcv.b . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . G . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * . * * . . . - - . . . . . . .
[1]4mxo.a . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]4mxx.a . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]4mxy.a . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . L . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . * . . . - - - . . . . . .
[1]4o2p.b . . . . * . - . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]4u5j.a . . * . * * . . . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - . . . . . . .
[1]4ybj.b . . * . * . * . . . * . . . . . - . . . . * . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . * . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]5d10.b . . . . . * . * . . . . . . * . . - - - - - - - - * . . * . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * . . - - - - - - - - . . . . .
[1]5d11.b . . . . . . . * . . . . . . * . . - - - - * . . * * . . * . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . - - - - . . . . . .
[1]5d12.a . . . . . * . . . . . . . . . . . - . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . M . . . . . . C . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[1]5k9i.a . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . . * * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]5swh.a . . * . . . . . . . C . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . * * * . - - - - - - - - - . . . . .
[1]5sys.b . . . . . . . * . . C . . . * . . . . . . . . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - . . . . .
[1]5t0p.a . . * . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . C * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . * . . . . * * * * * * . . . - - - - . . . . .
[1]5teh.a . . . . . . . * . . C . . . * . . . . . . * . . * . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * - - - - - - - - . . . . . .
[1]5xp7.b . . * . * * . . . . * . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . - - - . . . . . .
[2]1fmk.a . . * . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * * * * * . * * . . . * * * * * . . - - - - - . * . . . .
[2]1ksw.a . . . . * * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . * * * . * * . . . . . . . * * * * . . . . . . . . * . . . .
