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BACE1_HUMAN_49_451

Beta-secretase 1 [Peptidase A1 family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (BACE1_HUMAN):D: Peptidase A1 (75, 91:93, 95, 96, 98, 100, 130:137, 167:171, 176, 179, 187, 189, 259, 285, 287, 289:294, 296, 386, 390, 393, 396)
70:74
70:75, 91:93, 95, 96, 98, 100, 130:137, 167:171, 176, 179, 187, 189, 259, 285, 287, 289:294, 296, 386, 390, 393, 396

Full PDB list

2ph8, 2qu3, 2ze1, 3in3, 3inh, 3ivh, 3l3a, 3pi5, 3rsv, 3s7l, 3u6a, 3udn, 3udp, 3udq, 3udy, 3ufl, 3vf3, 3vv7, 4b05, 4b72, 4b77, 4djv, 4djw, 4djy, 4fm7, 4fm8, 4fse, 4fsl, 4h1e, 4h3f, 4h3g, 4h3i, 4h3j, 4hzt, 4i0d, 4i0e, 4i0f, 4i0z, 4i10, 4i1c, 4j0p, 4j0z, 4j17, 4j1c, 4j1e, 4jp9, 4jpc, 4l7h, 4l7j, 4n00, 4r8y, 4r91, 4r92, 4r95, 4rcd, 4rce, 4rcf, 4rrn, 4rro, 4wtu, 4x7i, 4xkx, 4zpg, 5enk, 5enm, 5ezx, 5ezz, 5f00, 5f01, 5hd0, 5hdu, 5hdv, 5hdx, 5he4, 5he5, 5he7, 5htz, 5hu0, 5hu1, 5i3v (Pocketome entry); 1fkn, 1m4h, 1sgz, 1tqf, 1w50, 1w51, 1xn2, 1xn3, 1xs7, 1ym2, 1ym4, 2b8l, 2b8v, 2f3e, 2f3f, 2fdp, 2g94, 2hiz, 2hm1, 2iqg, 2irz, 2is0, 2ntr, 2oah, 2of0, 2ohk, 2ohl, 2ohm, 2ohn, 2ohp, 2ohq, 2ohr, 2ohs, 2oht, 2ohu, 2p4j, 2p83, 2p8h, 2ph6, 2q11, 2q15, 2qk5, 2qmd, 2qmf, 2qmg, 2qp8, 2qu2, 2qzk, 2qzl, 2va5, 2va6, 2va7, 2vie, 2vij, 2viy, 2viz, 2vj6, 2vj7, 2vj9, 2vkm, 2vnm, 2vnn, 2wez, 2wf0, 2wf1, 2wf2, 2wf3, 2wf4, 2wjo, 2xfi, 2xfj, 2xfk, 2zdz, 2zhr, 2zhs, 2zht, 2zhu, 2zhv, 2zjh, 2zji, 2zjj, 2zjk, 2zjl, 2zjm, 2zjn, 3bra, 3buf, 3bug, 3buh, 3cib, 3cic, 3cid, 3ckp, 3ckr, 3dm6, 3duy, 3dv1, 3dv5, 3exo, 3fkt, 3h0b, 3hvg, 3hw1, 3i25, 3igb, 3in4, 3ind, 3ine, 3inf, 3ivi, 3ixj, 3ixk, 3k5c, 3k5d, 3k5f, 3k5g, 3kmx, 3kmy, 3kn0, 3kyr, 3l38, 3l58, 3l59, 3l5b, 3l5c, 3l5d, 3l5e, 3l5f, 3lhg, 3lnk, 3lpi, 3lpj, 3lpk, 3msj, 3msk, 3msl, 3n4l, 3nsh, 3ohf, 3ohh, 3ooz, 3qbh, 3qi1, 3r1g, 3r2f, 3rsx, 3rth, 3rtm, 3rtn, 3ru1, 3rvi, 3s2o, 3s7m, 3skf, 3skg, 3tpj, 3tpl, 3tpp, 3tpr, 3udh, 3udj, 3udk, 3udm, 3udr, 3uqp, 3uqr, 3uqu, 3uqw, 3uqx, 3veu, 3vg1, 3vv6, 3vv8, 3wb4, 3wb5, 3zmg, 3zov, 4acu, 4acx, 4azy, 4b00, 4b0q, 4b1c, 4b1d, 4b1e, 4b70, 4b78, 4bek, 4bfd, 4d83, 4d85, 4d88, 4d89, 4d8c, 4dh6, 4di2, 4dju, 4djx, 4dpf, 4dpi, 4dus, 4dv9, 4dvf, 4ewo, 4exg, 4fco, 4fgx, 4fri, 4frj, 4frk, 4frs, 4fs4, 4gid, 4gmi, 4ha5, 4i0g, 4i0h, 4i0i, 4i0j, 4i11, 4i12, 4ivs, 4ivt, 4j0t, 4j0v, 4j0y, 4j1f, 4j1h, 4j1i, 4j1k, 4joo, 4jpe, 4k8s, 4k9h, 4ke0, 4ke1, 4l7g, 4lc7, 4lxa, 4lxk, 4lxm, 4pzw, 4pzx, 4r5n, 4r93, 4rrs, 4trw, 4try, 4trz, 4wy1, 4wy6, 4x2l, 4xxs, 4ybi, 4zpe, 4zpf, 4zsm, 4zsp, 4zsq, 4zsr, 5clm, 5dqc, 5hdz, 5i3w, 5i3x, 5i3y, 5ie1, 5kqf, 5kr8, 5mbw, 5mco, 5mcq, 5mxd, 5t1u, 5t1w, 5tol, 5uyu, 5v0n, 6bfd, 6bfe, 6bfw, 6bfx, 6c2i (unprocessed)

Pocket contact map

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ligand
A1
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6
