BGAT_HUMAN_63_353

Histo-blood group ABO system transferase [Glycosyltransferase 6 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (BGAT_HUMAN):R: UDP-N-acetyl-galactosamine binding (121:123)
R: UDP-N-acetyl-galactosamine binding (211:213)
124:126,181,184,185,188,214,233:236,239,245,264,266:268,300:303,324:326,329,330,343,346,348,350:352
121:126,181,184,185,188,211:214,233:236,239,245,264,266:268,300:303,324:326,329,330,343,346,348,350:352
Metals (Me):Mn

Full PDB list

1lz0,1lz7,1lzi,1lzj,1r7t,1r7u,1r7v,1r7x,1r7y,1r80,1r81,1r82,1wsz,1wt0,1wt1,1wt2,1wt3,1xz6,1zhj,1zi1,1zi3,1zi4,1zi5,1zj0,1zj1,1zj2,1zj3,1zjo,1zjp,2a8u,2a8w,2o1h,2rix,2riy,2rj0,2rj1,2rj4,2rj5,2rj6,2rj7,2rj8,2rj9,2y7a,3i0d,3i0e,3i0f,3i0g,3i0i,3i0j,3i0k,3i0l,3ioi,3u0x,3u0y,3v0l,3v0m,3v0n,3v0o,3v0p,3v0q,3zgf,3zgg,4c2s,4kc1,4kc2,4kc4,4y62,4y63,4y64,5bxc,5c1g,5c1h,5c1l,5c36,5c38,5c3a,5c3b,5c3d,5c49,5c4e (redundant pocketome entry); 1ziz,2i7b,2o1f,2o1g,2pgv,2pgy,2rit,2riz,3i0c,3i0h,3ioh,3ioj,3sx3,3sx5,3sx7,3sx8,3sxa,3sxb,3sxc,3sxd,3sxe,3sxg,4fqw,4fra,4frb,4frd,4fre,4frh,4frl,4frm,4fro,4frp,4frq,4gbp,4kxo,5c47,5c48,5c4b,5c4c,5c4d,5c4f,5c8r,5cmf,5cmg,5cmh,5cmi,5cmj,5cql,5cqm,5cqn,5cqo,5cqp (unprocessed)

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ligand
A1 Me
F
1
2
1
A
1
2
2
I
1
2
3
K
1
2
4
K
1
2
5
Y
1
2
6
W
1
8
1
V
1
8
4
S
1
8
5
R
1
8
8
D
2
1
1
V
2
1
2
D
2
1
3
M
2
1
4
H
2
3
3
P
2
3
4
G
2
3
5
F
2
3
6
S
2
3
9
T
2
4
5
Y
2
6
4
L
2
6
6
G
2
6
7
G
2
6
8
W
3
0
0
H
3
0
1
D
3
0
2
E
3
0
3
L
3
2
4
W
3
2
5
D
3
2
6
L
3
2
9
L
3
3
0
A
3
4
3
K
3
4
6
H
3
4
8
A
3
5
0
V
3
5
1
R
3
5
2
[1]4y62.a 48e,bhe 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]4y63.a 48o,bhe 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]4y64.a 48c,bhe 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]3v0m.a 5gw,bhe 61 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[2]4kc1.a bhe,ws1 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[2]2rj4.a ad7,udp 52 . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]2a8u.a dr5,udp 49 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]3u0x.a gti 17 . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1zjo.a dr4,udp 49 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]1r82.a gdu 25 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]3v0o.a 4gw,bhe 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]2riy.a bhe 28 . . . . . . - - . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]2rj7.a da8,gdu 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . M . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]1zi3.a nlc 26 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[2]3v0n.a 4gw 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]1zi4.a dr2 36 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1zi5.a dr3,udp 61 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1r7t.a none . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[2]4c2s.a udp 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[2]3v0l.a 2gw 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]1lzi.a bhg.ful,udp 53 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]5c3a.a urm 36 . . . . . . - . . . . . . . . . S . . . . M . . . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[1]3ioi.a 1gw 43 . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[1]3zgg.a iug 46 . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]3zgf.a udp 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]1zj0.a lat 23 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]4kc2.a bhe,ws2 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[1]5c4e.a 4ya,udp 53 . . . . . . - . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[2]3u0y.a gti.udp 42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]1zjp.a dr4,udp 49 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]2rj1.a bhe,udp 53 . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[2]5bxc.a da8,udp 52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]1zj1.a nlc 26 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1zj3.a dr2 36 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1zj2.a dr3,udp 61 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]3i0j.a none . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1lzj.a bhg.ful,udp 53 . . . . . . - - - - . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]5c3d.a urm 36 . . . . . . - - . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]2o1h.a udp 25 . . . . . . - - - - . . . T . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]4kc4.a bhe,ws3 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[1]2rj6.a bhe 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - -
[2]5c1g.a da8,gdu 63 . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . . . . . . . . . . . . . . V - - Mn
[1]1r81.a ud2 25 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - -
[1]1wt3.a udp 25 . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . - - - - -
[2]2rj0.a udp 25 . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[2]3v0q.a bhe,udp 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . Mn
[1]5c1l.a da8,gdu 63 . . . . . . - . . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[2]2rj5.a udp 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . M . A . . . . . . . . . . - - - - - Mn
[1]1xz6.a none . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . - - - - -
[1]5c38.a da8,urm 63 . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . M . A . . . . . . . . . . . - - - - Mn
[1]3i0k.a udp 25 . . . . . . - - . . . . . . . . S . . . . M . A . . . . . . . . . . R - - - -
[1]5c3b.a da8,urm 63 . . . . . . - - . . . . . . . . S . . . . M . . . . . . . . . . . . . - - - - Mn

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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