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CAH2_HUMAN_2_260

Carbonic anhydrase 2 [Alpha-carbonic anhydrase family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (CAH2_HUMAN):D: Alpha-carbonic anhydrase (3:5, 7, 57, 58, 60, 62, 64:67, 69:73, 91, 92, 94, 96, 119, 121, 123, 129:132, 134, 135, 140, 142, 197:201, 203, 206, 208, 243)
R: Substrate binding (198, 199)
0
0, 3:5, 7, 57, 58, 60, 62, 64:67, 69:73, 91, 92, 94, 96, 119, 121, 123, 129:132, 134, 135, 140, 142, 197:201, 203, 206, 208, 243
Metals (Me):Zn

Full PDB list

1a42, 1bn3, 1bnm, 1bnn, 1bnt, 1cnw, 1cny, 1g4j, 1i8z, 1i91, 1if7, 1if9, 1xpz, 1xq0, 1zfk, 2gd8, 2qo8, 2wd2, 2wd3, 2x7s, 2x7t, 2x7u, 3bet, 3bl1, 3c7p, 3dd8, 3eft, 3hkt, 3kne, 3m2x, 3m3x, 3m67, 3m96, 3m98, 3mhm, 3ml2, 3mna, 3myq, 3n0n, 3nb5, 3oil, 3oku, 3qyk, 3ryz, 3rz1, 3rz7, 3s9t, 3sap, 3sax, 3t83, 3v7x, 4dz7, 4dz9, 4ilx, 4kuv, 4kuw, 4kuy, 4kv0, 4qsi, 4r59, 4rfc, 4riu, 4z1e, 4z1k, 4z1n, 4zwi, 4zx1, 5amd, 5dog, 5doh, 5drs, 5e2r, 5gmn, 5j8z, 5ljq, 5ljt, 5llc, 5lle, 5llh, 5n0d; 12ca, 1am6, 1avn, 1bcd, 1bic, 1bn1, 1bn4, 1bnq, 1bnu, 1bnv, 1bnw, 1bv3, 1ca2, 1ca3, 1cah, 1cai, 1caj, 1cak, 1cal, 1cam, 1can, 1cao, 1cay, 1caz, 1ccs, 1cct, 1ccu, 1cil, 1cim, 1cin, 1cnb, 1cnc, 1cng, 1cnh, 1cni, 1cnj, 1cnk, 1cnx, 1cra, 1cva, 1cvb, 1cvc, 1cvd, 1cve, 1cvf, 1cvh, 1dca, 1dcb, 1eou, 1f2w, 1fql, 1fqm, 1fqn, 1fqr, 1fr4, 1fr7, 1fsn, 1fsq, 1fsr, 1g0e, 1g0f, 1g1d, 1g3z, 1g45, 1g46, 1g48, 1g4o, 1g52, 1g53, 1g54, 1g6v, 1h4n, 1h9n, 1h9q, 1hca, 1hea, 1heb, 1hec, 1hed, 1hva, 1i90, 1i9l, 1i9m, 1i9n, 1i9o, 1i9p, 1i9q, 1if4, 1if5, 1if6, 1if8, 1kwq, 1kwr, 1lg5, 1lg6, 1lgd, 1lug, 1lzv, 1moo, 1mua, 1okl, 1okm, 1okn, 1oq5, 1ray, 1raz, 1rza, 1rzb, 1rzc, 1rzd, 1rze, 1t9n, 1tb0, 1tbt, 1te3, 1teq, 1teu, 1tg3, 1tg9, 1th9, 1thk, 1ttm, 1uga, 1ugb, 1ugc, 1ugd, 1uge, 1ugf, 1ugg, 1xeg, 1xev, 1yda, 1ydb, 1ydc, 1ydd, 1yo0, 1yo1, 1yo2, 1z9y, 1ze8, 1zfq, 1zge, 1zgf, 1zh9, 1zsa, 1zsb, 1zsc, 2abe, 2aw1, 2ax2, 2ca2, 2cba, 2cbb, 2cbc, 2cbd, 2cbe, 2eu2, 2eu3, 2ez7, 2f14, 2fmg, 2fmz, 2fnk, 2fnm, 2fnn, 2foq, 2fos, 2fou, 2fov, 2geh, 2h15, 2h4n, 2hd6, 2hkk, 2hl4, 2hnc, 2hoc, 2ili, 2nng, 2nno, 2nns, 2nnv, 2nwo, 2nwp, 2nwy, 2nwz, 2nxr, 2nxs, 2nxt, 2o4z, 2osf, 2osm, 2pou, 2pov, 2pow, 2q1b, 2q1q, 2q38, 2qoa, 2qp6, 2vva, 2vvb, 2weg, 2weh, 2wej, 2weo, 3b4f, 3bl0, 3ca2, 3caj, 3cyu, 3d8w, 3d92, 3d93, 3d9z, 3daz, 3dbu, 3dc3, 3dc9, 3dcc, 3dcs, 3dcw, 3dd0, 3dv7, 3dvb, 3dvc, 3dvd, 3efi, 3f4x, 3f8e, 3ffp, 3gz0, 3hfp, 3hkn, 3hkq, 3hku, 3hlj, 3hs4, 3ibi, 3ibl, 3ibn, 3ibu, 3ieo, 3igp, 3k2f, 3k34, 3k7k, 3kig, 3kkx, 3koi, 3kok, 3kon, 3ks3, 3kwa, 3l14, 3m04, 3m14, 3m1j, 3m1k, 3m1q, 3m1w, 3m2n, 3m2y, 3m2z, 3m40, 3m5e, 3m5s, 3m5t, 3mhc, 3mhi, 3mhl, 3mho, 3mmf, 3mnh, 3mni, 3mnj, 3mnk, 3mnu, 3mwo, 3mzc, 3n2p, 3n3j, 3n4b, 3ni5, 3nj9, 3oik, 3oim, 3okv, 3oy0, 3oyq, 3oys, 3p3h, 3p3j, 3p44, 3p4v, 3p55, 3p58, 3p5a, 3p5l, 3pjj, 3po6, 3pyk, 3r16, 3r17, 3rg3, 3rg4, 3rge, 3rj7, 3rld, 3ryj, 3ryv, 3ryx, 3ryy, 3rz0, 3rz5, 3rz8, 3s71, 3s72, 3s73, 3s74, 3s75, 3s76, 3s77, 3s78, 3s8x, 3sbh, 3sbi, 3t5u, 3t5z, 3t82, 3t84, 3t85, 3tmj, 3tvn, 3tvo, 3u3a, 3u45, 3u47, 3u7c, 3v2j, 3v2m, 3v3f, 3v3g, 3v3h, 3v3i, 3v3j, 3v5g, 3vbd, 3zp9, 4bcw, 4bf1, 4bf6, 4ca2, 4cac, 4cq0, 4e3d, 4e3f, 4e3g, 4e3h, 4e49, 4e4a, 4e5q, 4fik, 4fl7, 4fpt, 4frc, 4fu5, 4fvn, 4fvo, 4g0c, 4gl1, 4hba, 4hew, 4hey, 4hez, 4hf3, 4ht0, 4idr, 4ito, 4itp, 4iwz, 4js6, 4jsa, 4jss, 4jsw, 4jsz, 4k0s, 4k0t, 4k0z, 4k13, 4k1q, 4kap, 4kni, 4knj, 4l5u, 4l5v, 4l5w, 4lhi, 4lp6, 4m2r, 4m2u, 4m2v, 4m2w, 4mdg, 4mdl, 4mdm, 4mlt, 4mlx, 4mo8, 