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HYES_HUMAN_230_551

Bifunctional epoxide hydrolase 2 [AB hydrolase superfamily. Epoxide hydrolase family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (HYES_HUMAN):R: Epoxide hydrolase (267, 268, 310, 335, 336, 339, 343, 360, 361, 363:366, 369:371, 374, 375, 378, 380, 381, 383, 384, 387, 397, 407, 408, 410, 415:419, 422, 428, 429, 466, 468, 469, 472, 473, 476, 495:499, 503, 524, 525)
D: AB hydrolase-1 (267, 268, 310, 335, 336, 339, 343, 360, 361, 363:366, 369:371, 374, 375, 378, 380, 381, 383, 384, 387, 397, 407, 408, 410, 415:419, 422, 428, 429, 466, 468, 469, 472, 473, 476, 495:499, 503, 524, 525)
267, 268, 310, 335, 336, 339, 343, 360, 361, 363:366, 369:371, 374, 375, 378, 380, 381, 383, 384, 387, 397, 407, 408, 410, 415:419, 422, 428, 429, 466, 468, 469, 472, 473, 476, 495:499, 503, 524, 525

Full PDB list

1zd2, 1zd3, 1zd4, 1zd5, 3ans, 3ant, 3i1y, 3i28, 3koo, 3otq, 3pdc, 3wk4, 3wk5, 3wk6, 3wk7, 3wk8, 3wk9, 3wka, 3wkb, 3wkc, 3wkd, 3wke, 4c4x, 4c4y, 4c4z, 4hai, 4j03, 4jnc, 4ocz, 4od0, 4x6x, 4x6y, 4y2j, 4y2p, 4y2q, 4y2r, 4y2s, 4y2t, 4y2u, 4y2v, 4y2x, 4y2y, 5ai4, 5ai5, 5ai9, 5aia, 5ak5, 5ake, 5akh, 5aki, 5akj, 5akl, 5aky, 5ald, 5ale, 5alf, 5alg, 5alh, 5ali, 5alj, 5alk, 5alm, 5aln, 5alo, 5alp, 5alq, 5alr, 5als, 5alt, 5alu, 5alw, 5alx, 5aly, 5alz, 5am0, 5am1, 5am4, 5am5, 5fp0, 6aum (Pocketome entry); 1s8o, 1vj5, 5ahx, 5ai0, 5ai6, 5ai8, 5aib, 5aic, 5ak3, 5ak4, 5ak6, 5akg, 5akk, 5akx, 5akz, 5all, 5alv, 5am2, 5am3 (unprocessed)

Pocket contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1
F
2
6
7
P
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0
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[1]1zd2.p nc314 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zd3.a nc416 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zd4.a nc618 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zd5.a nc719 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ans.a s3820 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ant.a s8226 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3i1y.a 33n24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3i28.a 34n31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3koo.a 24d25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3otq.a mzl28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3pdc.a zyi19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk4.a s0a15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk5.a s0c14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk6.a s0b15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk7.a s0d15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk8.a s0e14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wk9.a s0f14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wka.a s0g16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wkb.a s0i18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wkc.a s0j19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wkd.a s0k20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wke.a aub30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4c4x.a w9m14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4c4y.a 7wi15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4c4z.a w9l16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hai.a i2328 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j03.a fvs41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jnc.a 1lf29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ocz.a 2ru25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4od0.a 2rv25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x6x.a s7436 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x6y.a s9425 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2j.a 49g16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2p.a 3c515 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2q.a 49n16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2r.a 49o14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2s.a 49p16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2t.a 49q18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2u.a 49r18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2v.a 4a513 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2x.a 4a021 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4y2y.a 49z17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ai4.a 4vy,4vy24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ai5.a bsu16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ai9.a k7823 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aia.a kwb16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ak5.a v2z16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ake.a 6n026 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5akh.a 6nm21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aki.a 6nf19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5akj.a 6n413 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5akl.a 6n823 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aky.a 6nj,6nj34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ald.a fcw16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ale.a onr13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alf.a oe125 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alg.a r4n33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alh.a 4ua37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ali.a q3b39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alj.a t5j21 . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . .
[1]5alk.a wmr20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alm.a 7gm19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aln.a 5zm19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alo.a a0j24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alp.a qyd24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alq.a gzp17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alr.a 8tm22 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5als.a 5dq28 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alt.a 9xz18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alu.a hd2,hd262 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alw.a jqn21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alx.a dul17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aly.a b7h21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alz.a xq924 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am0.a lws19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am1.a i5t28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am4.a mvj21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am5.a 6nz,6nz32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fp0.a szc28 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]6aum.a bxv31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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PDB.ch
A1
F
2
6
7
P
2
6
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M
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0
D
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L
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2
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N
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M
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W
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[1]1zd2.p . . . . . * . . . * . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]1zd3.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1zd4.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]1zd5.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3ans.a . . . . . * * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]3ant.a . . . . . * * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3i1y.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3i28.a . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . * * . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3koo.a . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . . . . .
[1]3otq.a . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3pdc.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]3wk4.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . * * . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wk5.a . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wk6.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . * . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wk7.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]3wk8.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . * . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wk9.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wka.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wkb.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wkc.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]3wkd.a . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3wke.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4c4x.a . . . . . * * . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . * . * . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]4c4y.a . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]4c4z.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hai.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4j03.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]4jnc.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ocz.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4od0.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4x6x.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x6y.a . . . . . * * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . * . . . .
[1]4y2j.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2p.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2q.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2r.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2s.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2t.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2u.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2v.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2x.a . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]4y2y.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]5ai4.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5ai5.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . * . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5ai9.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5aia.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5ak5.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . * . . . . . . . . . . . . .
[1]5ake.a . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . .
[1]5akh.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5aki.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5akj.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . * * . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5akl.a . . . . . * * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aky.a . . * . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . * * . * . * . * . * . . . . . . . . . . .
[1]5ald.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5ale.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alf.a . . . . . * * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alg.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alh.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ali.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . * * . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alj.a . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . * * . . . . . . . . . - - . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alk.a . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alm.a . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aln.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alo.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alp.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alq.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alr.a . . . . . . . . . . . . . . . . . - - A * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5als.a . . . . . * * . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . * . . * . . . . . * . . . . . . * . . . .
[1]5alt.a . . . . . * . . . * . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alu.a . . * . . * . . . * . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alw.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5alx.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5aly.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5alz.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am0.a . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . * . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am1.a . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .
[1]5am4.a . . . . . * * . . . . . . . . . . * . . * * * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5am5.a . . . . . . . . . * . . . . . * . * . . * * * . . . . . * . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fp0.a . . . . . * * . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . * * . * . . . . . * . . . . . . * . . . .
[1]6aum.a . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . . * . * . . . * . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1zd2.p:nc3
1zd3.a:nc4
1zd4.a:nc6
1zd5.a:nc7
3ans.a:s38
3ant.a:s82
3i1y.a:33n
3i28.a:34n
3koo.a:24d
3otq.a:mzl
3pdc.a:zyi
3wk4.a:s0a
3wk5.a:s0c
3wk6.a:s0b
3wk7.a:s0d
3wk8.a:s0e
3wk9.a:s0f
3wka.a:s0g
3wkb.a:s0i
3wkc.a:s0j
3wkd.a:s0k
3wke.a:aub
4c4x.a:w9m
4c4y.a:7wi
4c4z.a:w9l
4hai.a:i23
4j03.a:fvs