[1]2qu3.a 46229 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2ze1.a 41134 - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3in3.a 47226 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3inh.a 56932 . . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3l3a.a 62532 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3rsv.a 3rs32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3s7l.a 59127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3u6a.a 18p26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udn.a 09b26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udp.a 09d28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udq.a 09e30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udy.a 09g27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ufl.a 50834 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vv7.a 0b126 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b05.a 32d32 . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b72.a 2fb30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b77.a 54m26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djv.a 0km28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djw.a 0kp26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djy.a 0kr26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fm7.a 0up33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fm8.a 0uq32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fse.a 0va30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fsl.a 0vb33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h1e.a 10j33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3f.a 10o33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3g.a 10q33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3i.a 10v33 . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3j.a 10w32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hzt.a 0za28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0d.a 1b727 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0e.a 1b830 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0f.a 1bf29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0z.a 1bb31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i10.a 1bs33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i1c.a 1be32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j0p.a 1h826 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j0z.a 1h528 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j17.a 1hq28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j1c.a 1ho29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j1e.a 1hm31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jp9.a 1m526 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jpc.a 1m627 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4l7h.a 1w126 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4l7j.a 1w226 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n00.a 2ex28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r8y.a 3ko30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r91.a 3kt29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r92.a 3ku32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r95.a 3kw34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rcd.a 3ll33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rce.a 3ln31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rcf.a 3lo33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rrn.a 3uw28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rro.a 3ux29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wtu.a 3ut33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x7i.a 3ys27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4xkx.a 43k33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zpg.a 4qf33 . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enk.a 5qv29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enm.a 5qu28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ezx.a 5t528 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ezz.a 5t630 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f00.a 5t826 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f01.a 5t727 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hd0.a 60y32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdu.a 60w34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdv.a 60v29 . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdx.a 60u30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he4.a 60t30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he5.a 60s29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he7.a 60x30 . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5htz.a 66j26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hu0.a 66h28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hu1.a 66f28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5i3v.a 68m30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2ph8.a 35a32 . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3ivh.a 1li34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3pi5.a 3p529 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3vf3.a 0gs31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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PDB.ch
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9
6
[1]2qu3.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]2ze1.a - - - . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3in3.a . . * . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3inh.a . . * . . . * . . . . . . . . * - - - . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3l3a.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3rsv.a . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3s7l.a . . * . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3u6a.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udn.a . . . . . . * . . . . . . * . * . * * * . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udp.a . . . . . . * . . . . . . * . * . * * * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udq.