[2]2h8h.a . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * * * * * . * . . . . * * * * * * . . . . . . . * . . . .
[2]2src.a . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * * * * . . * . . . . . * * * * * . . . . . . . * . . . .
[2]4k11.a . . * . * * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . * * * * . . * . . . . . * * * * . . . . . . . . * . . . .
[2]4ybk.a . . . . . * . . . . * . . . * . * * . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . M . . . . * * . . . * . . . . . * * * * . . . - - - . . . . . . .
[2]5bmm.a . . * . * * . . . . * . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . M . . . . * . . . . * . . . . . * * * * . . . . . . . . * . . . .
[3]1yoj.a . . * . . . - - . . . . . . . . . - - - - - - - - - - - * . . . . . . . . . * . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - - - - - - . . . . .
[3]1yol.a . . * . . . - - . . . . . . . . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * - - - - - - - - - - - . . . . .
[4]3d7t.b . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . * * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . * * * * * . . . . - - * . . . . . .
[5]5j5s.a . . * . * * * * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . . . . . . . * * - - - - - - - - - . . . . .
[6]3u4w.a . . * . * * * * * * * . . . * . * . . . . * . . . . . . * . . . . . . . * . * . . . . . . . . . M . . . . . . . . . . * . . . . * * * * . . . . * . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1y57.a:mpz
1yi6.b is apo
1yoj.b is apo
1yom.b:p01
2bdf.a:24a
2bdj.a:het
2hwo.a:rbs
2hwp.a:djk
2oiq.a:sti
2qi8.a is apo
2qlq.a:sr2
2qq7.a:sr2
3dqw.c:ags,mg
3dqx.b:amp
3el7.a:pd3
3el8.a:pd5
3el8.b is apo
3en4.b:ks1
3en5.b:ks4
3en6.b:ks5
3en7.a:abj
3f3t.a:1au
3f3t.b is apo
3f3u.a:1aw
3f3u.b:1aw
3f3v.a:1bu
3f3w.a:1bu
3f6x.c:ihh
3g5d.a:1n1
3g6g.b:g6g
3g6h.a is apo
3g6h.b:g6h
3geq.b:pp2
3lok.a:djk
3oez.a:sti
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[1] 3f6x.c 0.8 - - 0 0 0.7 0.2 2.1 11 - 1.3 1.1 0.1 0 7.7 6.5 - 0.5 1.0 0.9 0.4 12 - 13 12 11 12
0
0.9 9.2 - 9.1 0.4 0.5 11 - 6.5 6.1 0.8 1.6 12 12 12 1.9 2.7 0 11 7.3 0 1.0 1.3 2.5 1.6 1.7 1.5 1.3 0.1 7.6 0.6 0.7 0.1 0.1 1.1 10 0.8 6.0 0.2 - 1.3 0.9 0.1 0.6 3.9 2.2 - 0.3 0.7 6.7 1.5
[1] 3g5d.a 0.3 - - 0.1 0.1 0.3 0.4 1.0 10 - 0.2 0.1 0.1 0 5.5 5.7 - 0 0.1 0.2 0.2 9.6 - 9.9 8.9 9.3 10 0.2