4jnc.a:1lf
4ocz.a:2ru
4od0.a:2rv
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4x6y.a:s94
4y2j.a:49g
4y2p.a:3c5
4y2q.a:49n
4y2r.a:49o
4y2s.a:49p
4y2t.a:49q
4y2u.a:49r
4y2v.a:4a5
4y2x.a:4a0
4y2y.a:49z
5ai4.a:4vy
5ai5.a:bsu
5ai9.a:k78
5aia.a:kwb
5ak5.a:v2z
5ake.a:6n0
5akh.a:6nm
5aki.a:6nf
5akj.a:6n4
5akl.a:6n8
5aky.a:6nj
5ald.a:fcw
5ale.a:onr
5alf.a:oe1
5alg.a:r4n
5alh.a:4ua
5ali.a:q3b
5alj.a:t5j
5alk.a:wmr
5alm.a:7gm
5aln.a:5zm
5alo.a:a0j
5alp.a:qyd
5alq.a:gzp
5alr.a:8tm
5als.a:5dq
5alt.a:9xz
5alu.a:hd2
5alw.a:jqn
5alx.a:dul
5aly.a:b7h
5alz.a:xq9
5am0.a:lws
5am1.a:i5t
5am4.a:mvj
5am5.a:6nz
5fp0.a:szc
6aum.a:bxv
[1] 1zd2.p
0.1
1.1 0.8 1.0 1.7 1.4 1.3 1.7 1.4 0.9 1.0 0.8 0.9 0.4 0.9 0.4 0.7 0.3 1.2 0.2 1.9 1.0 0.7 0.9 1.1 1.9 0.9 1.3 1.8 1.5 1.9 1.3 0.2 0.3 0.3 0.2 0.1 0.2 1.1 0.2 0.5 0.3 0.7 1.0 0.6 0.4 0.3 2.0 0.6 1.1 0.8 1.1 0.5 0.5 0 1.8 1.7 2.2 1.5 3.0 0.7 0.5 0.4 1.0 0.8 1.6 1.3 4.5 0.4 3.2 2.3 0.3 0.6 1.4 0.4 1.7 0.4 0.7 6.1 0.7
[1] 1zd3.a 0.1
0.1
0.1 0.7 0.9 0.6 0.5 0.9 1.0 0.4 0.2 0.1 0.2 0 0.3 0.4 0.8 0.4 0 0.2 0.6 0.3 0.5 0.2 0.4 1.9 0.7 0.5 0.9 0.5 1.1 0.8 0.1 0.1 0.1 0 0.3 0 0.5 0.3 0.5 0 0.6 0 0.7 0.5 0.4 1.8 0.7 0.3 0.3 0.5 0.9 0.8 0 1.4 1.7 0.9 1.5 2.0 0.8 0.2 0.5 0.3 0.2 0.5 0.6 3.7 0.2 2.6 2.0 0.7 0.9 0.4 0.8 0.5 0.5 0.7 4.6 0.3
[1] 1zd4.a 0 0.2
0.1
0.4 0.5 0.1 0.3 0.8 0.9 0.3 0.3 0.1 0.2 0 0.2 0.4 0.7 0.4 0.6 0.1 1.4 0.4 0.3 0.3 0.2 1.7 0.2 0.4 0.9 0.5 0.5 0.2 0 0 0 0 0.1 0 0.3 0.2 0 0.1 0.4 0.1 0.9 0.2 0.4 1.5 0.6 0.3 0.2 0.2 0.8 0.4 0 0.9 1.0 0.8 1.1 1.7 0.6 0 0.4 0.4 0.2 0.3 0.5 2.9 0.4 2.2 1.8 0.5 0.5 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 4.2 0.2
[1] 1zd5.a 0.1 0.3 0.1
0.1
0.7 0.5 0.5 0.7 0.7 0.2 0.2 0.2 0.1 0.2 0.3 0.4 0.8 0.4 0.2 0.2 0.7 0.1 0.3 0.7 0.2 2.1 1.1 0.5 0.7 0.4 0.7 0.6 0.1 0.1 0.1 0 0.1 0 0.6 0.2 0.5 0.1 0.2 0.1 0.7 0.4 0.3 2.1 0.9 0.3 0.4 0.7 0.6 0.7 0 0.7 1.2 0.7 0.7 2.0 1.0 0.1 0.7 0.2 0 0.5 0.6 3.1 0.1 2.2 2.1 0.4 0.5 0.8 0.9 0.6 0.6 0.4 4.9 0.3
[1] 3ans.a 0.1 0.1 0.1 0.1
0.1
0 0.4 0.6 0.7 0.5 0.1 0 0.2 0.2 0 0.4 0.7 0.6 2.3 0.5 3.2 0.5 0.1 0.3 0.4 1.2 0.8 0.7 0.7 0.4 0.4 0.1 0 0 0.2 0.2 0.1 0.1 0.3 0.3 0.2 0 0.3 0.1 0.8 0.4 0.4 0.8 0.6 0.2 0.1 0.5 1.0 0.8 0.1 0.2 1.2 1.1 0.2 1.3 0.7 0.1 0.5 1.0 0.1 0.5 0.2 2.6 0.3 2.4 2.0 0.8 0.8 0.3 0.8 0.1 0.6 1.2 3.8 0
[1] 3ant.a 0 0.2 0.3 0.1 0.3
0
0.2 0.6 0.7 0.5 0.3 0.1 0.1 0.1 0 0.4 0.7 0.3 1.3 0.3 1.6 0.6 0 0.2 0.1 1.8 0.2 0.5 0.2 0.1 0.5 0 0 0.1 0.1 0 0.1 0.2 0.2 0.3 0.3 0.3 0.7 0.2 0.6 0.2 0.1 0.7 0.3 0.3 0.1 0.2 1.1 0.5 0 0.3 1.0 0.6 0.4 1.3 0.8 0.1 0.5 0.2 0 0.2 0.2 1.8 0.7 2.4 1.9 0.4 0.7 0.4 0.7 0.6 0.4 0.8 3.4 0.1
[1] 3i1y.a 0.2 0.4 0.1 0.5 0.6 0.2
0
0.8 0.6 0.4 0.4 0.2 0.2 0.2 0.1 0.1 0.3 0.1 1.0 0.5 1.2 0.5 0.3 0.2 0.1 1.8 0.3 0.4 1.2 0.7 0.8 0.2 0 0.1 0.1 0 0.1 0.5 0.6 0.2 0.3 0.3 0.3 0.2 0.3 0.4 0.3 1.5 0.3 0.3 0.4 0.2 0.8 0.3 0 1.2 1.0 1.1 1.1 1.8 0.3 0 0.3 0.2 0.2 0.5 0.7 2.7 0.4 2.6 2.0 0.2 0.5 0.7 0.2 0.4 0.3 0.6 4.1 0.3
