DOT1L_HUMAN_1_335

Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific [Class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. DOT1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (DOT1L_HUMAN):D: DOT1 (129:131,133:140,143,144,147,161:166,168,169,185:188,221:224,239:241,243,245,249,267:269,310:312)
R: S-adenosyl-L-methionine binding (161:166,168)
R: S-adenosyl-L-methionine binding (222,223)
129:131,133:140,143,144,147,161:166,168,169,185:188,221:224,239:241,243,245,249,267:269,310:312

Full PDB list

1nw3,3qow,3qox,3sr4,3sx0,3uwp,4ek9,4ekg,4eki,4eqz,4er0,4er3,4er5,4er6,4er7,4hra,4wvl,5drt,5dry,5dsx,5dt2,5dtm,5dtq,5dtr,5juw (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
E
1
2
9
P
1
3
0
F
1
3
1
P
1
3
3
E
1
3
4
V
1
3
5
Y
1
3
6
G
1
3
7
E
1
3
8
T
1
3
9
S
1
4
0
L
1
4
3
V
1
4
4
M
1
4
7
D
1
6
1
L
1
6
2
G
1
6
3
S
1
6
4
G
1
6
5
V
1
6
6
Q
1
6
8
V
1
6
9
V
1
8
5
E
1
8
6
K
1
8
7
A
1
8
8
G
2
2
1
D
2
2
2
F
2
2
3
L
2
2
4
F
2
3
9
V
2
4
0
N
2
4
1
F
2
4
3
F
2
4
5
V
2
4
9
V
2
6
7
S
2
6
8
S
2
6
9
V
3
1
0
S
3
1
1
Y
3
1
2
[1]5drt.a 5eg 29 - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dt2.a 5ev 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dsx.a 5ew 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dry.b 5ek 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[4]4eqz.a aw0 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ekg.a 0qj 37 - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4er7.a aw3 37 . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dtr.a 5f7 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4er0.a aw1 39 - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dtq.b 5f6 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4er6.a aw2 40 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5juw.a 6nr 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3sx0.a sx0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3sr4.a tt8 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dtm.b 5f4 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hra.a ep6 41 . . - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4eki.a 0qk 39 - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4ek9.a ep4 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]3uwp.a 5id 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wvl.a 3us 47 - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3qox.a sah 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3qow.a sam 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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