HPGDS_HUMAN_1_199

Hematopoietic prostaglandin D synthase [GST superfamily. Sigma family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (HPGDS_HUMAN):D: GST N-terminal (8,9,11,13,14,36,39,50)
R: Glutathione binding (50)
D: GST C-terminal (96,99,100,102,104:106,112,152,155,156,159,163,198,199)
8,9,11,13,14,36,39,50,96,99,100,102,104:106,112,152,155,156,159,163,198,199
Cofactors (cF):gsf/gsh
Metals (Me):Ca/Mg

Full PDB list

1iyh,1iyi,1v40,2cvd,2vcq,2vcw,2vcx,2vcz,2vd0,2vd1,3ee2,3kxo,3vi5,3vi7,4ec0,4edy,4edz,4ee0,5ais,5aiv,5aix (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1 cF Me
Y
8
F
9
M
1
1
G
1
3
R
1
4
Q
3
6
W
3
9
K
5
0
D
9
6
M
9
9
S
1
0
0
F
1
0
2
W
1
0
4
A
1
0
5
E
1
0
6
K
1
1
2
Y
1
5
2
I
1
5
5
C
1
5
6
T
1
5
9
F
1
6
3
K
1
9
8
L
1
9
9
[1]4ee0.a 0o4 27 . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . gsf Mg
[1]4edz.a 0o5 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]4ec0.a 7pq 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]4edy.a 9pq 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]2cvd.a hql 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]5aix.b krx 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]3kxo.a kxo 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]3vi5.c m4m 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1v40.b o16 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]5ais.d cwc 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]2vd0.b d27 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh
[1]2vd1.b d28 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]5aiv.a m1w 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]3ee2.a nzo 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]2vcq.b d25 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh
[1]2vcx.b d26 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Mg
[1]2vcz.b vc3 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh
[1]2vcw.b zza 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh
[1]3vi7.b cbd 51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Ca
[1]1iyi.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . gsh Ca

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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