4mty, 4n0x, 4n16, 4pq7, 4pxx, 4pyx, 4pyy, 4pzh, 4q06, 4q07, 4q08, 4q09, 4q49, 4q6d, 4q6e, 4q78, 4q7p, 4q7s, 4q7v, 4q7w, 4q81, 4q83, 4q87, 4q8x, 4q8y, 4q8z, 4q90, 4q99, 4q9y, 4qef, 4qiy, 4qjm, 4qk1, 4qk2, 4qk3, 4qsa, 4qsb, 4qtl, 4qy3, 4r5a, 4r5b, 4rfd, 4rh2, 4riv, 4rn4, 4rux, 4ruy, 4ruz, 4wl4, 4ww6, 4xe1, 4y0j, 4ygj, 4ygk, 4ygl, 4ygn, 4yvy, 4ywp, 4yx4, 4yxi, 4yxo, 4yxu, 4yyt, 4z0q, 4z1j, 4zao, 4zwx, 4zwy, 4zwz, 4zx0, 5a6h, 5amg, 5aml, 5bnl, 5bru, 5brv, 5brw, 5byi, 5c8i, 5ca2, 5cac, 5cjl, 5clu, 5dsi, 5dsj, 5dsk, 5dsl, 5dsm, 5dsn, 5dso, 5dsp, 5dsq, 5dsr, 5e28, 5e2k, 5e2s, 5eh5, 5eh7, 5eh8, 5ehe, 5ehv, 5ehw, 5eij, 5ekh, 5ekj, 5ekm, 5eoi, 5fdc, 5fdi, 5flo, 5flp, 5flq, 5flr, 5fls, 5flt, 5fng, 5fnh, 5fni, 5fnj, 5fnk, 5fnl, 5fnm, 5g01, 5g03, 5g0b, 5g0c, 5jdv, 5je7, 5jeg, 5jeh, 5jep, 5jes, 5jg3, 5jg5, 5jgs, 5jgt, 5jmz, 5jn1, 5jn3, 5jn7, 5jq0, 5jqt, 5l3o, 5l6k, 5l6t, 5l70, 5l9e, 5ll4, 5ll8, 5llg, 5lmd, 5lvs, 5n0e, 5o07, 5sz0, 5sz1, 5sz2, 5sz3, 5sz4, 5sz5, 5sz6, 5sz7, 5t71, 5t72, 5t74, 5t75, 5tfx, 5th4, 5thi, 5thj, 5thn, 5ti0, 5txy, 5ty1, 5ty8, 5ty9, 5tya, 5u0d, 5u0e, 5u0f, 5u0g, 5uln, 5vgy, 5wex, 6ca2, 7ca2, 8ca2, 9ca2 (unprocessed)

Pocket contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1 Me
H
4
W
5
Y
7
L
5
7
L
6
0
N
6
2
H
6
4
A
6
5
F
6
6
N
6
7
E
6
9
F
7
0
D
7
1
D
7
2
S
7
3
I
9
1
Q
9
2
H
9
4
H
9
6
H
1
1
9
V
1
2
1
W
1
2
3
D
1
2
9
F
1
3
0
G
1
3
1
V
1
3
4
Q
1
3
5
L
1
4
0
V
1
4
2
L
1
9
7
T
1
9
8
T
1
9
9
P
2
0
0
P
2
0
1
L
2
0
3
V
2
0
6
W
2
0
8
[1]1a42.a bzu23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bn3.a al623 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnm.a al825 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnn.a al123 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnt.a al224 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1cnw.a eg118 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1cny.a eg319 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1g4j.a ffb,ffb50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . V . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1i8z.a inl30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1i91.a inq29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1if7.a sbr26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1if9.a sbb26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1xpz.a 4tz26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1xq0.a 4tr27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1zfk.a nr2,nr248 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2gd8.a po1,po156 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2qo8.a 3cc23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2wd2.a ms526 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2wd3.a ms4,ms448 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2x7s.a wzc,wzc52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2x7t.a wzb30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]2x7u.a wza,zn27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3bet.a ctf28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3bl1.a bl124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3c7p.a pof33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3dd8.a 2c724 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3eft.a 3bs26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3hkt.a 2sd26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3kne.a daw33 . