BRPF1_HUMAN_625_740

Peregrin

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (BRPF1_HUMAN):R: Required for RUNX1 and RUNX2 transcriptional activation (650:653,655:658,661,662,664,665,668,703:709,711:716)
D: Bromo (650:653,655:658,661,662,664,665,668,703:709,711:715)
650:653,655:658,661,662,664,665,668,703:709,711:716

Full PDB list

4lc2,4qyd,4qyl,4uye,5c7n,5c85,5c87,5c89,5d7x,5dy7,5dya,5dyc,5e3d,5e3g,5em3,5epr,5eps,5eq1,5etb,5etd,5ev9,5eva,5ewc,5ewd,5ewh,5ewv,5eww,5ffv,5ffw,5ffy,5fg4,5fg5,5g4r,5g4s

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ligand
A1
G
6
5
0
N
6
5
1
I
6
5
2
F
6
5
3
E
6
5
5
P
6
5
6
V
6
5
7
P
6
5
8
E
6
6
1
V
6
6
2
D
6
6
4
Y
6
6
5
H
6
6
8
N
7
0
3
C
7
0
4
L
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0
5
K
7
0
6
Y
7
0
7
N
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0
8
A
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0
9
D
7
1
1
T
7
1
2
I
7
1
3
F
7
1
4
Y
7
1
5
R
7
1
6
[1]5ffy.a 5xd 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fg5.a 5xf 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g4s.a 8vi 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uye.a 9f9 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5g4r.c lf1 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fg4.a 5xe 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5c7n.a bmf 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ev9.a 5sb 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eww.a 5sk 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5c89.a 4yt 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d7x.a xz8 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eva.a 5s9 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ewc.a 5sj 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dya.a 5gv 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dy7.a 5gt 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ewv.a 5sn 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5etb.a 5ro 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5c85.a 4yo 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dyc.a 5gu 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5e3d.a 5jl 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5e3g.a 5jq 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eps.a 5qx 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5epr.a 5qy 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5etd.a 5rn 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ewd.a 5sh 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eq1.a bea 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5c87.a 4ys 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5em3.a 5q0,5q0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ewh.a 5sg 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lc2.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4qyd.a GGKGLGalyG 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4qyl.a SGRGalyQGGKA 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ffv.b STGGalyAPR 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ffw.b SGRGalyGGalyGL 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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