[1] 3i28.a 0.1 0.2 0.1 0.5 0.1 0.2 0
0.2
0.3 0.8 0.1 0 0.1 0.2 0.3 0 0.1 0.1 1.1 0.1 1.4 0.7 0.2 0.1 0.1 2.4 0.3 0.3 0.5 0.1 0.7 0.1 0 0 0.1 0 0 0 0.5 0.1 0.6 0 0 0 0.2 0.2 0 1.7 0 0.1 0.5 0.1 0.2 0.1 0 1.0 0.4 0.7 0.9 1.8 0.2 0 0.1 0.3 0.1 0.2 0.4 2.5 0.5 1.8 1.2 1.7 0.1 0.2 0.1 0.1 0.2 0.4 4.4 0.1
[1] 3koo.a 0.3 0.3 0.6 0.2 0.3 0.3 0.2 1.8
0.1
0.2 0.1 0 0.2 0.4 0.1 0.1 0.2 0.9 1.8 0.5 2.1 0.5 0.2 0.1 0.1 1.7 0.5 0.4 0.4 0.3 0.7 0.2 0.1 0 0.1 0 1.2 0.2 0.6 0.9 0.6 0.2 0.3 0.1 0.4 1.1 1.2 1.3 0.2 0.3 0.3 0.1 0.5 1.6 0.1 0.4 0.7 0.5 0.3 1.7 0.5 0.2 1.6 0.3 0 0.6 0.5 1.2 0.3 2.0 2.7 0.1 1.4 0.3 1.6 0.7 1.4 1.2 3.7 0
[1] 3otq.a 0.4 0.7 0.4 0.3 0.4 0.5 0.4 1.1 0.8
0
0.3 0.1 0.4 0.3 0.2 0.3 0.6 0.5 1.6 0.4 2.0 0.5 0.4 0.7 0.5 2.0 1.0 0.8 0.6 0.3 0.8 0.3 0 0 0.1 0.1 0.1 0.2 0.5 0.2 0.5 0.2 0.4 0.4 0.6 0.4 0.3 1.5 0.8 0.4 0.1 0.4 0.7 0.6 0 1.2 0.8 1.5 0.6 1.4 0.6 0.3 0.7 0.1 0.4 0.7 0.4 2.2 0.9 2.7 1.5 0.6 0.6 0.4 0.6 0.5 0.7 1.0 4.1 0
[1] 3pdc.a 0.1 0.2 0.2 0.4 0.5 0.5 0.6 0.7 0.5 0.8
0
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[1] 5ai5.a 0.1 0.1 0.1 0.6 0.7 0.3 0.2 0.7 0.9 1.0 0.2 0.1 0.2 0 0.3 0.3 0.3 0.1 1.1 0.2 1.9 0.8 0.4 0.3 0.2 1.8 0.3 0.3 0.9 0.5 0.4 0.4 0 0 0.2 0 0.1 0 0.3 0.1 0.2 0 0.3
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[1] 5ake.a 0.4 0.2 0.2 0.1 0.3 0.2 0.3 1.1 0.7 0.3 0.1 0.1 0.2 0.2 0 0.4 1.0 0.4 0.8 0.3 1.7 0.5 0.3 0.4 0.5 0.3 0.3 0.9 0.7 0.4 0.7 0 0 0 0.2 0 0.2 0.1 0.3 0.3 0.1 0.1 0.5 0.2 1.0 0.4 0.4
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[1] 5akl.a 0.2 0.4 0.2 0.3 0.7 0.4 0.1 0.8 0.4 0.5 0.4 0.2 0.2 0.1 0.3 0 0.2 0.2 1.6 0.4 1.7 0.6 0.4 0.1 0.1 2.2 0.4 0.4 1.0 0.7 0.9 0.5 0 0.1 0.2 0.1 0 0.2 0.4 0.2 0.5 0.3 0.4 0.2 0.2 0.2 0.1 1.2 0.2 0.3 0.3
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[1] 5aky.a 0.1 0.8 0.8 1.1 1.1 1.3 1.1 1.2 1.2 2.4 0.8 0.7 0.5 0.2 0.7 0 0 0.4 1.4 0 2.6 2.5 1.2 0.7 0.6 2.8 1.1 1.0 1.2 0.8 1.1 1.1 0.2 0.3 0.3 0.1 0 0.2 1.1 0 0.6 0.2 0.7 0.6 0.1 0.7 0.5 2.7 0.2 1.4 0.5 0.9
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[1] 5ald.a 0.2 0.3 0.7 0.8 1.0 0.7 1.0 1.1 1.5 0.8 0.5 0.7 0.3 0.3 1.1 0 0 0 1.0 0 1.9 0.5 0.6 0.5 0.6 1.7 0.3 0.9 0.9 0.7 0.9 0.7 0.2 0.2 0.6 0.2 0 0.1 1.0 0.1 0.5 0.3 0.6 0.3 0.2 0 0 1.6 0.1 1.0 1.1 0.4 0.4
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[1] 5ale.a 0.2 1.1 1.0 1.3 1.4 1.5 0.7 1.1 1.8 1.3 0.5 0.7 0.4 0.3 1.0 0.4 0.5 0.3 0 0 0.7 0.8 1.3 0.7 0.7 2.5 0.9 0.8 1.3 1.0 1.5 1.4 0.3 0.4 0.4 0.3 0.1 0.2 1.1 0.4 0.7 0.3 0.7 0.8 0.7 0.6 0.2 2.5 0.4 1.4 1.1 0.7 0.9 0.6
