DPO3B_ECOLI_1_366

DNA polymerase III subunit beta

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (DPO3B_ECOLI):R: II (152,154,155,172,174:177,240,242:244,246,247)
R: III (278,279,320,323,343,344,346,360:365)
152,154,155,172,174:177,240,242:244,246,247,278,279,320,323,343,344,346,360:365

Full PDB list

1jqj,1jql,1mmi,1ok7,1unn,2pol,2xur,3bep,3d1e,3d1f,3d1g,3f1v,3pwe,3q4j,3q4k,3q4l,3qsb,4k3k,4k3l,4k3m,4k3o,4k3p,4k3q,4k3r,4k3s,4k74,4mjp,4mjq,4mjr,4n94,4n95,4n96,4n97,4n98,4n99,4n9a,4ovf,4ovg,4ovh,4pnu,4pnv,4pnw (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
R
1
5
2
Y
1
5
4
L
1
5
5
T
1
7
2
G
1
7
4
H
1
7
5
R
1
7
6
L
1
7
7
R
2
4
0
P
2
4
2
D
2
4
3
Y
2
4
4
R
2
4
6
V
2
4
7
F
2
7
8
R
2
7
9
N
3
2
0
Y
3
2
3
S
3
4
3
V
3
4
4
S
3
4
6
V
3
6
0
V
3
6
1
M
3
6
2
P
3
6
3
M
3
6
4
R
3
6
5
[1]3d1f.a 323SEQVELEFD 108 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3qsb.a 743 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ovh.a 2ve 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4pnu.a 2vd 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3d1g.b 322 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mjp.b 27o 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ovg.a 2vf 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mjq.a 27r 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3k.a sfk 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mjr.a 0la 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n99.a 2j1 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n9a.a 2j2 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4ovf.a 2vg 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4n98.a 4fc 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4n95.a 2hq 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n97.a 2hu 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n94.a 2ho 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n96.a 6ni 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jqj.a E-QAMSLFAS 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jqj.b QAMSLFA 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4pnw.a 2vm 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]1jql.a E-QAMSLFAS-L 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mmi.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ok7.b RQLVLGL 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1unn.a ERQLVLGL 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3d1e.a GQLGLF 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3f1v.b none A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3q4j.c aceQLDLF 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3q4k.b aceQalcDL200 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3q4l.a aceQalcDLzcl 53 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3l.a aceLF 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3m.a DLF 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3o.a aceQADLF 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3p.a aceQLALF 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3q.a aceQLDAF 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k3r.a aceQLDLA 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4k74.a QLNLF 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4k74.b AQLNLF 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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