DNLJ_ENTFA_1_325

DNA ligase [NAD-dependent DNA ligase family. LigA subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (DNLJ_ENTFA):25,26,29,30,35,37:39,42,43,84:89,91,118:121,125,141,173,175,227,228,289,291,303,308,310,311,31525,26,29,30,35,37:39,42,43,84:89,91,118:121,125,141,173,175,227,228,289,291,303,308,310,311,315

Full PDB list

1ta8,1tae,3ba8,3ba9,3baa,3bab,4eeq,4efb,4efe,4lh6,4lh7

Contact map

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ligand
A1
Y
2
5
S
2
6
Y
2
9
Y
3
0
P
3
5
V
3
7
E
3
8
D
3
9
Y
4
2
D
4
3
I
8
4
P
8
5
M
8
6
Y
8
7
S
8
8
L
8
9
D
9
1
E
1
1
8
L
1
1
9
K
1
2
0
I
1
2
1
A
1
2
5
R
1
4
1
R
1
7
3
E
1
7
5
Y
2
2
7
T
2
2
8
V
2
8
9
K
2
9
1
F
3
0
3
P
3
0
8
W
3
1
0
A
3
1
1
K
3
1
5
[1]3baa.a 3ba 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3bab.a 3bd 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ba9.a 3b9 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4efe.a 0ov 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4efb.a 0ow 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ba8.a 3b8 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4eeq.a 0ox 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lh7.a 1x8 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lh6.a 1x7 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ta8.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tae.a nad 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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