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[1] 5alg.a 0 0.2 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0.5 0.3 0.2 0 0 0.2 0.1 0.1 0 0 0 0 0.1 0.3 0.1 0.2 0.2 0 1.7 0.3 0.1 0.5 0.3 0.2 0.1 0 0 0 0 0 0 0.2 0 0.1 0 0.1 0.1 0 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0.2 0.1 0.2 0 0 0.3
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[1] 5alj.a 0.3 0.1 0.1 0.2 0.2 0 0.3 0.4 0.7 0.5 0 0.1 0.2 0.3 0.1 0.4 0.7 0.4 0.8 0.2 1.8 0.6 0.2 0.2 0.4 2.3 0.3 0.9 0.3 0.1 0.5 0 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.5 0.3 0.3 0 0.3 0.1 0.7 0.4 0.4 2.6 0.4 0.2 0.1 0.2 1.2 0.7 0 0.4 1.2 0.9 0.6
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[1] 5alk.a 0.2 0.8 0.8 0.9 1.2 1.1 1.0 1.0 1.4 1.1 0.6 0.8 0.6 0.4 1.0 0.1 0 0.1 2.3 0 3.2 0.8 1.1 0.6 0.6 1.9 1.0 1.2 1.1 0.9 1.1 1.4 0.3 0.1 0.2 0.3 0 0.2 1.0 0.1 0.7 0.3 0.7 0.7 0.1 0.1 0 1.9 0 1.4 0.9 0.9 0.3 0.1 0 1.7 1.4 1.8 1.4 3.0
0
0.6 0.1 0.8 0.9 1.3 1.4 4.7 0 2.5 1.5 0.1 0.1 0.9 0.2 1.0 0.1 0.8 5.8 0.7
[1] 5alm.a 0.1 0.5 0.4 0.3 0.3 0.9 0.1 0.7 0.8 0.5 0.1 0 0.2 0.1 0.1 0.3 0.4 0.4 0 0.1 0.4 0.3 0.5 0.2 0.3 2.1 0.5 0.4 1.3 0.6 0.9 0.6 0.3 0.4 0.2 0.2 0.3 0 0.2 0.2 0.6 0.1 0.3 0.1 0.4 0.5 0.3 1.6 0.4 0.5 0.1 0.2 0.6 0.8 0.2 1.0 0.9 0.9 1.2 2.0 0.5
0
0.7 0.1 0.3 0.3 0.6 3.3 0.4 1.0 1.7 0.2 0.8 0.6 0.8 0.7 0.6 0.7 4.9 0.2
[1] 5aln.a 0.2 0.3 0.3 0.8 1.3 1.1 0.6 0.5 1.3 0.7 0.8 0.5 0.3 0.7 1.2 0 0.1 0.1 1.1 0.1 1.7 0.5 0.9 0.5 0.3 1.6 0.5 0.3 1.3 0.7 0.9 1.1 0.3 0.2 0.4 0.2 0 0.3 1.0 0.2 0.8 0.3 0.4 0.5 0.3 0 0 1.6 0.1 0.7 1.3 0.5 0.7 0.1 0 2.7 0.8 2.1 1.6 3.3 0.1 0.3
0
0.8 0.8 0.8 1.8 4.6 0.3 3.0 1.5 0 0 0.6 0.1 1.0 0.3 0.7 5.8 0.7
[1] 5alo.a 0.3 0.8 0.5 0.4 0.8 0.8 0.5 0.5 1.3 0.7 0.7 0.6 0.2 0.3 0.9 0.3 0.3 0.4 0.1 0.1 0.5 0.4 1.0 0.3 0.4 1.9 0.4 0.4 1.1 0.8 1.2 0.8 0.1 0.5 0.5 0.3 0.1 0 1.0 0.4 0.6 0.1 0.4 0.4 0.4 0.1 0.1 1.8 0.3 0.7 0.8 0.4 0.8 0.4 0.1 1.6 0.8 1.0 1.6 2.9 0.1 0.1 0.4
0
0.6 0.8 1.5 4.3 0.2 2.9 1.3 0.1 0.4 0.4 0.3 0.6 0.4 0.3 5.9 0.6
[1] 5alp.a 0.2 0.4 0.4 0.4 0.2 0.1 0.2 0.4 0.4 1.6 0 0.1 0.2 0.1 0.1 0.3 0.4 0.3 0 0.1 0.3 1.4 0.5 0.4 0.3 2.1 0.4 0.6 0.3 0 0.3 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0 0.3 0.2 0.5 0 0.1 0.2 0.6 0.8 0.7 1.4 0.3 0.3 0.1 0.3 0.6 0.3 0 0.6 0.8 0.4 0.5 1.8 1.0 0 0.6 0.2
0.1
0.4 0.3 2.4 0.5 2.5 1.6 2.4 0.7 0.6 0.6 0.1 0.3 0.9 4.4 0.1
[1] 5alq.a 0 0.1 0 0.2 0.7 0.5 0.3 0.5 0.4 1.0 0.1 0.1 0 0 0.3 0.1 0.5 0.1 0.8 0 1.7 0.3 0.5 0.3 0.2 1.8 0.3 0.2 0.6 0.5 0.4 0.5 0.1 0.1 0 0 0.1 0 0.2 0 0.4 0.2 0.3 0 0.3 0.4 0.1 1.9 0.5 0.2 0.3 0 0.4 0.3 0 0.7 0.9 0.7 0.9 2.0 0.5 0 0.6 0.9 0.2
0.4
0.8 3.1 0.4 1.8 2.0 0.4 0.8 0.5 0.3 0.7 0.2 0.5 4.8 0.3
[1] 5alr.a 0.4 0.2 0.3 0.3 0.3 0.2 0.4 1.1 0.6 0.7 0.1 0.1 0.2 0.4 0 0.4 0.7 0.2 0.8 0.4 1.8 0.6 0.2 0.5 0.3 1.7 0.4 1.1 0.6 0.3 0.4 0.2 0 0.1 0 0 0.1 0.2 0.8 0.4 0.4 0.1 0.5 0.2 0.6 0.2 0.2 0.8 0.4 0.2 0.2 0.3 1.0 0.8 0 0.6 1.2 0.7 0.9 0.8 0.7 0.3 0.9 0.4 0.1 0.7
0
