RXRA_HUMAN_222_461

Retinoic acid receptor RXR-alpha [Nuclear hormone receptor family. NR2 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (RXRA_HUMAN):R: Ligand-binding (265,268,269,271,272,275,276,305,306,309,310,313,316,324,326,327,330,342,345,346,349,432,433,435:439,442,443,451)265,268,269,271,272,275,276,305,306,309,310,313,316,324,326,327,330,342,345,346,349,432,433,435:439,442,443,451

Full PDB list

1dkf,1fby,1fm6,1fm9,1g1u,1g5y,1k74,1lbd,1mv9,1mvc,1mzn,1rdt,1xdk,1xls,1xv9,1xvp,2acl,2p1t,2p1u,2p1v,2zxz,2zy0,3a9e,3dzu,3dzy,3e00,3e94,3fal,3fc6,3fug,3h0a,3kwy,3nsp,3nsq,3oap,3ozj,3pcu,3r29,3r2a,3r5m,3uvv,4j5w,4j5x,4k4j,4k6i,4m8e,4m8h,4n5g,4n8r,4nqa,4oc7,4poh,4poj,4pp3,4pp5,4rfw,4rmc,4rmd,4rme,4zo1,4zsh,5ec9 (redundant pocketome entry)

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ligand
A1
V
2
6
5
I
2
6
8
C
2
6
9
A
2
7
1
A
2
7
2
Q
2
7
5
L
2
7
6
W
3
0
5
N
3
0
6
L
3
0
9
I
3
1
0
F
3
1
3
R
3
1
6
I
3
2
4
L
3
2
6
A
3
2
7
L
3
3
0
V
3
4
2
I
3
4
5
F
3
4
6
V
3
4
9
C
4
3
2
L
4
3
3
H
4
3
5
L
4
3
6
F
4
3
7
F
4
3
8
F
4
3
9
I
4
4
2
G
4
4
3
L
4
5
1
[1]3fug.a 2e3 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rmd.a 3sw 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rme.a 3t2 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p1t.a 3tn 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p1u.a 4tn 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ec9.a 5lo 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p1v.a 5tn 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3a9e.a 754 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[4]1dkf.a ola 20 . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1xvp.c f15 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4n8r.d k08 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4n5g.a k09 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1rdt.a l79 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3pcu.a lx8 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zxz.a p26 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rmc.a 3sv 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4m8e.a 29v 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4poj.a 2vp 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4poh.a 2vr 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4pp3.a 2vz 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4pp5.a 2w0 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rfw.a 3rb 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4m8h.a r4m 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k6i.a 9ra 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k4j.a 1o8 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ozj.a bgv 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4oc7.a 2qo 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j5x.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fm6.u 9cr 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3r5m.a mlo 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]3nsq.b chz 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3r2a.a rhn 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3uvv.b rea 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3fc6.c F,rea 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - .
[1]4zsh.a 4xw 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mv9.a hxa 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mzn.e bm6 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zy0.a 21p 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3e94.a tby 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[1]3kwy.a t9t 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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