PPARG_HUMAN_229_505

Peroxisome proliferator-activated receptor gamma [Nuclear hormone receptor family. NR1 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (PPARG_HUMAN):R: Interaction with FAM120B (254,256)
R: Ligand-binding (317,320,323,324,351,354,355,357,358,361,362,367:371,376,381,384,388,391,392,395,477,480,481,484,491:493,497,501)
283,287,289:295,306:316
254,256,283,287,289:295,306:317,320,323,324,351,354,355,357,358,361,362,367:371,376,381,384,388,391,392,395,477,480,481,484,491:493,497,501

Full PDB list

1i7i,1k74,1knu,1nyx,1rdt,1wm0,1zeo,2ath,2f4b,2fvj,2g0g,2g0h,2gtk,2hfp,2hwq,2i4j,2om9,2p4y,2q59,2q5p,2q5s,2q61,2q6r,2q8s,2xkw,2yfe,2zk1,2zk3,2zk5,2zno,3adx,3b0q,3b1m,3bc5,3cds,3cwd,3dzu,3et3,3fej,3fur,3g9e,3h0a,3ho0,3hod,3ia6,3k8s,3kmg,3lmp,3pba,3qt0,3r8a,3r8i,3s9s,3t03,3ty0,3v9t,3vjh,3vji,3vn2,3vso,3vsp,3wmh,3x1h,3x1i,4a4v,4a4w,4ci5,4e4k,4f9m,4hee,4jl4,4pvu,4r06,4xuh,4y29,4yt1,5dsh,5dv3,5f9b,5hzc (redundant pocketome entry); 1fm6,1fm9,1prg,1zgy,2hwr,2i4p,2i4z,2pob,2prg,2q6s,2vsr,2vst,2vv0,2vv1,2vv2,2vv3,2vv4,2zk0,2zk2,2zk4,2zk6,2zvt,3ads,3adt,3adu,3adv,3adw,3an3,3an4,3b0r,3b3k,3cdp,3cs8,3d6d,3dzy,3e00,3et0,3gbk,3noa,3osi,3osw,3po9,3prg,3r5n,3sz1,3u9q,3v9v,3v9y,3wj4,3wj5,4e4q,4em9,4ema,4fgy,4jaz,4l96,4l98,4o8f,4oj4,4prg,4pwl,4r2u,4r6s,4xld,4xta,4xum,5azv,5dv6,5dv8,5dvc,5dwl (unprocessed)

Contact map

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ligand
A1
F
2
5
4
L
2
5
6
L
2
8
3
E
2
8
7
K
2
8
9
I
2
9
0
K
2
9
1
F
2
9
2
K
2
9
3
H
2
9
4
I
2
9
5
A
3
0
6
I
3
0
7
R
3
0
8
I
3
0
9
F
3
1
0
Q
3
1
1
G
3
1
2
C
3
1
3
Q
3
1
4
F
3
1
5
R
3
1
6
S
3
1
7
A
3
2
0
E
3
2
3
I
3
2
4
H
3
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1
I
3
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4
Y
3
5
5
M
3
5
7
L
3
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8
L
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1
M
3
6
2
V
3
6
7
L
3
6
8
I
3
6
9
S
3
7
0
E
3
7
1
M
3
7
6
L
3
8
1
L
3
8
4
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3
8
8
F
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1
M
3
9
2
K
3
9
5
H
4
7
7
L
4
8
0
L
4
8
1
I
4
8
4
M
4
9
1
S
4
9
2
L
4
9
3
L
4
9
7
Y
5
0
1
[1]2gtk.a 208 31 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r06.a 3e7 34 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2ath.a 3ea 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dsh.a 6bh 26 . . . . . - - - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2om9.a aja 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jl4.a axy 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[4]5dv3.a b05 26 . . . . . . . . . - - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zeo.a c01 31 . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ho0.a dkd 26 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1nyx.a drf 31 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3r8a.a hig 33 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3vjh.a j35 30 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1rdt.d 570 41 . . . - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q8s.a l92 31 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3s9s.a m0t 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3b0q.a mc5 27 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q5s.a nza 28 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q61.a sf1 27 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q6r.a sf2 29 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . - - - - - - . .
[1]2g0g.a sp0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ia6.a unt 31 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3r8i.a xcx 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4a4w.a yfb 30 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1knu.a ypa 30 . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3fur.a z12 31 . . . - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3k8s.a z27 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . .
[1]3t03.a 3t0 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2g0h.a sp3 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2yfe.a yfe 25 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3pba.a zxg 25 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3hod.a zzh 25 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i7i.a az2 28 . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y29.a cti 26 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3fej.a ctm 29 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3g9e.a ro7 31 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4e4k.a rrg,rrg 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ci5.a y1n 30 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3ty0.a 082 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3lmp.a cek 36 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xkw.a p1b 25 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cwd.a lna,lnb 46 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2zk3.a ocx 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3bc5.a zaa 37 . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3h0a.d d30 40 . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i4j.a drj 33 . . . . - - . I . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3et3.a et1 27 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4xuh.a sfi,sfi 48 . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q59.a 240 38 . . . . - - - - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q5p.a 241 38 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vso.a ek1 38 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vsp.a ek8 38 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vji.a j53 38 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wmh.a jja 38 . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3b1m.a krc 38 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4a4v.a yfd 22 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hzc.a 65w 23 . . . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zno.a s44 33 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hee.x 14r 39 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3v9t.a 17l 39 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . .
[3]3dzu.d plb 27 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3qt0.a 486 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kmg.a 538 39 . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hwq.a dry 39 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2f4b.a eha 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4f9m.a fcm 39 . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4yt1.a none . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vn2.a tls 39 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1k74.d 544 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3adx.a imn,nro 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zk5.a nro 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p4y.a c03 40 . . - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cds.a grr 20 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]2hfp.a nsi,nsi 80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2fvj.a ro0 40 . . . . . - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zk1.a ptg 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3x1h.a 5ox 26 . . . . . . - - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3x1i.a 66b 27 . . . . . . - - - - - . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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