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m2x.a bex24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m3x.a js724 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m67.a e3628 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m96.a e3825 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m98.a e0223 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3mhm.a j7529 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3ml2.a su027 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3mna.a dwh24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3myq.a e2728 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3n0n.a p9b25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3nb5.a r2124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3oil.a vz526 . . . . . . . S . Q . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3oku.a vz426 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3qyk.a ie224 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3ryz.a ryz24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3rz1.b rz127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3rz7.a rz730 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3s9t.a e4923 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3sap.a e2i24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3sax.a e5023 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3t83.a mg5,sg556 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3v7x.a d7a25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4dz7.a d0223 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4dz9.a id426 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4ilx.a 1ez24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kuv.a mb624 - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kuw.a mb224 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kuy.a mb424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kv0.a mb723 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4qsi.a ewz26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4r59.a 3j325 . . . . . . . S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . A . . Zn
[1]4rfc.a 3o123 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4riu.a 3qr30 . . . . . . . S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . A . . Zn
[1]4z1e.a df524 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4z1k.a 4kb24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4z1n.a 4kd22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zwi.a 62i28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx1.a 5l328 . . . . . . . S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . A . . Zn
[1]5amd.a 45i25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5dog.a 5dt30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5doh.a 5du27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5drs.a 5ef29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5e2r.a 52025 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5gmn.a 94925 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5j8z.a 6ke,fc464 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5ljq.a anv23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5ljt.a a6n23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5llc.a v2626 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lle.a v5125 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5llh.a v4924 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5n0d.a 8f230 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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PDB.ch
A1 Me
.