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * * * . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]3udy.a . . . . . . * . . . . . . * . * . * * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ufl.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3vv7.a . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b05.a . . * . . . * . . . . . . . . * - * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b72.a . . * . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4b77.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djv.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djw.a . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4djy.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fm7.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fm8.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fse.a . * . . . . * . . . . . . * . * . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4fsl.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h1e.a . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3f.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3g.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3i.a . . . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4h3j.a . . . . . . * . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4hzt.a . . * . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0d.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0e.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0f.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i0z.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i10.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4i1c.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j0p.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j0z.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j17.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j1c.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4j1e.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jp9.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jpc.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4l7h.a . . * . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4l7j.a . . . . . . * . . . . . . . . * * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n00.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r8y.a . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r91.a . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r92.a . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4r95.a . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rcd.a . . . . . . . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rce.a . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rcf.a . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rrn.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4rro.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wtu.a . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4x7i.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]4xkx.a . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4zpg.a . . . . . . * . . . . . . * . * . * . A . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enk.a . . * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enm.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ezx.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ezz.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f00.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5f01.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hd0.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdu.a . . . . . . * . . . . . . . . . * * * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdv.a . * * . . . * . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hdx.a . * * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he4.a . * * . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he5.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5he7.a . * . . . . * . . . . . . . . * - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5htz.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * * . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hu0.a . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5hu1.a . . . . . . * . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]5i3v.a . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[2]2ph8.a . * . . . . * . . . . . . * . * * * * A . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[2]3ivh.a . . * . . . * . . . . . . * . * * . * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3pi5.a . . * . . . . . . . . . . * . * * * * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3vf3.a . * * . . . * . . . . . . * . * * * * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
2qu3.a:462
2ze1.a:411
3in3.a:472
3inh.a:569
3l3a.a:625
3rsv.a:3rs
3s7l.a:591
3u6a.a:18p
3udn.a:09b
3udp.a:09d
3udq.a:09e
3udy.a:09g
3ufl.a:508
3vv7.a:0b1
4b05.a:32d
4b72.a:2fb
4b77.a:54m
4djv.a:0km
4djw.a:0kp
4djy.a:0kr
4fm7.a:0up
4fm8.a:0uq
4fse.a:0va
4fsl.a:0vb
4h1e.a:10j
4h3f.a:10o
4h3g.a:10q
4h3i.a:10v
4h3j.a:10w
4hzt.a:0za
4i0d.a:1b7
4i0e.a:1b8
4i0f.a:1bf
4i0z.a:1bb
4i10.a:1bs
4i1c.a:1be
4j0p.a:1h8
4j0z.a:1h5
4j17.a:1hq
4j1c.a:1ho
4j1e.a:1hm
4jp9.a:1m5
4jpc.a:1m6
4l7h.a:1w1
4l7j.a:1w2
4n00.a:2ex
4r8y.a:3ko
4r91.a:3kt
4r92.a:3ku
4r95.a:3kw
4rcd.a:3ll
4rce.a:3ln
4rcf.a:3lo
4rrn.a:3uw
4rro.a:3ux
4wtu.a:3ut
4x7i.a:3ys
4xkx.a:43k
4zpg.a:4qf
5enk.a:5qv
5enm.a:5qu
5ezx.a:5t5
5ezz.a:5t6
5f00.a:5t8
5f01.a:5t7
5hd0.a:60y
5hdu.a:60w
5hdv.a:60v
5hdx.a:60u
5he4.a:60t
5he5.a:60s
5he7.a:60x
5htz.a:66j
5hu0.a:66h
5hu1.a:66f
5i3v.a:68m
2ph8.a:35a
3ivh.a:1li
3pi5.a:3p5
3vf3.a:0gs
[1] 2qu3.a
0.2
1.7 0.2 0.1 0.2 2.1 0.1 0.5 1.9 0 0 1.6 2.3 1.0 0.4 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.2 0.7 0.5 0.2 0.5 0.2 0.5 0.7 1.3 1.8 1.6 1.5 0.9 0.9 1.8 0.5 0.7 0.8 0.6 0.6 0.5 0.4 0.1 0 0.3 0 0 0.3 0.4 0.8 0.2 0.3 0.3 0.5 0.3 0.3 0.3 0 0.1 0.1 0.2 0.3 0.5 0.7 0.3 0.4 0.3 0.1 0.4 0.1 0.3 0.1 0.1 0.5 2.1 0.1 0.1 0.2 0.1
