MET_HUMAN_1048_1351

Hepatocyte growth factor receptor [Protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (MET_HUMAN):D: Protein kinase (1084:1089,1092,1108,1110,1112,1124,1127,1128,1130,1131,1134,1139,1140,1142,1145,1155,1157:1164,1167,1195,1200,1202,1204,1208,1209,1211,1220:1223,1226:1231,1234)
R: Interaction with RANBP9 (1220:1223,1226:1231,1234)
1084:1089,1092,1108,1110,1112,1124,1127,1128,1130,1131,1134,1139,1140,1142,1145,1155,1157:1164,1167,1195,1200,1202,1204,1208,1209,1211,1220:1223,1226:1231,1234

Full PDB list

1r0p,1r1w,2g15,2rfn,2rfs,2wd1,2wgj,2wkm,3a4p,3c1x,3ccn,3cd8,3ce3,3cth,3ctj,3dkc,3dkf,3dkg,3efj,3efk,3f66,3f82,3i5n,3l8v,3lq8,3q6u,3q6w,3qti,3r7o,3rhk,3u6h,3u6i,3vw8,3zbx,3zc5,3zcl,3zxz,3zze,4aoi,4ap7,4deg,4deh,4dei,4eev,4gg5,4gg7,4iwd,4knb,4mxc,4r1v,4r1y,4xmo,4xyf,5dg5,5eob,5eyc,5eyd,5hlw,5hni,5ho6,5hoa,5hor,5t3q (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
I
1
0
8
4
G
1
0
8
5
R
1
0
8
6
G
1
0
8
7
H
1
0
8
8
F
1
0
8
9
V
1
0
9
2
A
1
1
0
8
K
1
1
1
0
L
1
1
1
2
F
1
1
2
4
E
1
1
2
7
G
1
1
2
8
I
1
1
3
0
M
1
1
3
1
F
1
1
3
4
V
1
1
3
9
L
1
1
4
0
L
1
1
4
2
I
1
1
4
5
V
1
1
5
5
L
1
1
5
7
P
1
1
5
8
Y
1
1
5
9
M
1
1
6
0
K
1
1
6
1
H
1
1
6
2
G
1
1
6
3
D
1
1
6
4
N
1
1
6
7
L
1
1
9
5
F
1
2
0
0
H
1
2
0
2
D
1
2
0
4
R
1
2
0
8
N
1
2
0
9
M
1
2
1
1
V
1
2
2
0
A
1
2
2
1
D
1
2
2
2
F
1
2
2
3
A
1
2
2
6
R
1
2
2
7
D
1
2
2
8
M
1
2
2
9
Y
1
2
3
0
D
1
2
3
1
Y
1
2
3
4
[1]4gg5.a 0j3 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4deg.a 0jj 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4deh.a 0jk 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dei.a 0jl 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3ce3.a 1fn 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[1]4knb.a 1ru 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3cth.a 319 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[2]3ctj.a 320 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[1]3qti.a 3qt 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F
[1]4xyf.a 44x 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4xmo.a 46g 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4aoi.a 4k0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eob.a 5qq 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eyc.a 5sz 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eyd.a 5t1 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hni.y 63b 31 - - - - - - . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]3zbx.a 6xe 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2rfs.a am8 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3i5n.a b2d 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3vw8.a df6 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3a4p.a dfq 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3f66.a gbl,ihx 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zxz.a krw 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cd8.a l5g 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3l8v.a l8v 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[8]3rhk.b m97 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zc5.a w9z 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zze.a 6xp 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3dkf.a sx8 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]4gg7.a 0j8 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3f82.a 353 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[1]4r1y.a 3eh 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zcl.a 5tf 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ap7.a f47 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2wd1.a zzy 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r1v.a 3e8 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[6]5dg5.a 5b4 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ccn.a lkg 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]3efj.a mt3 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[1]5hlw.a 62e 38 . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . .
[3]3efk.b mt4 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[4]4iwd.a 1jc 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . *
[2]3c1x.a ckk 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[4]3q6w.a q6w 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . *
[3]3u6i.a 044 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[4]3r7o.a m61 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . *
[3]3u6h.a 03x 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[1]2wgj.a vgh 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]5t3q.a 75h 41 . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - -
[2]4eev.a l1x 41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
[2]4mxc.a dwf 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2wkm.a pfy 43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]2rfn.a am7 45 . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - -
[1]1r0p.a ksa 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F
[2]3lq8.a 88z 46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . .
[1]5hoa.a 63k 38 - - A V Q H . . . - . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . V . . . . . . . . . . . . - - - - -
[5]2g15.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hor.a 63k 38 - - - - - - . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[7]3dkc.a atp,mg 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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