BRD4_HUMAN_42_168

Bromodomain-containing protein 4

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (BRD4_HUMAN):D: Bromo 1 (79,81:88,90:94,97,105,106,132,135,136,139:141,144:146)
148,149
79,81:88,90:94,97,105,106,132,135,136,139:141,144:146,148,149

Full PDB list

3u5k,3u5l,3zyu,4bw1,4bw2,4bw3,4bw4,4cfl,4clb,4e96,4f3i,4gpj,4hxl,4hxm,4hxs,4lrg,4lys,4lyw,4mep,4nr8,4nuc,4nud,4nue,4o72,4o77,4o78,4o7a,4o7b,4o7c,4o7e,4o7f,4qr5,4uix,4uiy,4uiz,4whw,4wiv,4x2i,4yh3,4yh4,4z1q,4zw1,5a5s,5a85,5acy,5ad2,5cfw,5coi,5cp5,5cpe,5cqt,5crz,5cs8,5ctl,5cy9,5d0c,5d24,5d25,5d26,5d3h,5d3j,5d3l,5d3n,5d3p,5d3r,5d3s,5d3t,5dlx,5dlz,5dw2,5dx4,5e0r,5egu,5ei4,5fbx,5hls,5i88,5khm,5ku3,5lj22oss,2yel,3jvj,3jvk,3muk,3mul,3mxf,3p5o,3svf,3svg,3u5j,3uvw,3uvx,3uvy,3uw9,4a9l,4c66,4c67,4cfk,4cl9,4don,4hbv,4hbw,4hbx,4hby,4hxk,4hxn,4hxo,4hxp,4hxr,4ioo,4ioq,4ior,4j0r,4j0s,4j3i,4kv1,4lr6,4lyi,4lzr,4lzs,4men,4meo,4meq,4mr3,4mr4,4nqm,4o70,4o71,4o74,4o75,4o76,4ogi,4ogj,4pce,4pci,4ps5,4qb3,4qr3,4qr4,4qzs,4uyd,4xy9,4xya,4z1s,4zc9,5ad3,5bt4,5crm,5eis,5hm0,5i80,5igk,5lj1,5luu (unprocessed)

Contact map

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ligand
A1
F
7
9
W
8
1
P
8
2
F
8
3
Q
8
4
Q
8
5
P
8
6
V
8
7
D
8
8
V
9
0
K
9
1
L
9
2
N
9
3
L
9
4
Y
9
7
M
1
0
5
D
1
0
6
M
1
3
2
N
1
3
5
C
1
3
6
Y
1
3
9
N
1
4
0
K
1
4
1
D
1
4
4
D
1
4
5
I
1
4
6
L
1
4
8
M
1
4
9
[1]4f3i.a 0s6 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hxm.a 1a8 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hxl.a 1a9 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lrg.a 1xb 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lyw.a 21q 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mep.a 24y 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o72.a 2r4 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o7b.a 2rj 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o7c.a 2rk 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o7f.a 2rq 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4lys.a 2sj 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wiv.a 3p2 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4nuc.a 435 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5coi.a 55k 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d25.a 56m 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3s.a 579 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3r.a 57c 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3p.a 57e 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3l.a 57f 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3h.a 57g 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dlz.a 5d1 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5egu.a 5nq 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ei4.a 5nv 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uiy.a 5v2 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hls.a 62g 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4clb.a 83t 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4bw4.a 9b6 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4bw3.a 9bm 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4qr5.a bnm 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d0c.a e0b 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dx4.a e0c 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cp5.a eb0 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cpe.a eb2 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5crz.a eb7 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cs8.a eb8 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ad2.a etu 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d26.a l28 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3j.a l33 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3n.a l40 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4nud.a nud 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4nue.a nue 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4bw2.a uth 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4yh3.a y80 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o77.a 2re 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d3t.a 56y 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dlx.a 5d2 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cqt.a eb3 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ctl.a eb9 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5d24.a l26 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5khm.a xnh 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4yh4.a y81 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zyu.a 1gh 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4nr8.a 2ll 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cfw.a 53w 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4z1q.a 558 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5dw2.a 5gd 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5e0r.a 5j5 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ku3.a 6xh 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5a85.a 78j 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5acy.a 9s3 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uiz.a n1d 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5a5s.a np8 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4bw1.a s5b 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o78.a pge,sav 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uix.a ca,tvu 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4e96.a 0ns 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o7e.a 2rn,2rn,2rn,2rn 96 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zw1.a 4v1 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fbx.a 5w4 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5lj2.a 6xw 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4whw.a 3ot 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5i88.a 69g 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3u5k.a 08j 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3u5l.a 08k 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4gpj.a 0q1 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hxs.a 1a3 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4o7a.a 2rf 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x2i.a 3x0 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4cfl.a 8dq 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5cy9.a e0a 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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