[1] 2ze1.a 0.1
0.4
0.2 0.1 0.1 2.3 0.1 0.4 1.9 0 0 1.6 2.3 0.9 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0 0.1 0.2 0.5 0.6 0.2 0.2 0.1 0.1 0.1 0.7 1.2 1.5 1.5 0.7 0.7 1.7 0 0 0 0 0 0.2 0.1 0 0 0.5 0 0 0.5 0.7 0.5 0.2 0.3 0.3 0.5 0.4 0.2 0.3 0.1 0 0 0.1 0.1 0 0 0.1 0.1 0.1 0 0.2 0 0.1 0.1 0.2 0.2 2.1 0 0 0 0
[1] 3in3.a 0.9 1.8
0
0.1 0.5 2.4 0.1 0.4 1.1 0.1 0.1 0.6 3.3 1.0 0.1 0.2 0.1 0 0 0.1 3.6 3.3 1.4 1.3 0.2 0.1 0.1 0.2 0.5 1.4 2.2 1.8 1.7 1.3 1.5 2.2 0.4 0.4 0.4 0.5 0.6 0.1 0.2 0 0 0.3 0.1 0.1 0.1 0 0.2 0.1 0.3 0.2 0.3 0.3 0.1 0.2 2.9 1.5 1.4 0.1 0.2 0.4 0.7 0.1 0.1 0 0 0 0.1 0 0.4 0 0 2.5 0.1 0.2 0.1 0
[1] 3inh.a 0.8 2.1 0
0
0.5 2.4 0.1 0.5 2.4 0.8 0.8 1.9 4.0 1.2 0.1 0 0 0 0.1 0.1 1.5 1.9 1.5 1.3 1.1 0.2 0.3 0.3 0.7 1.3 1.8 1.6 1.4 1.2 1.4 2.0 0.6 0.8 0.8 0.9 0.8 0.2 0.2 0 0 0.3 1.0 1.0 1.1 0.9 2.1 0.8 0.8 0.2 0.3 0.6 0.2 0.7 1.2 0 0.1 0.2 0.2 1.1 0.9 0.5 0.1 0.2 1.1 0.2 0.9 0.2 0.3 0 0.1 2.0 0 0.7 0.2 1.0
[1] 3l3a.a 0.2 1.8 0.2 0.2
0.2
2.4 0.1 0.4 1.9 0 0.1 1.7 2.6 1.0 0.2 0.2 0.1 0.2 0.1 0.2 0.3 0.3 0.5 0.4 0.6 0.4 0.3 0.5 0.6 1.2 1.6 1.4 1.5 0.7 1.1 1.8 0.4 0.5 0.5 0.6 0.5 0.4 0.3 0 0 0.6 0.3 0.2 0.3 0.2 1.2 0.3 0.4 0.4 0.6 0.5 0.4 0.4 0.2 0.1 0.1 0.3 0.2 0.7 0.8 0.4 0.5 0.1 0.2 0.2 0.1 0.2 0.4 0.2 0.3 2.3 0.1 0.1 0.1 0.1
[1] 3rsv.a 0 1.0 0.2 0.2 0.1
0
0 0.6 1.6 0.1 0.4 1.4 0.4 0.7 0.9 1.1 0.1 0.1 0 0 3.1 3.1 0.6 0.5 0.7 0.3 0.4 0.4 0.4 0.1 0.1 0.2 0 0 0 0.1 0.3 0.4 0.5 0.3 1.5 0.3 0.2 0.3 0.2 0.1 0.5 0.5 0.5 0.4 0.9 0.2 0.1 0.1 0.2 0 0.3 0.1 2.4 2.9 2.9 0.2 0.3 0.3 0.7 0.2 0.5 0.3 0.2 0.3 0.3 0.2 0.1 0.1 0.4 0 0.1 0.3 0.2 0.6
[1] 3s7l.a 1.0 2.3 0.1 0.1 0.8 2.5
0
0.5 1.3 0.1 0.1 0.6 3.4 1.2 0.5 0.3 0 0 0 0.1 3.3 3.4 1.8 1.5 0.3 0.3 0.3 0.2 0.6 1.5 1.8 1.8 1.4 1.2 1.2 2.4 0.6 0.7 0.7 0.6 1.0 0.2 0.2 0.1 0 0.3 0 0.1 0.2 0 0.3 0.1 0.2 0.2 0.2 0.3 0.4 0.2 3.0 2.1 2.1 0.3 0.3 0.7 0.8 0.2 0.1 0 0.1 0.2 0.1 0.1 0.4 0 0.2 1.8 0 0.1 0.1 0.2
[1] 3u6a.a 3.6 3.7 2.3 2.2 3.6 3.7 1.9
0
0.2 0.1 0.1 0.1 4.8 2.2 2.1 2.4 2.3 2.8 2.4 0.3 0.6 0.6 0.8 0.7 0.4 0.6 1.2 0.8 0.9 1.1 1.3 1.9 1.1 1.3 1.3 1.7 0.3 0.2 0.4 0.2 0.3 2.2 2.5 0.1 1.4 2.3 0.1 0.2 0.3 0.2 1.9 1.8 2.1 2.3 2.3 1.8 0.8 1.8 0.3 0.3 0.3 2.1 3.3 0.2 0.2 0.2 0.8 0.7 0.2 0.6 0.1 0.7 0.8 1.8 0.6 4.0 0 0 0.3 0.1
[1] 3udn.a 4.9 5.5 4.4 5.5 5.3 5.0 4.3 1.6
0
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[1] 4xkx.a 2.7 3.0 0.8 1.0 2.9 5.2 0.5 0.7 0.9 0.5 0.3 0.8 5.6 1.4 0.9 1.1 0.8 1.4 1.0 0.1 4.1 3.7 3.5 3.4 0.7 0.7 0.5 0.7 0.6 2.3 2.6 2.5 2.4 2.5 3.0 3.3 1.0 0.7 1.1 1.0 1.1 0.3 0.2 1.3 0.9 0.8 0.3 0.5 0.7 0.7 0.3 0 0 0.6 0.4 0 0.4
0
2.6 1.7 1.0 0.3 1.5 0.6 1.3 0.2 0.7 0.5 0.2 0.7 0.1 0.8 1.9 0.6 0.6 4.4 0.2 0.5 0.1 0.8
[1] 4zpg.a 3.7 4.1 2.5 3.3 3.9 4.1 2.8 0.8 0.8 0.2 0.2 0.5 4.9 3.0 2.9 3.1 3.0 2.8 3.1 1.1 0.6 0.4 2.3 1.7 2.9 2.9 3.2 3.7 3.7 0.6 1.3 1.3 0.9 1.0 1.8 1.2 1.1 1.2 1.5 1.5 1.2 2.1 2.1 1.2 2.1 3.1 1.5 2.0 1.9 1.8 3.0 2.8 2.7 3.2 4.0 2.8 3.1 2.8