0
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[1] 3g6g.b 0.4 - - 0.2 0.1 0.2 0.4 1.7 0.3 - 0.2 0.3 2.8 1.9 0.4 0.2 - 0.2 0.3 0.6 0.4 1.5 - 1.1 0.6 1.9 0.9 3.1 0
0.1
- 0.3 0 1.1 0.6 - 0.7 3.1 0 1.1 1.2 1.8 1.5 3.9 2.0 0.1 0.2 4.1 0 0.9 1.0 4.5 1.4 1.8 2.4 1.0 4.8 0.2 0.9 0.5 0.1 0.3 2.1 0.7 2.7 2.1 2.8 - 2.3 2.0 1.3 0.6 1.9 4.1 - 0 0.9 4.7 2.3
[1] 3g6h.a 1.4 - - 0.7 0.6 2.0 1.4 1.8 12 - 2.0 1.9 1.4 0.3 8.2 7.6 - 1.9 2.0 1.8 1.8 12 - 12 12 11 11 0.7 1.8 11
-
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[1] 3g6h.b 0.1 - - 0.3 0.2 0.2 0.5 1.4 2.4 - 0.2 0.3 4.7 1.6 0.2 0.1 - 0.3 0.5 0.3 0.4 0.7 - 1.1 0.5 1.3 0.7 2.3 0.3 2.1 -
0.1
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[1] 3geq.b 1.7 - - 0.1 0.1 0 0.1 1.7 10 - 0.2 0.5 0.1 0.1 5.9 5.3 - 0 0.2 0 0.1 12 - 12 9.7 10 11 0.7 0.2 8.2 - 6.6
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[1] 3lok.a 0.1 - - 0.3 0.2 0.5 0.4 0.6 8.7 - 0.4 0.7 0.3 0.1 5.8 5.0 - 0.2 0.3 0.3 0.2 9.3 - 9.2 8.7 9.7 9.9 0.7 0.4 7.9 - 7.4 0.3
0.5
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[1] 3oez.a 0.4 - - 0.2 0.2 0.1 0.7 1.5 0.1 - 0.1 0.5 5.4 1.7 0.5 0.5 - 0.7 0.9 1.1 0.9 1.2 - 0.7 0.6 1.8 0.6 3.4 0.1 0.2 - 0.7 0.3 1.1
0
- 1.0 3.9 0.1 1.5 0.9 1.3 1.7 9.0 2.2 0 0.2 4.3 0.1 1.1 1.3 4.8 2.1 2.2 3.1 1.2 4.3 0.4 0.9 0.2 0.1 0.6 2.4 0.3 2.7 2.5 3.9 - 3.1 2.4 4.7 1.3 1.7 7.4 - 0.3 0.8 4.7 6.6
[1] 3of0.a 0.2 - - 0.2 0.1 0.4 0.1 1.4 4.3 - 0.1 0.2 0.1 0 2.3 1.9 - 0.2 0.2 0.3 0.2 5.8 - 5.8 5.8 6.2 7.9 0.4 0.2 4.5 - 4.1 0.2 0.5 4.5
-
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[1] 3qlf.a 1.1 - - 0.1 0 0.2 0.2 1.6 5.8 - 0.2 0.2 0.1 0 0.9 0.5 - 0 0 0 0 3.4 - 3.6 2.4 4.0 4.2 0.1 0 5.4 - 2.2 0.1 0.3 5.6 -
0.1
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[1] 3qlf.b 0.1 - - 0.1 0.1 0.3 0.2 0.7 9.3 - 0.2 0.3 0.1 0 5.7 5.8 - 0 0 0.1 0 7.5 - 8.0 6.7 7.5 8.0 0.1 0.1 9.3 - 6.0 0 0.4 9.8 - 5.7
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[1] 3qlg.b 0.7 - - 0.1 0.1 0.3 0.1 1.6 10 - 0.2 0.1 0.7 0.1 5.9 6.0 - 0.1 0.2 0.3 0.2 9.5 - 9.9 10 9.3 9.7 0.5 0 9.7 - 6.2 0.1 0.4 10 - 6.2 3.7
0
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[1] 3svv.a 0.2 - - 0.2 0.1 0.4 0.1 2.5 8.4 - 0.2 0.4 0 0 3.8 3.5 - 0.1 0.3 0.4 0.2 6.7 - 6.4 6.4 7.0 7.4 1.0 0.5 8.2 - 5.6 0.3 0.3 8.4 - 3.8 5.0 0.5
0.4
