DYR_HUMAN_2_187

Dihydrofolate reductase [Dihydrofolate reductase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (DYR_HUMAN):D: DHFR (8:10,17,18,21:23,29,31:33,35,36,54:57,60:62,64,65,68,71,76:78,116:120,122,137)
R: Substrate binding (31:33,35,36)
8:10,17,18,21:23,29,31:33,35,36,54:57,60:62,64,65,68,71,76:78,116:120,122,137
Cofactors (cF):nap/ndp

Full PDB list

1boz,1dhf,1dlr,1dls,1drf,1hfp,1hfq,1hfr,1kms,1kmv,1mvs,1mvt,1ohj,1ohk,1pd8,1pd9,1pdb,1s3u,1s3v,1s3w,1u71,1u72,2c2s,2c2t,2dhf,2w3a,2w3b,2w3m,3eig,3f8y,3f8z,3f91,3fs6,3ghc,3ghv,3ghw,3gi2,3gyf,3l3r,3n0h,3ntz,3nu0,3nxo,3nxr,3nxt,3nxv,3nxx,3nxy,3nzd,3oaf,3s3v,3s7a,4ddr,4g95,4kak,4kbn,4kd7,4keb,4kfj,4m6j,4m6k,4m6l,4qhv,4qjc (redundant pocketome entry)

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ligand
A1 cF
I
8
V
9
A
1
0
I
1
7
G
1
8
G
2
1
D
2
2
L
2
3
R
2
9
E
3
1
F
3
2
R
3
3
F
3
5
Q
3
6
G
5
4
K
5
5
K
5
6
T
5
7
S
6
0
I
6
1
P
6
2
K
6
4
N
6
5
L
6
8
R
7
1
L
7
6
S
7
7
R
7
8
V
1
1
6
G
1
1
7
G
1
1
8
S
1
1
9
S
1
2
0
Y
1
2
2
T
1
3
7
[1]4keb.a 1qz 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4kfj.a 1r0 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4kfj.b fol,mg 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4kd7.a 9dr 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nzd.a d2q.ndp 80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2w3b.a fol,vg9 59 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3ntz.a 3tz 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3s7a.a 684 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3nxv.a d2f 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nxy.a d2h 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1kms.a lih 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1kmv.a lii 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1boz.a prd 25 . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4ddr.a mmv 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nu0.a 3tu 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nxo.a d2b 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nxt.a d2e 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4kbn.a 25u 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4kbn.b 25u,mg 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3nxr.a d2d 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]2dhf.b dzf 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1dlr.a mxa 24 . . . . . . . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4qjc.a ixe 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4qhv.a ixf 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1hfp.a mot 32 . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1s3w.a tqt 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]4kak.b 06u 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]4m6l.a 21v 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . nap
[1]1dls.a mtx 33 . . . . . . . Y . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3gyf.a 51p 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3l3r.a oag 22 . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3f8y.a dh1 25 . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]2w3a.a top 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1pdb.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1pd9.a co4 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mvt.a dtm 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s3v.a tqd 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3nxx.a d2d,d2d 50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1u71.a mxa 24 . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hfq.a mot 32 . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1u72.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1drf.a fol 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3oaf.a oag 22 . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . .
[1]3f8z.a dh1 25 . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1ohk.a cop 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3n0h.a top,top 42 . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . .
[1]2c2s.b 34b 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]1hfr.a mot 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3eig.a mtx 33 . . . . . . . . . . R . . E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4g95.a oag 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3f91.a dh1 25 . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3s3v.a top,top 42 . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . .
[1]2c2t.b 39b,39e 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3fs6.a dh1 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3ghc.a ghc 32 . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3ghv.a ghc 32 . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3ghw.a ghw 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp
[1]3gi2.a ghw 31 . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ndp

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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