0
A
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3
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[1]1bn3.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnm.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnn.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1bnt.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1cnw.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1cny.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1g4j.a - . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . V . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1i8z.a - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1i91.a - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1if7.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1if9.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1xpz.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]1xq0.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
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[1]2gd8.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
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[1]2wd2.a - . . . . . . . . . . . * . . . . - . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
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[1]3kne.a - - . . . . . . * C . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3m2x.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
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[1]3sax.a - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3t83.a - - . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3v7x.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
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[1]4kuv.a - - - . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kuw.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kuy.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4kv0.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4qsi.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . Zn
[1]4r59.a - . . . . . . . * * S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . . A . . . Zn
[1]4rfc.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4riu.a - . . . . . . . * * S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . . A . . . Zn
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[1]4zwi.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx1.a - - . . . . . . * * S . Q T . . . . L . . . . . . . V . . . . . . . . . . . A . . . Zn
[1]5amd.a - - . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5dog.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5doh.a - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5drs.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5e2r.a G . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5gmn.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5j8z.a G . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5ljq.a - . . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5ljt.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]5llc.a - . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . Zn
[1]5lle.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . * . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . Zn
[1]5llh.a - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . Zn
[1]5n0d.a G . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . Zn

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1a42.a:bzu
1bn3.a:al6
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[1] 1a42.a
0
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[1] 1bnm.a 0.1 0
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[1] 1bnn.a 0.1 0 0
0.1
0 0 0 2.2 0 0 0 0.1 0 0.3 0.4 0.2 0 0.2 0.5 0.1 0 0.5 0.7 0.4 0.9 0.1 0 0 0 0.1 0 0.1 0.1 0.1 0 0 0.1 0.1 0 0 0.1 0.5 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0 0.1 2.1 0 0.1 0.1 0 0.1 0 0 0 0.1 0.8 0 1.2 0 0 0 0.1 0.3 0 0.3 0.5 0.1 0 1.7 0.2 0 0 0.4 0.1 0.1 0
[1] 1bnt.a 0 0 0 0.1
0
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[1] 1cnw.a 1.1 0 0 0.1 0
0
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[1] 4z1k.a 0.2 0.2 0.1 0.4 0.1 0 0 2.6 0.2 0.3 0 0.2 0 0.3 0.1 0.8 0 0.2 1.3 0.9 0.1 1.2 0.4 0.2 1.0 0 0.1 0 0 0.4 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0.2 0.3 0.1 0 0 0.2 0.1 0 0.1 1.4 0 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 1.2 0 1.8 0
0
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[1] 4z1n.a 0.2 0.2 0.2 0.3 0.1 0 0 2.6 0.2 0.3 0.1 0.2 0.1 0.4 0.1 0.8 0 0.2 1.3 0.8 0.1 1.2 0.4 0.2 1.1 0 0.2 0 0 0.4 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0 0.2 0.4 0.3 0 0 0.2 0.1 0 0.1 1.4 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.2 0 1.8 0 0
0
0 1.1 0 0.2 0.5 0.3 0.2 2.5 0.2 0.1 0 0.7 0.1 0.1 0.1
[1] 4zwi.a 1.0 0.2 0.1 0.4 0.1 0 0 2.8 0.2 0.2 0.1 0.3 0.1 0.5 0.1 0.8 0 0.2 1.4 0.9 0.1 0.9 0.5 0.3 1.7 0 0.1 0 0.4 1.5 0 0.5 0.6 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0 1.3 0.4 1.3 0.1 0.1 0.2 0.6 0 0.5 1.6 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0.1 0.1 0.9 1.2 0 1.8 0 0 0
0.1
0.8 0.1 0.7 1.4 0.2 0.2 2.7 0.3 0.1 0 0.5 0.1 0.1 0
[1] 4zx1.a 1.3 0.1 0.2 0.1 0.1 0 0 0.8 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.6 0.9 0 0.5 1.4 0.8 0.1 0.4 0.5 0.2 0.5 0.1 0.1 0.1 1.1 1.8 0 0.6 0.7 0.2 0.3 0.1 0.2 0.2 0.1 0 1.6 0.3 1.3 0 0 0.1 0.6 0 0.5 2.1 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.1 0 0.1 0 0 0 0 0
0
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[1] 5amd.a 1.2 0.2 0.2 0.3 0.1 0 0 2.6 0.1 0.2 0 0.2 0.1 0.4 0.1 0.8 0 0.2 1.3 0.7 0.2 0.9 0.4 0.1 1.2 0 0.1 0 0.6 1.7 0 0.5 1.0 0.3 0.1 0.1 0.2 0.2 0.1 0 1.5 0.3 1.5 0 0 0.1 0.5 0 0.5 1.8 0 0.2 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.4 0.7 0.1 1.4 0 0 0 0 0.7
0
1.3 1.8 0.4 0.1 2.1 0.3 0.1 0 0.6 0.1 0.1 0