0
0.9 1.0 2.8 3.9 1.1 1.3 3.9 2.6 2.4 2.7 2.6 2.5 2.8 1.1 3.7 1.2 4.2 0.1 1.5 0.9 0.8
[1] 5enk.a 3.4 4.7 2.6 2.7 4.2 3.6 2.3 0.5 1.5 0.2 0.4 1.1 4.8 2.6 2.6 2.7 2.7 3.2 2.7 0.1 0.1 0.1 0.8 0.8 1.3 1.0 1.3 0.7 1.0 0.4 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 0.5 0.4 0.5 0.6 0.4 0.3 2.7 2.6 0.2 1.5 2.9 1.1 1.6 1.4 1.6 3.0 2.6 2.7 2.8 3.0 2.3 0.8 2.4 0.1
0
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[1] 5enm.a 3.6 4.3 2.3 2.5 3.4 3.6 1.8 0.4 1.4 0.2 0.1 1.2 4.9 2.5 2.0 2.2 2.2 2.5 2.3 0.3 0.3 0.1 0.7 0.9 0.8 0.9 1.0 0.5 1.0 0.6 0.7 0.7 0.6 0.6 0.5 0.8 0.5 0.5 0.7 0.4 0.5 2.4 2.3 0.2 1.3 2.8 0.6 1.1 1.0 1.0 2.5 1.9 2.0 2.5 2.6 1.7 1.0 1.9 0.1 0.1
0
2.1 2.7 0.5 0.4 0.8 0.6 0.9 0.8 0.9 0.6 0.8 0.4 1.6 0.5 3.2 0.1 0.3 0.1 0.9
[1] 5ezx.a 1.6 2.1 0.2 0.2 1.2 3.2 0.2 0.7 2.8 0.4 0.4 2.1 3.9 0.9 0.5 0 0.1 0.2 0 0.1 1.1 1.4 1.0 0.7 1.0 0.4 0.2 0.2 0.3 0.8 1.2 1.3 1.1 0.7 0.8 1.5 0.5 0.6 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0 0 0.5 0.4 0.6 0.4 0.5 1.5 0.5 0.4 0.3 0.8 0.4 0.2 0.5 0.6 0.3 0.1
0
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[1] 5ezz.a 0.2 1.5 0 0 0.1 1.9 0.1 0.5 2.6 0.4 0.4 2.1 2.6 1.0 0 0 0 0 0.1 0 0 0.1 0.4 0.3 0.6 0 0.1 0.1 0.3 0.5 0.9 0.9 0.7 0.4 0.4 1.0 0.4 0.6 0.5 0.5 0.4 0.2 0.1 0.1 0.1 0.4 0.5 0.5 0.5 0.4 1.4 0.3 0.3 0.2 0.6 0.4 0.2 0.4 0.1 0 0.1 0.2
0
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[1] 5f00.a 3.2 3.8 2.4 2.4 3.5 3.2 1.8 0.2 2.2 0.5 0.5 1.7 5.1 1.9 2.1 2.0 2.0 2.5 2.3 0 0.2 0.2 0.6 0.6 1.1 0.5 0.9 0.3 0.6 0.1 0.2 0.2 0.2 0.1 0.1 0.3 0.1 0 0.2 0 0 2.1 2.1 0.1 1.1 2.8 1.3 1.2 1.3 1.2 3.3 2.4 2.3 2.4 2.6 1.7 0.4 2.2 0.1 0.1 0 2.1 2.8
0
0.1 0.6 0.4 0.7 1.3 0.8 0.8 0.7 0.3 1.7 0.3 3.6 0.4 0.7 0.3 0.6
[1] 5f01.a 3.5 3.7 2.4 2.3 4.0 3.0 2.0 0.2 2.6 0.5 0.5 1.9 4.9 2.0 2.8 2.1 2.3 2.5 2.3 0.1 0.2 0.2 0.8 0.9 1.4 1.0 1.5 0.5 1.1 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.1 0.3 0.1 0 0 0 0 2.1 2.2 0.1 1.2 3.0 1.2 1.1 1.1 1.1 3.8 2.7 2.6 2.4 2.8 2.2 0.4 2.1 0.1 0 0.1 1.8 3.0 0
0
1.0 1.0 1.2 1.8 1.3 1.3 1.1 0.3 1.9 0.2 3.6 0.4 0.7 0.2 0.5
[1] 5hd0.a 2.5 3.2 0.4 0.6 2.4 4.5 0.2 0.7 0.2 0.1 0.1 0.1 4.7 1.2 0.4 0.3 0.4 0.7 0.3 0.1 2.5 2.1 2.4 1.9 0.1 0.2 0.1 0.2 0.3 1.2 2.0 2.0 2.0 1.5 1.5 2.2 1.3 1.4 1.3 1.0 1.2 0.3 0.3 0.6 0.2 0.5 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0 0.1 0.4 0.5 0.1 0.3 0.2 1.7 0.3 0.1 0.5 1.2 0.9 1.2
0
0.5 0.2 0.1 0.3 0 0.2 1.0 0.3 0.4 3.7 0 0.2 0.2 0.1
[1] 5hdu.a 0.2 2.1 0.3 0.1 0.3 2.9 0 0.9 2.1 0.4 0.5 1.8 4.5 1.1 0.2 0.2 0 0.2 0.1 0 4.6 4.5 2.3 3.8 0.2 0 0 0.1 0.2 5.1 5.4 5.0 4.8 5.5 5.3 6.0 1.0 1.2 1.1 1.2 1.5 0.1 0.1 0.5 0.4 0.3 1.0 0.2 2.5 2.3 0.6 0.1 0.3 0.3 0.5 0.2 0.2 0.3 4.4 2.1 2.4 0.1 0.2 0.8 1.0 0
0
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[1] 5hdv.a 0.1 2.3 0.2 0.1 0.3 1.0 0.2 1.5 1.7 0 0 1.6 1.4 1.0 0.2 0.1 0.1 0.2 0.1 0.2 0.1 0.1 0.3 0.1 0.4 0.2 0.2 0.3 0.6 0.6 0.7 0.8 0.6 0.7 0.7 1.4 1.7 1.9 1.8 1.8 1.9 0.3 0.2 0.1 0 0.6 0.2 0.1 0.1 0 0.6 0.5 0.4 0.5 0.7 0.5 0.8 0.5 0 0 0.1 0.4 0.1 1.4 1.5 0.2 0.2
