BRAF_HUMAN_438_724

Serine/threonine-protein kinase B-raf [Protein kinase superfamily. TKL Ser/Thr protein kinase family. RAF subfamily]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (BRAF_HUMAN):D: Protein kinase (461,463:466,468,471,481:483,498,501,504,505,508,513:516,527,529:536,538,539,543,567,572,574,580,581,583,592:601)461,463:466,468,471,481:483,498,501,504,505,508,513:516,527,529:536,538,539,543,567,572,574,580,581,583,592:601

Full PDB list

1uwh,1uwj,2fb8,3c4c,3d4q,3idp,3ii5,3og7,3ppk,3prf,3pri,3psb,3q4c,3q96,3skc,3tv4,3tv6,4cqe,4dbn,4e26,4ehe,4ehg,4fc0,4fk3,4g9c,4g9r,4h58,4jvg,4ksp,4ksq,4mne,4mnf,4pp7,4r5y,4rzv,4rzw,4wo5,4xv1,4xv2,4xv3,4xv9,4yht,5c9c,5csw,5csx,5ct7,5fd2,5hi2,5hid,5hie,5ita,5jrq,5jsm,5jt2 (redundant pocketome entry)

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ligand
A1
Q
4
6
1
I
4
6
3
G
4
6
4
S
4
6
5
G
4
6
6
F
4
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8
V
4
7
1
A
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0
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Q
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0
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2
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A
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T
5
9
9
V
6
0
0
K
6
0
1
[1]4h58.a 10z 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h58.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[2]4xv9.a 1oo 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]2fb8.b 215 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4pp7.b 2vx 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fk3.a 325 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]4yht.a 4ef 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5c9c.a 4z5 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]4mne.b E 9 . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fd2.a 5xj 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ita.a 6dc 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]5jrq.a 6n9 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . E .
[1]3tv6.a b0r 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3skc.b br2 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ppk.a fni 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3pri.a fp4 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4xv3.a p02 31 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]4xv3.b none . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A T E - - -
[1]4ehe.a ri8 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ehg.a ri9 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E -
[1]4ehg.b ri9 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]3psb.a sm6 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]3tv4.b tv4 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4mnf.a 29l 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E -
[2]4r5y.a 3k3 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]4e26.b 734 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3idp.b l1e 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]3d4q.a sm5 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]4g9c.a 0wp 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4xv1.a 904 36 . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]3prf.a fp3 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]5ct7.a 55j 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]3og7.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . E -
[2]4g9r.a b1e 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E .
[2]3ii5.a 831 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4xv2.a p06 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[2]3q96.a 0nf 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[2]4ksp.a 1su 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[2]4ksq.a 1sw 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
[2]4dbn.b 0ja 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4fc0.b 0t2 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5csx.a 54j,glc 51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1uwh.a bax 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4cqe.a cqe 43 . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . - - - - -
[2]4jvg.a b96 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3q4c.a rsw 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wo5.a 324 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rzv.b 032 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1uwj.a bax 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E .
[1]5jsm.a 6nb 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . E .
[2]5hid.a b1e 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . - - -
[1]5hie.a p06 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5hi2.a bax 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . - - - -
[1]5jt2.b 6nc 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . - -
[1]5jt2.d 6nc 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . E -

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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