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[1] 3tz7.a 0.2 - - 0.9 1.1 0.8 1.4 2.5 2.4 - 1.1 1.0 4.7 2.6 1.3 0.4 - 0.6 0.9 0.3 0.1 0.3 - 0.5 0.4 0.3 0.1 2.0 0.4 2.5 - 0.5 1.0 2.0 2.2 - 1.1 5.1 0.4 2.0
0.1
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[1] 3tz8.b 0.9 - - 1.0 1.2 0.9 1.5 2.5 2.4 - 1.0 0.9 5.0 2.4 1.5 0.5 - 0.6 0.8 0.3 0.2 0.6 - 0.5 0.3 0.2 0.3 2.7 0.1 2.7 - 0.5 0.9 2.1 2.4 - 0.7 5.3 0.2 1.6 0.2
0.2
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[1] 3tz9.a 0.1 - - 0.6 0.5 0.5 0.8 1.5 2.1 - 0.7 0.7 4.7 1.5 0.8 0.3 - 0.1 0.7 0.2 0.1 0.3 - 0.3 0.3 0.2 0.1 2.0 0.3 2.4 - 0.2 0.4 1.5 2.2 - 0.8 4.8 0.3 1.5 0.1 0
0.1
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[1] 3u51.a 1.9 - - 0.8 0.6 2.5 1.5 1.9 7.1 - 2.5 2.8 0.2 0.3 5.4 4.9 - 2.5 2.5 2.7 2.6 10 - 9.8 7.5 9.4 9.1 2.2 2.0 6.5 - 8.2 2.1 2.0 7.2 - 4.2 5.7 1.8 2.4 8.0 9.1 9.6
0
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[1] 3uqf.a 0.1 - - 0.2 0.1 0.5 0.2 0.6 8.4 - 0.2 0.4 0.2 0.1 4.0 3.2 - 0 0 0.2 0.1 7.3 - 7.5 7.2 6.8 8.4 0.4 0.1 8.4 - 5.6 0.2 0.3 8.5 - 3.0 2.5 0 1.2 7.9 8.4 8.2 3.2
0
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[1] 3uqg.a 0.5 - - 0.2 0.2 1.5 0.6 2.3 10 - 1.7 1.6 0.6 0 7.0 5.8 - 1.4 1.7 1.6 1.5 12 - 11 9.9 9.6 11 0.6 1.1 9.2 - 7.9 0.7 0.9 11 - 5.9 4.8 1.1 2.0 9.1 9.7 11 2.6 2.7
0
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[1] 4agw.a 1.1 - - 0.2 0.3 0.6 1.0 2.9 1.3 - 0.3 1.2 4.1 2.5 0.6 0.2 - 0.6 0.8 1.4 1.4 3.5 - 3.5 2.8 4.2 3.7 4.2 0.3 0.9 - 1.6 0.4 1.0 1.4 - 0.8 3.3 0.2 1.7 4.5 4.3 4.5 5.5 1.2 0.3
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[1] 4fic.a 0 - - 0 0 0.3 0.2 0.7 5.5 - 0.1 0.4 0 0 5.6 4.5 - 0.1 0.1 0.1 0.3 9.8 - 9.3 9.3 10 11 0.7 0 5.1 - 6.6 0 0.4 6.6 - 3.8 0.3 0 1.3 10 10 12 0.8 0.3 0 6.3 0.9
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[1] 4lgg.b 0.1 - - 0.2 0 0.8 0.2 1.9 7.1 - 1.1 0.8 0.1 0 6.2 5.2 - 0.1 1.1 0.4 0.2 8.0 - 7.8 8.3 8.1 8.3 0.3 0.3 6.2 - 7.9 0 0.2 7.0 - 5.4 4.6 0.3 0.5 8.6 8.0 8.4 2.1 1.1 0 8.0 7.1 0.2
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[1] 4mxo.a 0 - - 0 0 0.1 0.1 1.0 10 - 0.2 0 0 0.1 5.6 4.8 - 0 0.2 0 0 8.7 - 8.5 8.7 9.0 10 0.2 0.2 8.9 - 6.9 0.1 0.3 10 - 5.2 4.3 0.2 1.2 9.9 9.3 9.8 2.6 1.0 0 11 5.2 0 0.9 1.3 1.8
