ENV_HV1Y2_326_479

Envelope glycoprotein gp160

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (ENV_HV1Y2):R: CD4-binding loop (362,363,365,366)
108,111,206,251,253,370:372,377,379,408,411:417,460:463
108,111,206,251,253,362,363,365,366,370:372,377,379,408,411:417,460:463

Full PDB list

1g9n,1rzk,1yyl,1yym,2i5y,2i60,2qad,3hi1,3tgq,4dvr,4jzw,4jzz,4k0a,4ka2,4laj,4rwy (redundant pocketome entry)

Contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1
I
1
0
8
W
1
1
1
F
2
0
6
V
2
5
1
T
2
5
3
G
3
6
2
D
3
6
3
E
3
6
5
I
3
6
6
S
3
7
0
F
3
7
1
N
3
7
2
F
3
7
7
Y
3
7
9
K
4
0
8
I
4
1
1
N
4
1
2
M
4
1
3
W
4
1
4
Q
4
1
5
E
4
1
6
V
4
1
7
G
4
6
0
D
4
6
1
M
4
6
2
R
4
6
3
[1]4dvr.g 0ly 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yyl.g GSbif 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yyl.p Sbif 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1yym.g GSF 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i5y.g dprTbif 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i60.g dprTF 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3hi1.g S-Y-AVFY 53 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3hi1.j SHY-AVFY 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3tgq.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jzw.g dprTu2x 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k0a.a dprT1op 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ka2.a dprTu3x 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rwy.a R 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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