CYB2_YEAST_181_591

Cytochrome b2, mitochondrial

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (CYB2_YEAST):D: FMN hydroxy acid dehydrogenase (219,223,224,275:279,308,310,332,334,360,366,369,376,405,406,429,451,453,454,456,489:491,493,511:513,516)107,109,116,119,123:125,129,130,138,141,142,145:147,150,151,154,155,177,219,223,224,275:279,308,310,332,334,360,366,369,376,405,406,429,451,453,454,456,489:491,493,511:513,516
Metals (Me):Fe

Full PDB list

1fcb,1kbi,1kbj,1lco,1ldc,1ltd,1qcw,1sze,1szf,1szg,2oz0

Contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1 Me
V
1
0
7
I
1
0
9
L
1
1
6
F
1
1
9
H
1
2
3
P
1
2
4
G
1
2
5
V
1
2
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I
1
3
0
V
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3
8
I
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4
1
F
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4
2
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1
4
5
H
1
4
6
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4
7
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0
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1
5
4
I
1
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5
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7
7
Q
2
1
9
Y
2
2
3
Y
2
2
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2
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5
A
2
7
6
T
2
7
7
A
2
7
8
L
2
7
9
S
3
0
8
L
3
1
0
Q
3
3
2
Y
3
3
4
T
3
6
0
L
3
6
6
R
3
6
9
K
3
7
6
F
4
0
5
I
4
0
6
K
4
2
9
S
4
5
1
H
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5
3
G
4
5
4
R
4
5
6
D
4
8
9
G
4
9
0
G
4
9
1
R
4
9
3
L
5
1
1
G
5
1
2
R
5
1
3
L
5
1
6
[1]1qcw.a fns 35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1sze.a 173,fmn 42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1lco.a fmn,hem,ppy,res 86 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1lco.b fmn,ppy 43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fcb.b fmn,pyr 37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1szg.a fns 35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kbi.a fmn,hem,res 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1kbj.a fmn 31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ldc.a fmn,hem,pyr,res 80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1ldc.b fmn,pyr 37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ltd.a hem,res,so3.fmn 78 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe
[1]1ltd.b so3.fmn 35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1szf.a fmn,pyr 37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2oz0.a fe,fmn,hem 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Q . . . . . . . . . .
[1]2oz0.b fmn,pyr 37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Q . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
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