COBT_SALTY_1_356

Nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase [CobT family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (COBT_SALTY):78,80,84,88,174:180,202,203,264:266,291,293,314:31778,80,84,88,174:180,202,203,264:266,291,293,314:317

Full PDB list

1d0s,1d0v,1jh8,1jha,1jhm,1jho,1jhp,1jhq,1jhr,1jhu,1jhv,1jhx,1jhy,1l4b,1l4e,1l4f,1l4g,1l4h,1l4k,1l4l,1l4m,1l4n,1l5f,1l5k,1l5l,1l5m,1l5n,1l5o,4kqf,4kqg,4kqh,4kqi,4kqj,4kqk (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
A
7
8
S
8
0
V
8
4
Q
8
8
E
1
7
4
L
1
7
5
G
1
7
6
M
1
7
7
A
1
7
8
N
1
7
9
T
1
8
0
G
2
0
2
A
2
0
3
G
2
6
4
F
2
6
5
L
2
6
6
S
2
9
1
E
2
9
3
R
3
1
4
L
3
1
5
G
3
1
6
E
3
1
7
[1]1jhq.a nio,pmo 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l5m.a 7ra,nio 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jha.a aam,nio 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhr.a nio,p2p 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jho.a nio,rmb 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l5k.a 1rb,nio 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l5l.a 7rp,nio 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4f.a 150,ncn 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1d0v.a nio,rbz 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhp.a 5ob 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhm.a 5mb 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1d0s.a dmd 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jh8.a ade 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4g.a mct,ncn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4e.a rbz 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kqg.a dmd 11 . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhu.a pcr 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4h.a ind,ncn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kqi.a nio,rbz 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
[1]1jhv.a nio,pcr 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4k.a 34a,ncn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhx.a iph 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4l.a ncn,xyd 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jhy.a iph,nio 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4m.a 2ac,ncn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4b.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l5o.a 2mp,ncn 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l4n.a 2af,nio 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kqj.a ncn,pcr 30 . Y . M . M . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l5f.a bzi 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kqf.a ade 10 . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kqh.a none . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . A
[1]4kqk.a pcr 8 . Y . M . M . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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