CATL1_HUMAN_114_333

Cathepsin L1 [Peptidase C1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (CATL1_HUMAN):131:139,174:176,178:185,248,251:254,257,258,273:277,302,305,306,327131:139,174:176,178:185,248,251:254,257,258,273:277,302,305,306,327

Full PDB list

1cjl,1cs8,1icf,1mhw,2nqd,2vhs,2xu1,2xu3,2xu4,2xu5,2yj2,2yj8,2yj9,2yjb,2yjc,3bc3,3h89,3h8b,3h8c,3hha,3hwn,3iv2,3k24,3kse,3of8,3of9,4axl,4axm,5f02,5i4h (redundant pocketome entry)

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ligand
A1
N
1
3
1
Q
1
3
2
G
1
3
3
Q
1
3
4
C
1
3
5
G
1
3
6
S
1
3
7
C
1
3
8
W
1
3
9
G
1
7
4
N
1
7
5
E
1
7
6
C
1
7
8
N
1
7
9
G
1
8
0
G
1
8
1
L
1
8
2
M
1
8
3
D
1
8
4
Y
1
8
5
A
2
4
8
A
2
5
1
G
2
5
2
H
2
5
3
E
2
5
4
L
2
5
7
F
2
5
8
D
2
7
3
M
2
7
4
D
2
7
5
H
2
7
6
G
2
7
7
W
3
0
2
E
3
0
5
W
3
0
6
A
3
2
7
[1]3hwn.a bd3 34 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3hha.a now,pg4 41 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3hha.b now,pge 38 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3hha.c now 28 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4axm.i v65 29 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xu3.a btb,xu3 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xu4.a djt 35 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xu5.a xu5 35 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2yj2.a yj2 35 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2yj8.a yj8 35 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f02.a 5t9 38 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2yj9.a yj9 38 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mhw.b bp4Cdar,bp4CdarYpea 85 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1cjl.a none . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2yjc.a 424 35 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]1cs8.a none . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1icf.a VHPGSFR-QCYGSIGYCW-VPNTRSRGHH 218 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2nqd.b NPTTGFAW-K-YFPPDSKLLGAGGTE-TYMRPW-FT 258 . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vhs.b none . . . . . . A S Y . . . . . . . . . . . . . . . . . . S L N . A . . . .
[1]3bc3.b opt 60 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3h89.a nsx 71 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3h8b.a nsy 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3h8b.c nsy,nsy 140 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3h8c.a nsz 53 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3iv2.a none . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3k24.a QLA 22 . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3kse.a MIPGGLS-IVDKV-TQVVAGTNY-FKSL-L 192 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3of8.a i0y 39 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3of9.a i0x 38 . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4axl.a zn 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5i4h.b none - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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