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[1] 4mxx.a 0.1 - - 0 0 0.3 0 0.6 9.3 - 0.1 0.1 0.6 0 5.1 4.4 - 0 0 0.1 0 9.7 - 10 8.6 9.0 9.4 0.1 0.6 9.1 - 6.2 0.2 0.2 9.1 - 5.2 3.3 0.6 1.5 9.7 8.9 9.5 3.3 0.7 0 11 4.4 0 1.1 1.3 1.7 0.1
0
0.2 0.5 0 5.3 0.1 0 0.1 2.0 0.9 6.6 0.1 2.6 1.0 - 1.5 0.3 0.3 0.8 2.4 3.8 - 0.2 0 4.6 3.0
[1] 4mxy.a 0.1 - - 0 0 0.2 0.2 1.0 8.9 - 0.3 0.3 1.0 0 5.5 4.6 - 0.1 0.1 0.1 0 11 - 10 9.7 9.9 11 0.1 0.3 8.6 - 8.0 0.3 0.2 8.5 - 4.7 3.0 0.4 1.6 10 11 11 4.3 0.8 0 9.6 4.8 0 1.8 2.0 1.7 0.3 0.2
0.1
0.4 0 6.0 0.1 0.3 0.1 2.0 1.0 7.8 0.3 3.4 1.4 - 1.1 0 0.4 0.6 3.0 3.7 - 0.4 0.2 4.9 1.7
[1] 4o2p.b 0.4 - - 0.4 0.1 0.4 0.2 1.4 11 - 0.4 0.3 0.2 0.1 5.9 6.1 - 0 0.4 0.1 0.1 9.3 - 10 9.1 9.2 10 0.1 0 9.5 - 7.0 0.1 0.5 10 - 6.3 4.3 0 1.1 10 9.6 10 2.3 0.9 0 12 5.4 0.1 0.9 1.0 1.9 0.6 0.2 0.7
0.1
0 6.8 0.1 0.3 0.2 0.1 0.5 7.9 0 3.6 0.1 - 1.4 0.3 0.3 0.5 2.8 3.4 - 0.1 0.1 5.4 2.3
[1] 4u5j.a 1.2 - - 0.2 0.1 1.1 0.3 2.0 11 - 0.7 1.1 0.1 0 7.4 6.1 - 0.7 0.9 1.0 0.7 13 - 13 11 10 12 0 1.1 10 - 8.7 0.6 0.5 11 - 6.1 5.7 0.9 1.7 11 12 12 1.4 1.9 0 11 6.2 0 1.0 1.7 2.0 1.7 1.7 1.3 1.8
0
7.2 0.2 0.8 0.2 0.3 1.3 9.3 0.7 4.4 0.1 - 1.3 0.8 0.3 0.7 2.7 2.0 - 0.8 0.1 6.7 1.7
[1] 4ybj.b 2.4 - - 0.9 0.8 0.4 0.6 1.7 3.1 - 0.7 0.2 5.4 2.5 0.9 0.5 - 0.2 0.4 0.2 0.3 1.2 - 2.1 0.9 1.6 1.0 3.6 0 3.0 - 0.9 0.7 1.1 3.1 - 0.4 4.0 0 1.4 1.6 1.7 1.3 5.5 1.4 0.7 2.2 3.9 0 1.5 1.7 4.6 0.9 1.1 1.6 2.6 4.5
0
1.9 0.8 1.2 1.4 4.0 1.7 3.9 3.2 4.6 - 4.4 2.1 4.1 1.1 1.8 5.2 - 0.5 1.8 5.1 4.1
[1] 5d10.b 0.4 - - 0.5 0 1.1 0.5 0.5 5.8 - 0.7 0.4 0.2 0 4.7 4.0 - 0.4 0.6 0.4 0.3 9.0 - 8.9 7.3 7.7 8.5 0.2 0.7 5.7 - 6.6 0.5 0.9 5.7 - 3.3 1.3 0.5 1.9 8.2 8.6 8.5 3.6 0.4 0 7.0 1.6 0.1 2.0 2.5 2.1 0.4 0.3 0.7 1.1 0.1 5.2
0
1.0 0.1 0.5 0.9 6.5 0.5 1.3 0.1 - 1.7 0.4 0 1.3 2.2 2.4 - 0.5 0 1.7 0.7
[1] 5d11.b 0.3 - - 0.3 0 1.8 0.7 2.6 12 - 1.7 1.0 1.1 0.3 7.5 6.7 - 1.3 1.6 1.6 0.8 13 - 12 12 10 12 0.9 1.3 10 - 10 1.1 0.8 12 - 6.9 5.7 1.3 2.4 11 11 12 5.0 2.8 0 12 7.6 0.2 1.8 2.3 2.5 2.6 2.5 2.7 1.3 1.0 7.7 1.2
0.6
0.3 3.4 3.2 9.9 1.1 4.9 2.2 - 1.6 1.2 1.4 0.9 4.6 3.6 - 0.7 0.7 6.7 2.9
[1] 5d12.a 1.6 - - 0.6 0.4 0.8 0.9 0.5 9.9 - 1.1 0.6 0.4 0.3 6.5 6.2 - 0.4 0.9 0.5 0.2 9.9 - 9.4 9.1 8.6 8.8 0.3 1.2 8.4 - 6.3 0.6 1.4 11 - 6.8 4.0 1.1 1.5 9.2 8.5 8.9 1.4 1.6 0.1 11 6.6 0.1 1.8 2.1 2.4 0.7 0.6 1.2 1.4 0.1 6.5 0.1 1.2
0.1
0.7 0.8 6.9 0.5 3.8 0.5 - 1.9 0.4 0.3 1.3 4.2 1.2 - 0.8 0.2 6.4 1.3
