DYR_ECOLI_1_159

Dihydrofolate reductase [Dihydrofolate reductase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (DYR_ECOLI):D: DHFR (5:8,14:20,23,27:32,42,46,47,49:52,54,57,61,94:96,100,113)5:8,14:20,23,27:32,42,46,47,49:52,54,57,61,94:96,100,113
Cofactors (cF):nap/ndp

Full PDB list

1ddr,1dds,1dhi,1dhj,1dra,1drb,1dre,1drh,1dyh,1dyi,1dyj,1jol,1jom,1ra1,1ra2,1ra3,1ra8,1ra9,1rb2,1rb3,1rc4,1rd7,1re7,1rf7,1rg7,1rh3,1rx1,1rx2,1rx3,1rx4,1rx5,1rx6,1rx7,1rx8,1rx9,1tdr,2ano,2anq,2d0k,2drc,3dau,3drc,3k74,3kfy,3och,3ql0,3ql3,3qyl,3qyo,3r33,4dfr,4eig,4eiz,4ej1,4fhb,4gh8,4i13,4i1n,4kjj,4kjk,4kjl,4nx6,4nx7,4or7,4osg,4p3q,4p3r,4p66,4p68,4pdj,4pss,4pst,4psy,4pth,4ptj,4qle,5cc9,5ccc,5dfr,6dfr (redundant pocketome entry); 2inq,4qlf,4qlg,4rgc,4x5f,4x5g,4x5h,4x5i,4x5j,5dxv,5e8q,5eaj,7dfr (unprocessed)

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ligand
A1 cF
I
5
A
6
A
7
L
8
I
1
4
G
1
5
M
1
6
E
1
7
N
1
8
A
1
9
M
2
0
N
2
3
D
2
7
L
2
8
A
2
9
W
3
0
F
3
1
K
3
2
M
4
2
T
4
6
W
4
7
S
4
9
I
5
0
.
5
0
A
G
5
1
R
5
2
L
5
4
R
5
7
I
6
1
I
9
4
G
9
5
G
9
6
Y
1
0
0
T
1
1
3
[1]4or7.a 25u 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . V . . . . . nap
[1]1dyh.a dzf 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]3kfy.a jzm 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]4osg.a 06u 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . V . . . . . nap
[1]1rf7.a dhf 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]2ano.a 817 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]2anq.a c1a 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]3r33.a 6me,ca,ca 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]3qyl.a 7me 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]3qyo.a q24 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . ndp
[1]1drh.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]1jom.a ffo 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]1rx5.a ddf 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]1dhj.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]1dra.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . E . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]5cc9.a ddf 32 . . . . . . . . . . . . . F . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]1drb.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]3k74.a I-GIIT-TI 50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]3och.a 2mx 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]4eig.a WY-YYC-GLAGPAYWG 119 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]1rg7.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]2d0k.a fol 32 . . . . . . N . . . L . . . . . . . Y . . . . - . . . . . . . . . .
[1]3ql0.a fol 32 . . . . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]6dfr.a ca 1 . . . . . . - - - - - . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]1tdr.a mtx,te 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]2drc.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . .
[1]4gh8.b mtx 33 . . . . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . P N . . . . . . . . . ndp
[1]4p66.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]4p68.a mtx 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . * . . . . . . . nap
[1]4pss.a fol 32 M I S A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . - G . . . . . . nap
[1]4psy.a fol 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap
[1]4qle.a fol 32 . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . nap

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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