NGAL_HUMAN_14_198

Neutrophil gelatinase-associated lipocalin [Calycin superfamily. Lipocalin family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (NGAL_HUMAN):53,56,60,61,69,72,74,86,88,90,92,97,99,101,103,114,120,123,126,143:145,147,152:154,156,15853,56,60,61,69,72,74,86,88,90,92,97,99,101,103,114,120,123,126,143:145,147,152:154,156,158
Metals (Me):Eu/Fe/Sm

Full PDB list

1dfv,1l6m,1qqs,1x71,1x89,1x8u,3by0,3cbc,3cmp,3dsz,3dtq,3fw4,3fw5,3hwd,3hwe,3hwf,3hwg,3i0a,3k3l,3pec,3ped,3t1d,3tf6,3tzs,3u03,3u0d,4k19,4zfx,4zhc,4zhd,4zhf,4zhg,4zhh,5jr8 (redundant pocketome entry)

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ligand
A1 Me
V
5
3
L
5
6
A
6
0
I
6
1
Q
6
9
Y
7
2
T
7
4
V
8
6
S
8
8
L
9
0
R
9
2
D
9
7
W
9
9
R
1
0
1
F
1
0
3
L
1
1
4
Y
1
2
0
L
1
2
3
Y
1
2
6
F
1
4
3
K
1
4
4
K
1
4
5
S
1
4
7
Y
1
5
2
F
1
5
3
K
1
5
4
T
1
5
6
Y
1
5
8
[1]3i0a.a 2ds,3et 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . Fe
[1]3i0a.b dbh 11 . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . Fe
[1]3i0a.c mcj 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . Fe
[1]3t1d.a td1 23 . . . . . . . . . . . . A A . . . . F . . . . . . . . .
[1]3t1d.b dbh,dbs 28 . . . . . . . . . . . . A A . . . . F . . . . . . . . .
[1]3t1d.c dbs 17 . . . . . . . . . . . . A A . . . . F . . . . . . . . .
[1]3u03.a 488 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3hwg.a qed 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3hwf.a tc2 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]4k19.c 1od 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3k3l.a dbh,dbh,dbs,na 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3k3l.c mck,na 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1x71.a db1,db1 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1x71.c db1 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3hwe.c rks,rks 59 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1l6m.a dbh,dbh,dbs 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1l6m.c dbh,dbs 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3cmp.a eb4,na 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . Fe
[1]3cmp.b dbh,dbh,na 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . Fe
[1]3cmp.c eb4,na,na 50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . Fe
[1]1qqs.a dka 12 . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zfx.a eb4,th 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3tzs.c phu 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zhc.a tc2,th 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3by0.a dbh,dbh,dbs 39 . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3by0.b dbh 11 . . . . . . . . . . - . A A . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3by0.c dbh,dbs,dbs 45 . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1x89.a cm1 53 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3tf6.a dbh 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eu
[1]1x8u.a cm2 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3u0d.a dbh,dbh,dbh 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3cbc.c dbs,na 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . F . . . . . . . . .
[2]3dsz.b liz,yt3 50 Q R . - . T Q . A R . . L M . . . . . . . . . . . S . L
[2]3dtq.c none Q R . A . T Q . A R . . A M . . . . . . . . . . . S . L
[1]3fw4.c caq 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3fw5.c mct 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3hwd.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . .
[1]3pec.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3pec.c zyg 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]3ped.b zyf 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]4zhd.c 4oz,4pu 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zhf.c 4ol,zcm 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zhg.c 4ol,am 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zhh.b 4ol 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sm
[1]5jr8.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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