[1] 5k9i.a 0.9 - - 0 0 0.2 0.2 0.7 7.6 - 0.2 0.8 0.3 0 4.9 4.2 - 0 0.1 0.3 0.2 11 - 12 9.3 10 10 1.1 0.3 5.8 - 6.5 0 0.3 7.7 - 4.3 0.9 0.3 0.2 11 10 11 2.5 0.8 0 6.0 2.0 0 0.9 1.1 3.3 1.2 1.1 0.9 0.6 0.7 5.0 0.4 0.3 0.1
0.7
0.6 8.0 0 3.2 0.8 - 1.2 0.4 0.1 0.3 0.7 2.4 - 0.4 0.2 1.2 1.7
[1] 5swh.a 0.2 - - 0.2 0.1 0.4 0.1 1.1 6.3 - 0.2 0.2 0.1 0.1 4.9 5.2 - 0.1 0 0 0.1 7.8 - 7.7 7.0 7.6 7.6 0 0.1 6.2 - 5.9 0 0.2 5.8 - 5.1 2.0 0.1 1.1 7.5 7.0 8.0 2.1 0.2 0 6.2 3.9 0 0.9 0.9 1.5 0.3 0.1 0.2 0.6 0 5.0 0.1 0.4 0.1 0.2
0.3
6.7 0.1 1.0 0.1 - 1.2 0.2 0.1 0.3 1.7 2.9 - 0.2 0.1 2.8 1.9
[1] 5sys.b 0.2 - - 0.3 0.1 0.1 0.4 1.4 0.2 - 0.1 0.5 5.1 1.8 0.2 0.1 - 0.3 0.4 0.5 0.6 1.1 - 1.0 0.4 1.1 0.3 2.7 0.1 0.2 - 0.3 0.1 0.9 0.3 - 0.6 3.7 0.1 1.5 1.0 0.7 1.2 8.0 1.5 0 0.2 4.3 0 1.4 1.2 4.7 1.6 1.8 2.2 0.8 3.8 0.2 0.7 0 0 2.6 2.5
0.3
1.9 2.5 3.8 - 2.3 2.0 3.4 0.6 1.6 7.2 - 0.1 0.3 4.5 4.9
[1] 5t0p.a 0.4 - - 0.2 0.1 0.5 0.2 2.2 8.8 - 0.1 0.4 1.2 0.4 5.3 4.5 - 0 0.1 0.1 0.3 9.0 - 8.6 8.5 9.4 8.7 1.4 0 7.7 - 5.3 0 0.4 8.6 - 5.0 5.4 0.1 1.2 10 9.5 9.3 4.7 1.5 0 8.8 4.4 0 0.9 1.0 3.7 1.0 1.1 0.8 0.6 0.6 4.4 0.8 0.4 0.1 2.8 1.4 7.1
0
2.6 2.1 - 1.0 0.7 0.7 0.4 1.7 3.8 - 0 0.2 7.0 2.5
[1] 5teh.a 0.4 - - 0.9 0.4 0.8 0 0 7.7 - 0.1 0.1 0.6 0.4 4.7 4.3 - 0.3 0.6 0.3 0.4 7.7 - 8.1 5.3 4.5 4.9 0.4 0.3 7.6 - 5.0 0.1 0.5 6.9 - 4.7 3.2 0.3 1.4 5.0 5.3 5.1 4.4 1.0 0.3 8.1 3.2 0.3 1.2 1.4 1.4 0.6 0.3 0.5 0.7 0.1 4.6 0.4 0.1 0.6 2.7 1.4 4.8 0.2
0.6
0.7 - 1.8 1.1 1.4 1.1 2.3 4.1 - 0.2 0.4 4.4 3.3
[1] 5xp7.b 3.3 - - 0.3 0.4 0.2 0.2 1.3 9.7 - 0 0.3 0.4 0 5.8 5.4 - 0 0.3 0 0.1 13 - 13 9.8 10 11 0 0 8.3 - 6.9 0 0.3 9.7 - 5.4 3.6 0 1.2 11 11 11 3.3 1.1 0 10 4.9 0 0.9 1.1 1.5 0.4 0.3 0.3 0.9 0.4 6.7 0.8 0.9 0.5 1.4 1.1 7.8 0.5 3.8
0.1
- 1.3 0.2 0.6 0.4 1.9 5.1 - 0.3 0.6 4.9 3.6
[2] 1fmk.a 1.9 - - 0.4 0 2.7 1.6 2.9 14 - 1.5 3.2 1.6 0.7 6.9 8.8 - 1.5 1.8 2.0 1.8 15 - 15 12 14 15 2.5 1.0 13 - 9.2 0.8 2.2 14 - 7.6 2.2 0.8 1.3 16 15 16 9.6 2.4 0.3 15 5.7 0.3 1.6 1.7 6.6 2.7 2.6 3.1 1.8 2.1 8.6 1.2 1.3 0.2 0.2 1.1 10 1.6 6.5 1.3
-
1.8 2.5 0.5 1.5 2.3 4.4 - 1.5 1.9 3.7 5.1
[2] 1ksw.a 3.2 - - 0.4 0.1 0.6 0 1.8 8.6 - 0.1 0.4 0.6 0.3 5.8 5.1 - 0 0.1 0.1 0 13 - 12 11 11 12 0.7 0.2 7.6 - 6.5 0.1 0.4 8.9 - 5.6 2.0 0.2 0.2 13 12 12 4.8 1.0 0 8.1 1.9 0 0.1 0.1 2.2 0.9 0.8 0.4 0.6 0.6 4.9 1.6 1.0 0.1 0.6 1.1 8.4 0.2 3.2 0.7 -