[1] 5dog.a 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.1 0.1 3.1 0.3 0.3 0.1 0.1 0.1 0.3 0.3 0.9 0 0.2 1.2 0.9 0.2 1.2 0.7 0.1 1.3 0.1 0.2 0 0.1 0.4 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.2 0.1 0.1 0.1 0.2 0.7 0.2 0.1 0.1 0.2 0.1 0.1 0.1 1.4 0.2 0.2 0.2 0.3 0.3 0.1 0.1 0.3 0 1.0 0.1 1.8 0.1 0 0 0 0.9 0.1
0.2
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[1] 5doh.a 0.1 0.2 0.1 0.3 0.2 0 0 2.8 0.1 0.2 0 0.1 0.1 0.2 0.5 0.6 0 0.2 1.2 0.5 0 0.7 0.4 0.1 1.3 0.1 0.1 0 0 0.3 0 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0 0.1 0.5 0.1 0.1 0.1 0.1 0 0 0.1 1.7 0.1 0.2 0.2 0.2 0.2 0.1 0.1 0.1 0 1.0 0.1 1.8 0 0 0 0 0.5 0 0.2
0.4
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[1] 5drs.a 0.5 0.2 0.1 0.5 0.1 0 0 3.2 0.1 0.5 0 0.1 0 0.4 0.1 0.5 0 0.2 0.7 0.6 0.1 1.2 0.7 0.2 1.6 0 0.1 0 0 0.6 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0.3 0.5 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0.1 1.3 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 1.4 0 2.1 0 0 0 0 1.0 0.2 0.2 0.7
0.3
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[1] 5e2r.a 0.1 0.1 0 0.3 0.1 0 0 2.6 0.2 0.3 0 0.3 0 0.5 0.4 0.8 0 0.3 1.3 0.7 0.1 0.9 0.3 0.3 1.2 0 0.1 0 0 0.5 0 0 0 0 0.1 0 0.1 0 0 0 0.1 0.2 0.1 0 0 0.2 0 0 0 1.5 0 0 0 0 0.1 0 0 0 0 1.0 0 1.6 0 0 0 0 0.9 0.1 0.2 0.9 0.3
0
2.7 0.1 0 0 0.6 0.1 0.1 0.1
[1] 5gmn.a 0.3 0.1 0 0.1 0 0 0 0.3 0 0 0.1 0.2 0 0.2 0.1 2.0 0 0.6 2.7 2.2 0 0.3 0.2 0.2 0.3 0 0 0 0 0.5 0 0.1 0.1 0 2.3 0.7 0 0 0 0.9 0.4 0.2 0.6 0 0 0 0.1 0 0.1 1.7 0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0.3 0.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0.5 1.0 0 0
0
2.0 0 0 0.1 0.1 0.1 0
[1] 5j8z.a 0.1 0.1 0.1 0.3 0.1 0 0 2.6 0.2 0.3 0 0.1 0 0.3 0.1 0.8 0 0.2 1.0 0.7 0.1 1.0 0.2 0.2 1.1 0 0.1 0 0 0.3 0 0.1 0.1 0.1 0 0 0.1 0.1 0 0 0.1 0.1 0.1 0 0 0 0.1 0 0.1 1.5 0 0 0 0 0.1 0 0 0 0 1.0 0 1.6 0 0 0 0.1 0.8 0.1 0.2 0.7 0.1 0 2.5
0
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[1] 5ljq.a 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0 2.6 0.2 0.3 0 0.1 0 0.3 0.1 0.6 0 0.2 1.1 0.7 0.1 1.1 0.5 0.2 0.9 0 0.1 0 0 0.3 0 0.1 0.1 0.1 0 0 0.1 0.1 0 0 0.1 0.3 0.1 0 0.1 0.1 0.1 0 0.1 1.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.0 0 1.8 0 0 0 0 0.7 0 0.2 0.6 0.1 0.1 2.3 0
0
0 0.6 0.1 0.1 0.1
[1] 5ljt.a 1.2 0.1 0.2 0.3 0.1 0 0 2.8 0.2 0.3 0 0.1 0 0.3 0.1 0.7 0 0.2 1.2 0.7 0.1 1.2 0.4 0.2 1.0 0 0.1 0 0.7 1.6 0 0.4 0.6 0.3 0.1 0.1 0.1 0.2 0 0 1.3 0.4 1.5 0 0.1 0.2 0.4 0 0.5 1.6 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.2 1.0 0 1.8 0 0 0 0 1.1 0 0.8 1.6 0.1 0.1 2.5 0.2 0
0
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0
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0.1
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0
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (1 cluster)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
1a42.a
1bn3.a
1bnm.a
1bnn.a
1bnt.a
1cnw.a
1cny.a
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[1] 1a42.a
0
