CD44_MOUSE_21_171

CD44 antigen

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (CD44_MOUSE):D: Link (37,39,42:44,78:81,90,96,98:101,107)
27:29,151:153
27:29,37,39,42:44,78:81,90,96,98:101,107,151:153

Full PDB list

2jcp,2jcq,2jcr,4mrd,4mre,4mrf,4mrg,4mrh,4np2,4np3,5bzc,5bze,5bzf,5bzg,5bzh,5bzi,5bzj,5bzk,5bzl,5bzm,5bzn,5bzo,5bzp,5bzq,5bzr,5bzs,5bzt (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
N
2
7
V
2
8
T
2
9
H
3
7
E
3
9
G
4
2
R
4
3
Y
4
4
T
7
8
C
7
9
R
8
0
Y
8
1
I
9
0
N
9
6
I
9
8
C
9
9
A
1
0
0
A
1
0
1
Y
1
0
7
V
1
5
1
N
1
5
2
R
1
5
3
[1]5bzs.a 4xk 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzr.a 4xm 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzm.a 4x8 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzq.a 4xl 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzj.a 4wn 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4np3.a 2l2 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzt.a 4xj 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4np2.a 2l1 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzl.a 4wo 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzo.a 4xc 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzp.a 4xg 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzk.a 4wp 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzn.a 4xd 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzh.a 4x1 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzf.a 4x3 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzc.a 4wt 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzg.a 4x6 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bze.a 68n,6bt 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mrg.a 24w 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5bzi.a 4wu 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mrf.a 2ck 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2jcr.a nag.bdp.nag.bdp.nag.bdp.nag 93 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mrd.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mre.a 2c9 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
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