NEK2_HUMAN_1_273

Serine/threonine-protein kinase Nek2 [Protein kinase superfamily. NEK Ser/Thr protein kinase family. NIMA subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (NEK2_HUMAN):D: Protein kinase (12,14:19,22,35,37,68,70,86:90,92,93,96,145,146,148,158:160,162:164,166)12,14:19,22,35,37,68,70,86:90,92,93,96,145,146,148,158:160,162:164,166

Full PDB list

2jav,2w5a,2w5b,2w5h,2wqo,2xk3,2xk4,2xk6,2xk7,2xk8,2xkc,2xkd,2xke,2xkf,2xnm,2xnn,2xno,2xnp,4a4x,4afe,5m51,5m53,5m55,5m57

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ligand
A1
Y
1
2
I
1
4
G
1
5
T
1
6
G
1
7
S
1
8
Y
1
9
C
2
2
V
3
5
K
3
7
V
6
8
Y
7
0
M
8
6
E
8
7
Y
8
8
C
8
9
E
9
0
G
9
2
D
9
3
S
9
6
A
1
4
5
N
1
4
6
F
1
4
8
G
1
5
8
D
1
5
9
F
1
6
0
L
1
6
2
A
1
6
3
R
1
6
4
L
1
6
6
[1]2xk7.a 30e 30 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]2xnn.a 430 30 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2xkc.a 4vq 29 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]2xk8.a 5r1 30 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[2]5m53.a 7gj 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]2xkf.a bx1 28 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]4afe.a ggy 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[2]5m51.a nu6 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2xk4.a ol2 31 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]2xkd.a t3m 28 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2wqo.a vgk 28 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]2xk6.a eqh 24 . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]2xke.a wi2 24 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2jav.a 5z5 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5m55.a 7gg 23 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]2xno.a ed8 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2xk3.a xk3 23 . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]4a4x.a jup 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]2xnm.a wgz 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xnp.a wcx 39 . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[2]5m57.a 4sp 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]2w5a.a adp,mg 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2w5b.a ags,mg 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2w5h.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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