.03 .02 .03 .02 .06 .05 .05 .03 .03 .06 .08 .05 .05 .04 .04 .03 .08 .05 .06 .05 .07 .05 .08 .04 .04 .04 .04 .08 .04 .07 .08 .07 .08 .08 .05 .07 .08 .05 .05 .05 .10 .03 .08 .08 .06 .07 .08 .06 .07 .08 .10 .05 .06 .09 .09 .10 .09 .08 .13 .05 .10 .04 .04 .05 .09 .13 .08 .05 .05 .06 .05 .06 .05 .04 .08 .10 .08 .07 .04
[1] 1bn3.a .03
0
.04 .04 .04 .07 .06 .07 .04 .05 .06 .08 .06 .06 .05 .04 .04 .09 .05 .05 .06 .07 .07 .10 .04 .05 .05 .04 .08 .05 .08 .09 .09 .08 .08 .06 .07 .08 .05 .06 .07 .10 .04 .08 .09 .07 .08 .09 .06 .09 .09 .10 .06 .06 .10 .10 .11 .10 .08 .14 .06 .12 .06 .05 .05 .09 .15 .08 .06 .07 .08 .06 .06 .05 .05 .09 .11 .08 .09 .05
[1] 1bnm.a .02 .04
0
.04 .02 .05 .04 .06 .02 .04 .05 .06 .04 .05 .03 .05 .03 .09 .05 .07 .06 .06 .05 .07 .04 .05 .05 .04 .06 .05 .07 .07 .08 .08 .07 .04 .05 .08 .04 .05 .05 .08 .04 .06 .06 .05 .07 .08 .06 .07 .06 .09 .06 .05 .07 .08 .09 .08 .09 .13 .05 .10 .04 .04 .04 .08 .14 .07 .06 .06 .07 .04 .05 .04 .04 .07 .10 .07 .08 .03
[1] 1bnn.a .03 .04 .04
0
.03 .07 .07 .08 .04 .03 .06 .08 .06 .05 .05 .03 .04 .08 .06 .05 .05 .09 .05 .06 .05 .03 .05 .05 .09 .04 .07 .09 .07 .09 .09 .05 .08 .09 .06 .06 .06 .11 .05 .09 .09 .07 .08 .08 .07 .07 .09 .11 .07 .07 .10 .10 .11 .10 .10 .15 .06 .13 .03 .05 .06 .10 .16 .09 .06 .05 .08 .05 .07 .06 .06 .10 .11 .09 .08 .05
[1] 1bnt.a .02 .04 .02 .03
0
.05 .05 .06 .03 .03 .05 .07 .05 .05 .02 .04 .02 .07 .05 .06 .05 .08 .04 .07 .03 .04 .04 .04 .06 .05 .06 .07 .06 .07 .06 .03 .05 .07 .03 .04 .05 .09 .03 .06 .07 .05 .06 .06 .05 .06 .06 .10 .05 .04 .07 .08 .09 .08 .08 .13 .05 .11 .02 .03 .04 .08 .14 .07 .05 .04 .05 .03 .06 .03 .03 .07 .11 .06 .06 .03
[1] 1cnw.a .06 .07 .05 .07 .05
0
.01 .09 .04 .08 .03 .03 .04 .05 .03 .05 .05 .09 .06 .08 .06 .09 .06 .05 .06 .06 .05 .06 .04 .07 .07 .09 .09 .08 .07 .06 .05 .08 .05 .07 .06 .05 .05 .03 .04 .07 .09 .08 .06 .07 .04 .06 .07 .06 .03 .03 .04 .03 .10 .11 .06 .09 .05 .05 .04 .04 .11 .03 .07 .06 .07 .06 .06 .05 .04 .02 .07 .08 .09 .05
[1] 1cny.a .05 .06 .04 .07 .05 .01
0
.08 .03 .08 .03 .05 .04 .04 .03 .05 .05 .08 .05 .07 .05 .08 .05 .05 .05 .06 .05 .05 .03 .06 .06 .08 .08 .07 .06 .05 .05 .08 .04 .06 .05 .05 .04 .04 .04 .06 .08 .07 .06 .06 .05 .06 .05 .05 .04 .04 .05 .05 .08 .12 .05 .10 .04 .04 .03 .05 .13 .04 .06 .06 .05 .05 .04 .04 .04 .03 .07 .07 .08 .04
[1] 1g4j.a .05 .07 .06 .08 .06 .09 .08
0
.07 .07 .09 .10 .09 .10 .07 .08 .07 .11 .09 .11 .09 .09 .09 .13 .07 .09 .08 .07 .09 .09 .10 .12 .12 .10 .10 .08 .09 .11 .07 .09 .08 .12 .07 .09 .09 .08 .11 .11 .09 .10 .10 .13 .08 .08 .11 .11 .12 .12 .11 .10 .09 .08 .08 .06 .07 .12 .10 .11 .09 .10 .09 .08 .09 .07 .07 .10 .13 .10 .11 .08
[1] 1i8z.a .03 .04 .02 .04 .03 .04 .03 .07
0
.05 .03 .05 .04 .04 .02 .04 .02 .07 .04 .06 .05 .06 .04 .06 .03 .04 .04 .04 .05 .04 .06 .06 .07 .07 .06 .05 .05 .07 .04 .05 .05 .07 .03 .05 .06 .05 .07 .07 .05 .06 .05 .08 .05 .05 .06 .07 .08 .07 .07 .12 .04 .10 .04 .04 .03 .06 .13 .05 .05 .05 .06 .05 .04 .04 .03 .06 .09 .07 .07 .03
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