DCK_HUMAN_3_260

Deoxycytidine kinase [DCK/DGK family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (DCK_HUMAN):30,31,34,35,53,55,56,58,59,82,85,86,89,90,96,97,100,104,127,128,133,137,140,141,144:146,192,194,196,197,199:201,204,20730,31,34,35,53,55,56,58,59,82,85,86,89,90,96,97,100,104,127,128,133,137,140,141,144:146,192,194,196,197,199:201,204,207
Cofactors (cF):adp/udp

Full PDB list

1p5z,1p60,1p61,1p62,2a2z,2a30,2a7q,2no0,2no1,2no6,2no7,2no9,2noa,2qrn,2qro,2zi3,2zi4,2zi5,2zi6,2zi7,2zi9,2zia,3hp1,3ipx,3ipy,3kfx,3mjr,3qej,3qen,3qeo,4jlj,4jlk,4jlm,4jln,4kcg,4l5b,4q18,4q19,4q1a,4q1b,4q1c,4q1d,4q1e,4q1f (redundant pocketome entry)

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ligand
A1 cF
I
3
0
A
3
1
K
3
4
S
3
5
E
5
3
V
5
5
A
5
6
W
5
8
C
5
9
L
8
2
M
8
5
Y
8
6
P
8
9
E
9
0
F
9
6
Q
9
7
A
1
0
0
R
1
0
4
E
1
2
7
R
1
2
8
D
1
3
3
F
1
3
7
N
1
4
0
L
1
4
1
S
1
4
4
E
1
4
5
C
1
4
6
R
1
9
2
R
1
9
4
E
1
9
6
E
1
9
7
G
1
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9
I
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0
0
P
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0
1
Y
2
0
4
K
2
0
7
[1]4jln.a 18v 30 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4jlj.a 1nm,1nm 54 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4jlm.a 1nn,1nn 58 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4jlm.b 1nn 29 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4jlk.a 1no,1no 56 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4kcg.b 1qc 34 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4l5b.b 1ux 32 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q18.b 2xj,2xj 64 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q19.b 2xl 27 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q1c.b 2xm 32 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q1f.a 2xn 33 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q1a.b 2xz 30 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q1b.a 2y0 32 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]4q1d.b 2y1 31 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]3ipy.a b87,b87,mlt 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4q1e.a 2y7,2y8 58 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]2no6.b etv 16 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]2noa.a 3tc 15 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]2no9.a ltt 15 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]1p62.b geo,mg 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . adp
[2]2a7q.a cfb,mg 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . adp
[1]3mjr.a ac2 16 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]3mjr.d ac2 16 . . . . . . - . - . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]3qen.b 5bt 17 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]3ipx.a b86,mg 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . adp
[2]3kfx.a mcy 17 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]2qro.a d5m 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . udp
[2]2qro.c d5m,mg 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . udp
[2]2qrn.b dcm 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . udp
[2]2zi7.b gng 19 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]2zi3.b 3d1 18 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[1]2zi5.b 3l1 18 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[1]2zi5.d 3l1 18 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]1p5z.b ar3,mg 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . adp
[2]3hp1.a llt 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . M . . A . . . . . . . . . . . . . . . adp
[1]3qeo.b llt 17 . . . . . . . . S . . . . . . . . M . . A . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]1p60.b dcz 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . adp
[2]2a2z.b dcz,mg 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . udp
[1]3qej.a none . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]2no0.b geo 18 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]2zia.a cl9 19 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]2zi4.a 3l1,mg 19 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[1]2zi6.a 3d1 18 . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . udp
[2]2no1.a dcz 16 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp
[2]2no7.b ldc 16 . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . adp

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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