0.1
0.5 0.2 0.2 0.4 2.6 - 0.3 1.1 2.9 3.4
[2] 2h8h.a 0 - - 0 0 0.6 0.4 1.6 11 - 0.7 0.8 0.9 0.2 7.2 7.6 - 0 0.1 0 0.1 9.9 - 11 11 11 11 0.1 0.3 9.5 - 8.2 0 0.6 12 - 7.4 2.4 0.2 0.7 11 11 11 7.2 0.9 0.1 9.5 2.9 0 0.7 0.8 3.1 0.1 0.1 0.3 0.6 0.8 6.5 0.3 1.0 0.1 0.3 0.7 8.9 0.1 3.8 0.5 - 0.9
0
0.3 0.3 1.0 4.2 - 0.3 0.5 2.4 4.7
[2] 2src.a 0.9 - - 0.2 0 1.6 0.2 1.9 11 - 0.8 1.2 0.6 0 7.2 7.0 - 0.2 0.7 0.7 0.3 13 - 14 11 12 13 1.2 0.5 9.0 - 7.5 0.1 0.3 12 - 6.7 1.9 0.5 0.6 13 13 13 5.9 1.4 0.1 10 2.7 0.2 1.1 1.3 4.1 1.2 1.3 1.4 0.8 0.5 6.4 0.7 0.4 0.2 0.4 0.6 9.1 0.2 4.1 0.3 - 1.4 0.6
0
0.5 0.7 2.0 - 0.3 0.5 2.3 3.9
[2] 4k11.a 1.4 - - 0.3 0 1.2 0.2 2.6 10 - 0.9 1.2 0.6 0 6.7 7.0 - 0.1 0.4 0.4 0.3 13 - 14 12 11 13 0.6 0.5 8.8 - 7.2 0 0.2 10 - 5.4 2.2 0.5 0.4 12 12 12 6.5 1.7 0 10 2.8 0.1 0 0.1 3.0 1.1 1.0 1.0 0.8 0.5 6.2 0.9 0.7 0.1 0.1 0.7 8.5 0.2 4.4 0.5 - 0.3 0.8 0
0
0.4 2.6 - 0.3 0.6 2.1 3.4
[2] 4ybk.a 2.3 - - 0.6 0.4 0.4 0.4 2.5 8.6 - 0.8 1.6 0.8 0.9 6.4 6.5 - 0.2 0.3 0.1 0.3 13 - 13 12 11 12 0.8 0.5 8.0 - 7.8 0 0.4 8.6 - 5.3 3.2 0.5 0.7 12 12 12 4.1 1.2 0.5 9.7 2.6 0.1 1.0 1.1 4.3 1.7 1.5 0.9 0.7 0.5 6.1 1.7 0.4 0.1 0.1 1.0 10 0.4 4.2 1.3 - 1.9 0.5 0.9 0.5
0
1.9 - 0.9 2.0 3.5 2.8
[2] 5bmm.a 4.6 - - 2.0 1.0 3.3 2.3 2.6 11 - 3.1 4.1 0.8 0.7 9.1 10 - 2.7 3.2 3.1 2.6 18 - 18 16 15 16 2.5 2.2 10 - 11 2.8 2.5 11 - 8.6 4.8 2.2 3.0 16 16 17 4.7 4.3 1.1 11 5.5 0.4 3.3 2.7 6.2 4.3 4.0 3.6 2.8 2.6 8.6 1.2 1.5 0.7 2.1 3.3 12 3.3 7.3 1.2 - 1.4 3.6 0.6 2.3 2.6
0
- 3.4 2.7 5.5 1.3
[3] 1yoj.a 0.1 - - 0.1 0.1 0.2 0 0 0.6 - 0.3 0.2 0.1 0 0.4 0.2 - 0 0.3 0.2 0.2 0.3 - 0.8 0.1 0.2 0 0.1 0.2 0.5 - 0.2 0.2 0.3 0.8 - 0.5 0.1 0.2 1.5 0.3 0.1 0 0.4 0 0 0.2 0.3 0.1 1.1 1.5 1.7 0.2 0.2 0.2 0.7 0.1 0.4 0 0.2 0.2 0.2 0.3 0.9 0 0.3 0 - 1.5 0.4 0 0.8 1.4 0.1
-
0.3 0 0.1 0.3
[3] 1yol.a 0.5 - - 0.1 0 0.5 0.2 1.7 2.2 - 0.5 0.1 0.2 0 1.2 0.7 - 0.3 0.8 0.4 0.1 2.1 - 2.5 1.5 2.4 2.4 0.8 0.4 1.1 - 2.0 0.1 0.4 2.5 - 1.3 4.7 0.2 1.5 2.4 2.2 3.0 1.2 1.7 0 1.2 5.5 0.1 1.0 1.1 2.6 1.2 1.3 1.4 1.0 0.9 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.4 2.0 0.1 3.7 0.3 - 1.0 0.2 0 0.3 2.5 0.5 -
0
0.2 5.9 0.5
[4] 3d7t.b 0.6 - - 0.1 0 2.0 0.1 0.6 9.6 - 2.3 0.3 0.6 0.4 3.4 3.6 - 0.7 1.7 0.8 0.1 6.9 - 8.0 6.2 6.4 6.2 1.0 1.2 8.5 - 5.9 0.8 0.4 9.9 - 4.3 6.4 1.1 2.1 5.6 6.5 6.4 6.1 1.7 0 8.9 5.1 0.2 1.1 1.6 2.2 0.8 1.5 2.1 1.7 1.4 4.1 0 0.4 0.1 2.1 0.8 5.9 0.8 3.3 1.7 - 1.8 0.4 0.7 1.0 3.6 3.4 - 0.3
