CBPB1_PIG_192_416

Carboxypeptidase B [Peptidase M14 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (CBPB1_PIG):R: Substrate binding (176,178,179)
R: Substrate binding (251,252)
R: Substrate binding (305,306)
232,234,262,270,271,304,307,311,315,355:358,361,363,376,378,387
176,178,179,232,234,251,252,262,270,271,304:307,311,315,355:358,361,363,376,378,387
Metals (Me):Zn

Full PDB list

1nsa,1z5r,1zg7,1zg8,1zg9,2jew,2piy,2piz,2pj0,2pj1,2pj2,2pj3,2pj4,2pj5,2pj6,2pj7,2pj8,2pj9,2pja,2pjb,2pjc,3glj,3wab,3wc5,3wc6,3wc7,4uia,4uib,4z65,5lrg,5lrj,5lrk,5lyd,5lyf,5lyi,5lyl (redundant pocketome entry)

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ligand
A1 Me
H
1
7
6
R
1
7
8
E
1
7
9
M
2
3
2
R
2
3
4
N
2
5
1
R
2
5
2
G
2
6
2
E
2
7
0
T
2
7
1
H
3
0
4
S
3
0
5
Y
3
0
6
S
3
0
7
L
3
1
1
S
3
1
5
I
3
5
5
Y
3
5
6
P
3
5
7
A
3
5
8
G
3
6
1
D
3
6
3
T
3
7
6
E
3
7
8
F
3
8
7
[1]2pj6.a 059 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj7.b 235 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj9.a 281 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2piy.a 528 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj1.a 578 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2piz.c 606 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lyf.a 7b6 31 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]2pj2.a 864 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj3.a 86a 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj0.a 922 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3wc7.a ef1 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4uia.a fh9 29 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]4uib.a gwx 34 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]2pj5.a 11b 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lyi.a t4f 35 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]5lyl.a t5f 35 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]2pj8.b 17a 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pj4.b 414 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2jew.a 720 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1zg7.b p20 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1zg8.a l98 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lyd.a 7b0 14 . . . . . . . . . . . . . . V . L . L . . . . . . Zn
[1]5lrg.a 73n.dlyV73o.maaF 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lrj.a 73p.dlyV73o.maaF 58 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1zg9.a l06 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3wab.a ddw,zn 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pja.b 33z 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pjb.a 983 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2pjc.a 343 45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[2]1nsa.a ben 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lrk.c 73n.dly.iil.73o.maaF 61 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[2]3glj.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3wc5.a ddk,zn 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3wc6.a zn 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4z65.a 0x9 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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