2.3 0.2 2.0 1.5 0.5 1.3 0.3 1.3 0.7 0.6 0.7 3.6 0.1
[1] 5als.a 0.5 0.4 0.2 0.2 0.7 0.2 0.1 1.0 0.7 1.9 0.3 0 0.2 0.2 0 0.5 0.8 0.4 2.5 0.5 2.8 1.7 0.2 0.3 0.4 2.6 0.4 0.6 0.6 0.5 0.5 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.5 0.7 0.3 0.6 0.1 0.5 0.2 0.7 0.7 0.7 1.3 0.8 0.4 0.1 0.4 1.3 0.9 0.1 0 1.6 0.7 0.1 0.2 1.1 0.4 0.7 0.4 0 0.6 0.2
0.1
0.3 2.3 1.6 2.9 0.6 0.7 0.9 0.4 0.8 1.5 0.2 0.1
[1] 5alt.a 0.5 1.1 1.3 1.2 2.3 3.7 1.5 2.0 3.4 1.9 1.5 1.1 0.8 0.6 1.2 0.3 0.1 0.4 1.3 0.7 2.7 1.4 1.5 0.9 1.2 3.1 1.0 1.6 4.0 3.0 3.4 3.0 0.4 0.5 0.9 0.8 0.1 0.2 1.1 0.4 1.6 0.7 1.0 0.9 0.5 0.5 0.1 2.4 0.1 1.9 1.2 0.8 0.7 0.2 0.1 4.3 2.3 3.6 4.0 4.1 0.6 0.9 0.6 1.3 1.3 1.5 2.6 6.2
0
2.9 1.8 0.4 0.6 1.9 0.2 3.0 0.2 1.3 7.5 1.5
[1] 5alu.a 0.1 0.3 0.2 0.1 0.4 2.3 0.2 0.4 1.6 1.2 0.1 0.1 0.2 0.2 0 0.1 0.3 0 0.8 0.6 1.5 0.7 0.2 0.5 0.1 2.1 0.6 1.1 2.3 1.4 1.9 1.2 0.1 0.2 0.1 0.1 0 0 0.2 0.1 0.2 0.1 0.3 0.2 0.2 0.1 0 1.4 0.2 0.4 0 0.2 0.2 0.2 0 1.8 1.3 1.9 3.3 1.5 0.3 0.2 0.4 0.3 0.1 0.4 0.4 3.1 0.4
0
2.0 0.1 0.5 0.6 0.2 1.5 0.1 0.2 4.4 0.4
[1] 5alw.a 0.2 0.7 0.6 0.8 1.1 1.2 0.7 1.2 1.2 0.4 1.0 0.6 0.6 0.4 0.8 0 0.1 0 0 0.2 0.4 0.4 0.7 0.6 0.6 2.5 0.6 0.6 1.5 1.2 1.2 1.0 0.2 0.2 0.3 0.3 0 0.2 0.9 0.1 0.6 0.4 0.8 0.6 0.1 0.1 0 1.5 0 0.9 0.9 0.7 0.5 0.1 0 1.7 0.9 1.7 1.3 3.0 0 0.2 0.2 0.5 0.8 1.1 1.4 3.7 0.5 2.9
0
0 0.2 1.3 0.1 1.3 0.2 0.2 5.3 0.8
[1] 5alx.a 0.3 0.7 1.0 1.0 1.7 0.9 1.0 1.3 1.7 1.3 0.8 0.6 0.3 0.3 1.0 0.3 0.2 0.1 0 0.1 0.7 0.8 0.9 0.6 0.6 2.6 0.8 0.9 1.6 1.1 1.2 1.2 0.5 0.5 0.9 0.6 0.1 0.1 1.0 0.3 1.0 0.4 0.7 0.4 0.6 0.4 0.1 2.1 0.2 1.3 1.1 0.8 1.0 0.4 0.1 1.9 2.1 1.6 1.4 3.0 0.8 0.5 0.4 0.3 0.7 1.2 1.6 4.6 0.3 2.5 1.9
0
0.5 1.5 0.3 1.3 0.2 0.5 6.0 1.1
[1] 5aly.a 0.3 0.6 0.8 0.9 1.3 1.1 1.0 1.0 1.8 0.8 1.0 1.0 0.5 0.9 1.2 0 0.2 0.2 1.3 0.2 2.1 0.7 1.0 1.0 0.7 1.7 0.6 0.7 1.3 1.0 1.6 1.3 0.5 0.3 0.6 0.6 0 0.1 1.3 0.1 1.0 0.4 0.7 0.6 0.4 0 0 2.3 0 1.2 1.1 0.7 0.9 0.1 0 2.7 1.2 1.9 1.5 4.3 0.1 0.6 0 1.1 0.9 1.2 2.2 4.9 0.1 3.0 1.3 0
0
0.9 0 1.1 0.1 0.5 6.6 0.9
[1] 5alz.a 0.1 0.2 0.1 1.1 0.2 0.4 0.2 0.4 0.7 0.5 0 0.2 0.2 0.1 0.4 0.1 0.2 0 0 0 0.5 0.1 0.2 0.1 0.1 1.7 0.4 0.2 0.3 0.2 0.3 0.2 0 0.1 0 0.1 0 0 0.4 0.1 0.1 0 0.1 0.2 0.2 0.1 0.1 0.9 0.2 0.3 0.3 0.1 0.3 0.2 0 1.5 0.9 0.9 1.7 1.8 0.1 0 0.2 0.6 0.3 0.3 0.6 3.3 0.6 2.1 1.5 0.1 0.3
0.2
0.4 0.2 0.3 0.3 4.7 0.2
[1] 5am0.a 0.6 0.7 0.8 1.0 1.8 1.7 0.9 1.2 2.2 1.8 1.3 1.0 0.6 0.7 1.4 0 0.3 0.3 0 0.1 0.6 1.5 1.2 0.8 1.0 1.9 0.6 0.7 1.9 1.5 2.0 1.7 0.5 0.4 0.8 0.7 0 0.1 1.5 0 0.9 0.5 1.0 0.6 0.4 0 0 2.5 0.1 1.1 1.3 0.7 0.8 0.1 0.1 2.6 1.6 1.5 1.5 4.3 0.2 0.8 0 0.5 1.2 1.2 2.1 5.5 0.3 3.1 1.7 1.2 0.1 1.6
0
1.5 0.2 0.1 6.6 1.4
[1] 5am1.a 0.3 0.1 0 0.2 0.1 0 0.2 0.4 0.5 0.5 0.1 0 0.2 0.1 0.1 0.4 0.7 0.5 1.8 0.1 2.6 0.4 0.3 0.2 0.4 1.7 0.3 0.5 0.3 0.1 0.5 0.1 0 0 0 0 0.1 0.1 0.4 0.3 0.3 0 0.3 0.1 0.7 0.4 0.4 0.8 0.7 0.2 0.1 0.2 1.1 0.7 0 0.9 1.1 1.6 0.3 1.5 0.9 0 0.5 0.6 0.1 0.3 0.3 2.8 0.3 2.7 1.7 0.5 0.8 0.1 0.8