0
8.0 3.5
[5] 5j5s.a 1.8 - - 0.1 0.1 0.4 0.2 0.6 5.5 - 0.2 0.3 6.3 1.9 2.8 2.0 - 0 0 0.2 0 10 - 9.4 4.9 5.9 6.6 0.6 0.1 5.3 - 4.0 0.2 0.4 5.5 - 1.5 0.2 0 1.0 5.6 5.8 5.6 9.5 0.1 0 6.2 0.4 0.1 0.9 0.8 2.2 0.6 0.7 0.7 0.6 1.9 2.2 2.5 0.3 0.2 6.2 4.9 5.4 0.7 2.7 4.8 - 2.4 0.5 4.4 0.5 1.3 8.2 - 0.1 1.5
0.2
4.8
[6] 3u4w.a 7.9 - - 2.0 1.1 2.6 2.0 3.4 10 - 1.6 2.8 1.3 1.1 5.1 5.4 - 2.3 2.8 2.5 3.0 16 - 15 12 14 14 2.6 2.6 10 - 8.6 2.1 2.3 11 - 4.7 5.7 2.4 3.0 14 14 15 5.9 4.0 0.8 8.0 5.7 0.5 3.9 3.8 5.2 4.7 4.2 4.5 3.3 2.4 5.6 0.8 2.4 0.6 2.3 2.8 8.6 2.6 5.8 1.0 - 2.3 3.5 0.7 3.3 2.2 4.2 - 3.0 2.8 6.7
0
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (6 clusters)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
1y57.a
1yi6.b
1yoj.b
1yom.b
2bdf.a
2bdj.a
2hwo.a
2hwp.a
2oiq.a
2qi8.a
2qlq.a
2qq7.a
3dqw.c
3dqx.b
3el7.a
3el8.a
3el8.b
3en4.b
3en5.b
3en6.b
3en7.a
3f3t.a
3f3t.b
3f3u.a
3f3u.b
3f3v.a
3f3w.a
3f6x.c
3g5d.a
3g6g.b
3g6h.a
3g6h.b
3geq.b
3lok.a
3oez.a
3of0.a
3qlf.a
3qlf.b
3qlg.b
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3tz8.b
3tz9.a
3u51.a
3uqf.a
3uqg.a
4agw.a
4dgg.b
4fic.a
4lgg.b
4lgh.a
4mcv.b
4mxo.a
4mxx.a
4mxy.a
4o2p.b
4u5j.a
4ybj.b
5d10.b
5d11.b
5d12.a
5k9i.a
5swh.a
5sys.b
5t0p.a
5teh.a
5xp7.b
1fmk.a
1ksw.a
2h8h.a
2src.a
4k11.a
4ybk.a
5bmm.a
1yoj.a
1yol.a
3d7t.b
5j5s.a
3u4w.a
[1] 1y57.a
0
.09 .31 .20 .09 .10 .22 .27 .17 .13 .27 .14 .10 .08 .14 .10 .08 .08 .23 .21 .22 .16 .08 .19 .12 .17 .19 .12 .07 .17 .09 .19 .09 .21 .17 .18 .21 .18 .09 .13 .17 .18 .17 .25 .13 .11 .19 .22 .21 .17 .23 .17 .08 .13 .13 .07 .10 .22 .23 .11 .12 .23 .18 .21 .12 .19 .14 .44 .35 .34 .37 .38 .34 .40 .33 .25 .30 .35 .40
[1] 1yi6.b .09
0
.34 .23 .06 .12 .24 .27 .19 .12 .26 .16 .11 .09 .17 .09 .12 .13 .22 .23 .25 .16 .12 .18 .13 .20 .19 .14 .11 .21 .13 .19 .13 .23 .18 .20 .22 .22 .13 .12 .20 .18 .17 .24 .14 .17 .22 .23 .25 .19 .26 .15 .14 .17 .15 .10 .11 .26 .24 .13 .12 .26 .22 .24 .15 .22 .16 .42 .31 .35 .34 .34 .30 .36 .35 .27 .29 .34 .37
[1] 1yoj.b .31 .34
0
.19 .33 .34 .20 .20 .25 .38 .22 .36 .36 .35 .24 .29 .31 .33 .22 .15 .17 .27 .33 .30 .28 .28 .27 .33 .33 .18 .33 .27 .36 .24 .24 .19 .18 .19 .32 .26 .24 .28 .29 .24 .26 .32 .22 .25 .19 .27 .17 .30 .31 .30