CDK8_HUMAN_1_363

Cyclin-dependent kinase 8 [Protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (CDK8_HUMAN):D: Protein kinase (27,28,32,35,50,52,62,65,66,69,70,73,78,79,97:101,103,105,106,142,147:149,155,156,158,171:176)
356
27,28,32,35,50,52,62,65,66,69,70,73,78,79,97:101,103,105,106,142,147:149,155,156,158,171:176,356

Full PDB list

3rgf,4crl,4f6s,4f6u,4f6w,4f70,4f7j,4f7l,4f7n,4f7s,4g6l,5bnj,5cei,5fgk,5hbe,5hbh,5hbj,5hnb,5hvy,5i5z

Contact map

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ligand
A1
V
2
7
G
2
8
Y
3
2
V
3
5
A
5
0
K
5
2
S
6
2
R
6
5
E
6
6
L
6
9
L
7
0
L
7
3
V
7
8
I
7
9
F
9
7
D
9
8
Y
9
9
A
1
0
0
E
1
0
1
D
1
0
3
W
1
0
5
H
1
0
6
L
1
4
2
V
1
4
7
L
1
4
8
H
1
4
9
A
1
5
5
N
1
5
6
L
1
5
8
I
1
7
1
A
1
7
2
D
1
7
3
M
1
7
4
G
1
7
5
F
1
7
6
R
3
5
6
[1]4f7l.a 0so 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - .
[1]4f6u.a 0sr 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4f70.a 0st 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - .
[1]4f7n.a 0sv 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bnj.a 4tv 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fgk.a 5xg 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hbe.a 5y6 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hbh.a 5y7 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hbj.a 5y8 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hnb.a 62m 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hvy.a 66x 34 . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5i5z.a 68u 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4crl.a c1i 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4f7j.a 0su 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cei.a 50r 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3rgf.a bax 32 . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4f7s.a 0sw 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4f6s.a 0sq 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4f6w.a 0ss 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4g6l.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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