DYR_STAAU_2_158

Dihydrofolate reductase [Dihydrofolate reductase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (DYR_STAAU):D: DHFR (6:8,19:21,24,28:30,32,33,43,47,48,50,51,53,55,56,58,60,93,99,112)
R: Substrate binding (6,7)
6:8,19:21,24,28:30,32,33,43,47,48,50,51,53,55,56,58,60,93,99,112
Cofactors (cF):nap/ndp

Full PDB list

2w9g,2w9h,3f0b,3f0q,3f0s,3f0u,3f0v,3f0x,3fq0,3fqc,3fqf,3fqo,3fqv,3fqz,3fra,3frb,3frd,3fre,3frf,3fy8,3fy9,3fyv,3fyw,3i8a,3lg4,3m08,3m09,3sgy,3sh2,3sqy,3sr5,3srq,3srr,3srs,3sru,3srw,4fgg,4fgh,4lae,4lag,4lah,4lek,4q67,4q6a,4tu5,4xe6,4xec (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1 cF
L
6
V
7
A
8
N
1
9
Q
2
0
L
2
1
H
2
4
D
2
8
L
2
9
K
3
0
V
3
2
K
3
3
M
4
3
T
4
7
F
4
8
S
5
0
I
5
1
K
5
3
L
5
5
P
5
6
R
5
8
N
6
0
F
9
3
F
9
9
T
1
1
2
[1]4lek.x 1dn 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4lae.x 1vm 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4lag.x 1vn 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4lah.x 1vo 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3sh2.a 5dr 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3sru.x q26 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3srw.x q27 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3fqv.a 11f 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]3f0b.x 53r 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3f0s.x 53t 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3srr.x q20 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3srs.x m23 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3sr5.x q12 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3f0q.x 52v 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3fqc.a 55v 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3m08.a rar 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3srq.x q19 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4fgh.a 0u6 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4fgg.a 0u5 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3sqy.x q11 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]3sgy.a 06w 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3frd.x dhf 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3fra.x i2h 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3fq0.a n22 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4q67.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3fqz.a 11f 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3f0u.x 53r 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]3f0x.x 53t 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]3f0v.x 52v 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]3fqf.a 55v 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]3m09.a rar 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3fqo.a n22 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . ndp
[1]2w9h.a top 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4q6a.a none . . . . . - . . . . L . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3lg4.a 52v 29 . . . . . . . . . . Y . . . . . . . . . . . I . . ndp
[1]4xe6.x 06u 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3frb.x top 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3fy9.x xcf 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Y . nap
[1]3fyw.x xcf 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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