PPARA_HUMAN_197_468

Peroxisome proliferator-activated receptor alpha [Nuclear hormone receptor family. NR1 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (PPARA_HUMAN):R: Ligand-binding (280,283,314,317,318,321,330,332,333,337,339,344,347,351,354,355,358,359,440,444,447,448,454:456,460,464)
R: Required for heterodimerization with RXRA (314,317,318,321,330,332,333,337,339,344,347,351,354,355,358,359)
241,247,250,251,254:256,258,263,266,269,271:279
241,247,250,251,254:256,258,263,266,269,271:280,283,314,317,318,321,330,332,333,337,339,344,347,351,354,355,358,359,440,444,447,448,454:456,460,464

Full PDB list

1i7g,1k7l,1kkq,2npa,2p54,2rew,2znn,3et1,3fei,3g8i,3kdt,3kdu,3sp6,3vi8,4bcr,4ci4,5azt,5hyk

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ligand
A1
I
2
4
1
L
2
4
7
A
2
5
0
E
2
5
1
L
2
5
4
V
2
5
5
A
2
5
6
L
2
5
8
I
2
6
3
K
2
6
6
E
2
6
9
R
2
7
1
I
2
7
2
F
2
7
3
H
2
7
4
C
2
7
5
C
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6
Q
2
7
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C
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T
2
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9
S
2
8
0
T
2
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3
Y
3
1
4
I
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1
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F
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M
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0
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L
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I
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A
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L
4
5
6
L
4
6
0
Y
4
6
4
[1]2p54.a 735 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2npa.a mmb 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vi8.a 13m 35 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i7g.a az2 28 . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3fei.a ctm 29 . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3sp6.a il2 26 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3g8i.a ro7 31 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ci4.a y1n 30 . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3et1.b et1 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2rew.a rew 38 . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hyk.a 65w 23 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2znn.a s44 37 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1k7l.e 544 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4bcr.a wy1,wy1 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5azt.a 4m5 25 . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kkq.a 471 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kdt.b 7ha 31 . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kdu.b nks 37 . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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