PLK1_HUMAN_368_599

Serine/threonine-protein kinase PLK1 [Protein kinase superfamily. Ser/Thr protein kinase family. CDC5/Polo subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (PLK1_HUMAN):D: POLO box 1 (417,419,421,426,430,478)
R: Linker (493,495)
D: POLO box 2 (516,535,538,540,557)
R: Important for interaction with phosphorylated proteins (538,540)
412:416,481,482,485,487:492
412:417,419,421,426,430,478,481,482,485,487:493,495,516,535,538,540,557

Full PDB list

1q4k,1q4o,1umw,2ogq,2ojx,3bzi,3c5l,3fvh,3hih,3hik,3p2w,3p2z,3p34,3p35,3p36,3p37,3q1i,3rq7,4dfw,4e67,4e9c,4e9d,4h5x,4h71,4hab,4hco,4hy2,4lkl,4lkm,4o56,4o6w,4o9w,4rcp,4whh,4whk,4whl,4x9r,4x9v,4x9w,5dms,5dmv,5dnj,5j19 (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
S
4
1
2
K
4
1
3
W
4
1
4
V
4
1
5
D
4
1
6
Y
4
1
7
D
4
1
9
Y
4
2
1
Q
4
2
6
N
4
3
0
L
4
7
8
Y
4
8
1
F
4
8
2
Y
4
8
5
S
4
8
7
E
4
8
8
H
4
8
9
L
4
9
0
L
4
9
1
K
4
9
2
A
4
9
3
A
4
9
5
R
5
1
6
F
5
3
5
H
5
3
8
K
5
4
0
R
5
5
7
[1]5dnj.a 707.56aStpo.nh2 58 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4whk.a yac.56aStpo.nh2 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4e9d.a 0obDPPLHStpoA 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h71.a pxe 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hco.a imw 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hab.b 11qLHStpoMnh2 58 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4e67.a hciPLHStpoAnh2 58 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lkl.a acePLHStpoMnh2 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1q4k.b MQStpoPL 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]1q4o.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . .
[1]1umw.a PMQStpoPL 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2ojx.a LLCSTPN 50 . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - . . . . .
[1]3bzi.a LLCStpoPN 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3c5l.a PPHStpo 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3fvh.a aceLHStpoAnh2 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3hik.a acePLHStpo 46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p2z.a acePLHStpoAnh2 51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p34.a aceMQStpoPLnh2 53 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p35.a aceMQSsepPLnh2 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p36.a PPLHStpoAnh2 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p37.a aceFDPPLHStpoA 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3p37.b aceFDPPLHStpoAnh2 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3q1i.a PPPMSsepMnh2 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3rq7.a acePL56aStpo.nh2 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dfw.a ace.0lfLHStpo.nh2 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hy2.a 1c3LHStpoMnh2 64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o56.a GPMTStpoPK 59 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o6w.a acePL2soStpo.nh2 61 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o9w.a VLStpoLnh2 41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rcp.a ace.56aStpo.nh2 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4whh.a qac.56aStpo.nh2 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4whl.a kac.56aSyth.nh2 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x9r.a 4l0L56aStpo.nh2 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x9v.a 4kyL56aStpo.nh2 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x9w.a L3zhStpo.nh2 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dms.a KTStpoI 41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dms.c FSQHKTStpoI 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dmv.c LVTStpoIKT-DVV 85 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5j19.a AAFSStpoPK 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5j19.b NAAFSStpoPK 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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