0
0.8 1.2 4.4 0
[1] 5am4.a 0.2 0.3 0.6 0.7 1.5 1.2 0.7 1.2 1.5 1.2 1.0 0.7 0.3 0.3 0.9 0 0.1 0 1.6 0.1 1.8 0.9 0.7 0.6 0.5 1.5 0.6 0.8 1.4 1.2 1.4 1.4 0.2 0.2 0.6 0.2 0 0.1 0.9 0 0.6 0.4 0.3 0.4 0.3 0 0.4 2.0 0 1.0 0.8 0.7 0.2 0 0 1.9 1.0 1.6 1.3 3.0 0.4 0.5 0 0.5 0.7 1.1 1.7 4.0 0.5 2.1 1.2 1.0 0 1.0 0.1 1.3
0
0.6 5.3 0.7
[1] 5am5.a 0.2 0.5 0.8 0.8 0.8 1.8 0.9 1.1 1.6 1.5 0.5 0.7 0.3 0.3 1.1 0 0.1 0 0 1.0 1.2 1.2 0.7 0.5 0.5 1.6 1.0 0.7 1.9 1.2 2.3 1.4 0.2 0.3 0.6 0.3 0 0.5 1.0 0.1 0.5 0.3 0.5 0.4 0.3 0 0 1.9 0.1 1.2 1.1 0.4 1.0 0 0 2.4 1.2 2.6 3.1 3.1 0.1 0.5 0.1 0.7 0.7 0.7 1.7 5.3 0 1.8 1.8 0.6 0.2 0.8 0.2 1.5 0
0
6.0 0.7
[1] 5fp0.a 0.4 0.2 0.2 0.3 0.7 0.4 0.3 1.0 1.0 1.1 0.3 0 0.3 0.4 0 0.6 0.7 0.6 2.1 0.8 2.9 1.5 0.3 0.3 0.3 2.0 0.5 1.0 0.7 0.6 0.8 0.3 0 0 0.1 0.1 0.3 0.3 1.0 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.8 0.5 0.9 1.4 0.6 0.2 0.2 0.4 1.1 0.7 0.1 0.2 1.6 0.7 0.1 0.1 1.4 0.4 0.8 0.5 0.2 0.5 0.2 0.1 0.3 2.6 1.8 1.9 0.8 0.5 0.7 0.7 0.7 1.8
0.1
0.3
[1] 6aum.a 0.1 0.7 0.3 0.7 0.6 0.6 0.3 0.4 0.9 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 0.3 0.1 0.2 0.1 1.2 0.1 1.9 0.8 0.4 0.5 0.3 1.9 0.8 0.8 0.7 0.2 1.7 0.5 0.1 0.2 0.2 0.2 0 0.1 0.4 0.1 0.6 0 0.2 0.2 0.3 0.2 0 1.2 0.1 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0 1.3 1.0 2.1 1.5 1.6 0.3 0.1 0.1 1.2 0.2 0.8 0.6 2.9 0.6 1.9 1.4 0.2 0.5 0.3 0.3 0.4 0.1 0.6 4.5
0.2
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (1 cluster)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
1zd2.p
1zd3.a
1zd4.a
1zd5.a
3ans.a
3ant.a
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5fp0.a
6aum.a
[1] 1zd2.p
0
.12 .09 .12 .17 .18 .13 .20 .20 .15 .11 .13 .10 .11 .12 .11 .09 .09 .09 .09 .13 .10 .19 .17 .15 .12 .09 .13 .12 .08 .17 .17 .10 .09 .12 .09 .08 .09 .09 .08 .11 .09 .10 .12 .09 .07 .13 .14 .10 .12 .17 .14 .14 .09 .11 .18 .16 .15 .21 .20 .10 .12 .09 .12 .16 .09 .14 .28 .15 .19 .13 .09 .12 .11 .14 .12 .15 .15 .26 .11
[1] 1zd3.a .12
0
.05 .05 .17 .10 .09 .12 .15 .10 .07 .10 .08 .10 .10 .13 .08 .12 .08 .12 .08 .09 .20 .14 .07 .12 .13 .08 .14 .08 .10 .14 .09 .11 .10 .11 .10 .14 .09 .13 .12 .10 .10 .11 .12 .13 .08 .12 .13 .04 .10 .08 .16 .11 .08 .16 .07 .06 .12 .18 .15 .06 .12 .08 .08 .08 .11 .24 .19 .13 .10 .09 .16 .07 .14 .09 .14 .15 .23 .08
[1] 1zd4.a .09 .05
0
.08 .13 .11 .12 .17 .16 .12 .06 .07 .07 .09 .07 .12 .08 .10 .10 .12 .12 .07 .16 .11 .10 .10 .10 .11 .11 .06 .13 .13 .08 .09 .10 .10 .09 .12 .06 .11 .10 .09 .11 .09 .11 .11 .12 .08 .11 .08 .13 .12 .15 .10 .12 .13 .10 .11 .16 .16 .13 .09 .11 .12 .12 .06 .09 .22 .18 .16 .14 .12 .15 .08 .16 .06 .17 .18 .20 .08
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