PPARD_HUMAN_169_441

Peroxisome proliferator-activated receptor delta [Nuclear hormone receptor family. NR1 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (PPARD_HUMAN):R: Ligand-binding (256,259,287,290,291,293,294,297,298,303,305,312,316,317,324,327,328,331,332,413,417,429,433,437)
192,213,219,228,245,246,248:250,252,253
192,213,219,228,245,246,248:250,252,253,256,259,287,290,291,293,294,297,298,303,305,312,316,317,324,327,328,331,332,413,417,429,433,437

Full PDB list

1gwx,1y0s,2awh,2b50,2baw,2gwx,2j14,2q5g,2xyj,2xyw,2xyx,2znp,2znq,3d5f,3dy6,3et2,3gwx,3gz9,3oz0,3peq,3sp9,3tkm (redundant pocketome entry)

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ligand
A1
M
1
9
2
I
2
1
3
L
2
1
9
W
2
2
8
V
2
4
5
F
2
4
6
R
2
4
8
C
2
4
9
Q
2
5
0
T
2
5
2
T
2
5
3
T
2
5
6
E
2
5
9
H
2
8
7
I
2
9
0
F
2
9
1
M
2
9
3
L
2
9
4
I
2
9
7
V
2
9
8
L
3
0
3
V
3
0
5
V
3
1
2
F
3
1
6
L
3
1
7
F
3
2
4
I
3
2
7
I
3
2
8
K
3
3
1
F
3
3
2
H
4
1
3
M
4
1
7
L
4
2
9
L
4
3
3
Y
4
3
7
[1]2xyw.a 08s 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3oz0.a 3oz 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2znq.a 401 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3dy6.a dy6 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3tkm.a gw0 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2znp.b k55 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3d5f.a l41 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xyj.a wlm 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xyx.a z00 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1y0s.a 331 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2j14.b gni 35 . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3sp9.a il2 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gz9.a d32 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . L . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3et2.a et1 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3peq.a 3eq 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gwx.a 433 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2q5g.a 1fa 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . .
[1]3gwx.b epa 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2awh.a vca 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2gwx.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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