RORG_HUMAN_262_504

Nuclear receptor ROR-gamma [Nuclear hormone receptor family. NR1 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (RORG_HUMAN):R: Ligand-binding (285:287,292,317,320,321,323,324,327,358,361,362,364,365,367:369,376:379,388,391,393,396,397,400,401,404,475,476,479,480,482,483,486,502)285:287,292,317,320,321,323,324,327,358,361,362,364,365,367:369,376:379,388,391,393,396,397,400,401,404,475,476,479,480,482,483,486,502

Full PDB list

3b0w,3kyt,3l0j,3l0l,4nb6,4nie,4qm0,4wlb,4wpf,4wqp,4xt9,4ymq,4ypq,4zjr,4zjw,4zom,5aph,5apj,5apk,5ayg,5c4o,5c4s,5c4t,5c4u,5ejv,5eth,5g42,5g43,5g44,5g45,5g46,5ixk,5iz0,5lwp (redundant pocketome entry)

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ligand
A1
C
2
8
5
Q
2
8
6
L
2
8
7
L
2
9
2
W
3
1
7
C
3
2
0
A
3
2
1
H
3
2
3
L
3
2
4
A
3
2
7
M
3
5
8
V
3
6
1
L
3
6
2
R
3
6
4
M
3
6
5
R
3
6
7
A
3
6
8
Y
3
6
9
V
3
7
6
F
3
7
7
F
3
7
8
E
3
7
9
F
3
8
8
L
3
9
1
C
3
9
3
L
3
9
6
I
3
9
7
I
4
0
0
F
4
0
1
S
4
0
4
L
4
7
5
C
4
7
6
H
4
7
9
V
4
8
0
R
4
8
2
L
4
8
3
F
4
8
6
Y
5
0
2
[3]4qm0.a 39k 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4wlb.a 3qq 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wpf.a 3sn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4wqp.b 3sx 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4xt9.a 43v 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5ayg.b 4lq 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[2]4zjw.a 4p1 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[3]4zjr.b 4p3 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[2]5ixk.a 6ew 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]5iz0.a 6f1 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4nie.a nbh 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aph.a vyi 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4zom.c 4q3 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]5eth.a 5rt 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]5apj.a 76e 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kyt.a hc2 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3l0l.a hc3 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3l0j.a hc9 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ymq.a zbd 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g44.a i6g,swx,ytz 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g42.a 4tu 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g46.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g43.a 5im 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g45.a a7w 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3b0w.b dgx 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]5ejv.b 444 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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