ESR1_HUMAN_300_553

Estrogen receptor [Nuclear hormone receptor family. NR3 subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (ESR1_HUMAN):R: Interaction with AKAP13 (342,343,346,347,349:351,353,354,383,384,387,388,391,394,402,404,410,415,417:421,424,425,428,521,524,525,528:537,539,540)
R: Transactivation AF-2 (342,343,346,347,349:351,353,354,383,384,387,388,391,394,402,404,410,415,417:421,424,425,428,521,524,525,528:537,539,540)
342,343,346,347,349:351,353,354,383,384,387,388,391,394,402,404,410,415,417:421,424,425,428,521,524,525,528:537,539,540
Cofactors (cF):HKILHRLLQD/HKILHRLLQDS/KILHRLLQ/KILHRLLQD/KILHRLLQDS/KILHRLLQE

Full PDB list

1r5k,1sj0,1uom,1xp1,1xp9,1xqc,1yim,1yin,2g5o,2iok,2ouz,2p15,2qh6,2qr9,2r6w,2r6y,3dt3,3os8,3osa,3q97,3uua,4iu7,4iui,4iv2,4iv4,4ivw,4ivy,4iw6,4mg6,4mg7,4xi3,4zn9,4znh,4zns,4znt,4znu,4znv,4znw,5aau,5acc,5ak2,5dk9,5dkb,5dke,5dkg,5dks,5dl4,5dmc,5dmf,5dp0,5due,5dug,5duh,5dwg,5dwi,5dwj,5dxk,5dxm,5dxq,5dyb,5dzh,5dzi,5e0w,5e0x,5e14,5e15,5e19,5e1c,5ehj,5fqp,5fqr,5fqs,5fqt,5fqv,5kcc,5kcd,5kce,5kcf,5kct,5kcw1a52,1ere,1err,1g50,1gwq,1gwr,1l2i,1pcg,1qkt,1qku,1x7e,1x7r,1xp6,1xpc,1zky,2ayr,2b1v,2b1z,2b23,2bj4,2fai,2g44,2i0j,2iog,2jf9,2jfa,2ocf,2pog,2q6j,2q70,2qa6,2qa8,2qab,2qe4,2qgt,2qgw,2qse,2qxm,2qxs,2qzo,2yat,2yja,3erd,3ert,3hlv,3hm1,3l03,3os9,3q95,3uu7,3uuc,3uud,4dma,4iw8,4iwc,4iwf,4mg5,4mg8,4mg9,4mga,4mgb,4mgc,4mgd,4pp6,4ppp,4pps,4pxm,4q13,4q50,4tuz,4tv1,4zn7,5aav,5di7,5did,5die,5dig,5dlr,5drj,5drm,5dtv,5du5,5dvs,5dvv,5dwe,5dx3,5dxb,5dxe,5dxg,5dxp,5dxr,5dy8,5dyd,5dz0,5dz1,5dz3,5egv,5ei1,5eit,5hyr,5kcu,5kd9 (unprocessed)

Contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1 cF
M
3
4
2
M
3
4
3
L
3
4
6
T
3
4
7
L
3
4
9
A
3
5
0
D
3
5
1
E
3
5
3
L
3
5
4
W
3
8
3
L
3
8
4
L
3
8
7
M
3
8
8
L
3
9
1
R
3
9
4
L
4
0
2
F
4
0
4
L
4
1
0
G
4
1
5
C
4
1
7
V
4
1
8
E
4
1
9
G
4
2
0
M
4
2
1
I
4
2
4
F
4
2
5
L
4
2
8
G
5
2
1
H
5
2
4
L
5
2
5
M
5
2
8
K
5
2
9
C
5
3
0
K
5
3
1
N
5
3
2
V
5
3
3
V
5
3
4
P
5
3
5
L
5
3
6
Y
5
3
7
L
5
3
9
L
5
4
0
[1]4ivw.a 1gj 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4mg7.a 27h 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQE
[2]3dt3.a 369 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . .
[1]4znv.a 4q7 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4znu.a 4q9 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . S . . KILHRLLQD
[1]5dl4.a 5c4 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dkg.a 5c7 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dke.a 5c8 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dkb.a 5c9,5c9 64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dk9.a 5cc 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . S . .
[1]5dmf.a 5dg 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5dp0.a 5es 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5duh.a 5ft 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5dug.a 5fv 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5e19.a 5k7 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5e1c.a 5k8 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5e15.a 5ka 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5e14.a 5kb 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5e0x.a 5kd 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . . S . .
[1]5e0w.a 5ke 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . S . .
[2]5fqt.a 7qn 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . .
[2]5ak2.a 85z 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - - . . S . . .
[2]1xqc.a aej 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - - - . . . . .
[2]2ouz.a c3d 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1yim.a cm4 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1sj0.a e4d 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . .
[1]2p15.a ezt 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQDS
[2]5fqp.a gqd 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . .
[1]2qr9.a hz3 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[2]2iok.a iok 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . . . . .
[2]5fqs.a j0w 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . .
[2]5acc.a ke9 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - - . . S . . .
[2]3os8.a kn0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . .
[2]2r6y.a llc 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - - . . . . . .
[1]5kcc.a ob1 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQDS
[1]5kcd.a ob2 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5kce.a ob3,ob3 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQ
[1]4znt.a obb 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . S . . KILHRLLQD
[1]4znh.a obc,obc 64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQD
[1]4zn9.a obh 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4znw.a obm 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]2qh6.a ode 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4zns.a ofb 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[2]1uom.a pti 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . - - - - - - - . . . . .
[1]3q97.a q97,srr 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[2]5fqr.a qhg 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - - . . S . . .
[2]5fqv.a vqi 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . .
[1]4iui.a 1gq 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . - - - - - - S . . KILHRLLQD
[1]4iv2.a 1gr 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4iv4.a 1gs 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4ivy.a 1gt 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4iw6.a 1gu 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[2]4xi3.a 29s 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . S . . .
[1]5dks.a 5c6 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . . . S . . KILHRLLQD
[1]5due.a 5fy 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dyb.a 5k2 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5ehj.a 5k5 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[2]1yin.a cm3 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . .
[2]2r6w.a llb 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . - - - - - - . . . . . .
[2]5aau.a xbr 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . - - - - . . . S . . .
[2]1xp1.a aih 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1xp9.a aij 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1r5k.a gw5 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3osa.a kn3 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . - . . . . S . . .
[1]5kct.a ob7 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dmc.a 5dh 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . - - . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dwi.a 5g3 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dwg.a 5g4 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . - . . . S . . KILHRLLQ
[1]5dxq.a 5hz 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dxm.a 5j0 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQD
[1]5dxk.a 5j1 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dwj.a 5j2 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5dzi.a 5kf 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . .
[1]5dzh.a 5kg 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]2g5o.a drq 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5kcw.a ob9 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]5kcf.a ob5 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]3uua.a 0cz 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . KILHRLLQE
[1]4iu7.a 1gm 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . HKILHRLLQD
[1]4mg6.a 27g 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . * . . . . . . S . . KILHRLLQE

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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