0
0 0 0.1 0 0.3 0.3 0.8 0.7 0.1 0 0 0
[1] 5hdx.a 2.0 3.8 0.4 0.5 2.0 4.1 0.1 1.4 1.5 0 0.1 1.4 5.2 1.2 0.4 0.3 0.2 0.8 0.3 0.1 2.1 2.0 2.0 2.0 0.6 0.4 0.2 0.7 0.6 1.7 2.0 2.2 1.6 1.5 1.5 3.0 1.9 2.1 1.9 2.0 2.2 0.5 0.4 0.7 0.1 0.8 0.1 0.2 0.2 0.1 0.5 0.1 0.3 0.5 0.7 0.2 0.6 0.4 1.8 0.4 0.1 0.4 0.8 1.1 1.5 0.2 0.2 0.1
0
0.3 0 0.1 1.5 0.2 0.8 3.3 0 0.1 0.2 0.2
[1] 5he4.a 1.7 3.4 0.3 0.3 1.7 3.7 0.1 1.5 1.7 0 0.1 1.6 4.9 1.0 0.2 0.2 0.2 0.3 0.3 0.2 2.3 2.4 1.8 1.7 0.4 0.2 0.2 0.3 0.6 1.6 2.4 2.3 1.7 1.5 1.4 2.6 1.6 1.8 1.5 1.7 1.7 0.4 0.3 0.5 0.1 0.5 0.1 0.2 0.1 0.1 0.5 0.4 0.4 0.4 0.6 0.3 0.6 0.4 1.9 0.2 0.1 0.3 0.5 1.1 1.5 0.2 0.3 0 0
0
0.1 0 1.1 0.1 0.3 3.2 0.1 0.1 0 0.1
[1] 5he5.a 2.3 3.0 0.3 0.4 2.1 4.1 0.2 0.9 1.4 0 0 1.2 4.9 1.2 0.5 0.3 0.4 0.5 0.3 0.3 2.6 2.3 2.2 2.1 0.2 0.3 0.3 0.3 0.5 1.5 2.0 1.9 1.6 1.4 1.6 2.8 1.3 1.3 1.1 1.4 1.2 0.6 0.5 0.7 0.2 0.7 0.1 0.2 0.3 0.2 0.3 0.1 0.1 0.5 0.4 0.1 0.6 0.3 1.9 0.3 0.2 0.5 1.0 0.9 1.1 0.2 0.5 0.2 0.1 0.2
0
0.1 1.4 0.3 0.5 3.7 0 0.1 0.1 0.3
[1] 5he7.a 1.7 3.1 0.3 0.3 1.6 3.5 0.2 1.3 1.7 0.1 0.2 1.6 4.7 1.0 0.2 0.2 0.1 0.4 0.3 0.2 2.3 2.3 2.0 1.9 0.4 0.2 0.2 0.2 0.5 1.7 2.3 2.4 2.0 1.4 1.8 2.9 1.5 1.5 1.2 1.9 1.8 0.4 0.3 0.7 0.1 0.5 0.1 0.1 0.1 0 0.7 0.4 0.4 0.5 0.7 0.3 0.4 0.4 2.0 0.1 0 0.3 0.5 0.9 1.2 0.2 0.3 0 0 0 0.1
0
1.1 0.1 0.3 3.7 0.1 0.1 0.1 0.2
[1] 5htz.a 3.3 4.7 1.9 2.2 3.3 5.2 2.9 0.9 2.6 0.8 0.9 2.2 7.3 1.6 2.4 2.8 2.0 2.1 2.3 0.1 4.2 4.3 1.8 1.8 2.7 1.7 1.4 1.3 1.7 2.2 3.1 3.5 2.4 2.4 2.6 3.3 0.9 1.0 1.0 1.1 1.4 1.1 1.1 0.4 1.6 2.2 2.5 2.1 3.1 3.1 3.5 2.2 2.4 2.4 2.5 2.0 0.7 2.3 3.1 2.9 2.7 2.4 3.2 0.7 1.0 2.0 1.6 1.6 2.3 1.8 2.4 1.5
0
2.9 0.2 5.9 0.1 1.5 0.6 1.4
[1] 5hu0.a 1.7 2.1 0.3 0.3 1.3 3.5 0 0.9 1.6 0.4 0.5 1.6 4.7 1.1 0.7 0.2 0.2 0 0 0.2 2.5 2.2 2.2 1.7 0.4 0.7 0.8 0.4 0.7 2.0 2.6 2.4 2.1 1.7 1.9 3.0 1.1 1.2 1.1 1.2 1.2 0.4 0.3 0.3 0.1 0.5 0 0 0.2 0.1 0.5 0.2 0.4 0.4 0.6 0.3 0.1 0.4 2.2 0.3 0.2 0.3 0.5 1.1 1.2 0.5 0.8 0.5 0.2 0.5 0.2 0.4 0.8
0
0.2 3.5 0.4 0.2 0.2 0.4
[1] 5hu1.a 3.6 4.2 2.0 2.4 3.6 3.4 3.1 0.8 1.8 0.4 0.6 1.7 4.7 1.6 2.8 3.2 2.3 2.1 2.3 0.2 3.0 3.2 0.9 0.8 1.7 1.7 1.5 1.5 1.9 1.2 1.2 1.4 1.0 1.1 1.1 1.8 0.5 0.7 0.6 0.5 1.2 1.6 1.6 0.4 1.4 2.5 1.3 1.1 1.2 1.1 1.8 1.6 1.8 2.5 2.8 1.7 0.4 2.1 2.8 2.6 2.9 2.3 3.3 0.7 0.6 2.1 1.3 1.3 1.5 1.6 1.7 1.4 0.1 3.1
0
3.7 0.3 0.5 0.4 0.6
[1] 5i3v.a 0.2 1.1 0.2 0.2 0.1 0 0.1 0.5 2.3 0.1 0.2 2.1 0.5 0.5 0.8 0.9 0.2 0.1 0 0.2 2.9 3.0 1.0 1.1 0.7 0.4 0.4 0.3 0.5 0.1 0.1 0 0 0 0 0 0.3 0.4 0.5 0.3 1.2 0.3 0.3 0.3 0.2 0.2 0.1 0.4 0.4 0.3 0.9 0.2 0 0.1 0.2 0.1 0.4 0.1 2.5 2.9 2.9 0.2 0.3 0.3 0.6 0.2 0.6 0.3 0.4 0.2 0.4 0.2 0.1 0.1 0.3
0
0 0.3 0.2 0.3
[2] 2ph8.a 6.0 6.0 4.8 5.8 6.0 6.3 4.8 3.3 1.2 1.1 1.0 1.1 7.7 5.4 6.2 7.1 5.5 4.6 4.5 2.7 7.0 7.7 4.5 4.0 3.7 4.9 5.5 4.0 4.3 3.1 3.2 3.4 3.2 2.9 3.0 3.9 3.4 2.9 3.6 3.3 4.5 4.2 4.2 2.6 4.1 4.7 2.0 2.5 2.8 2.7 4.6 4.4 4.3 4.3 4.8 4.9 3.8 4.3 6.8 6.9 6.4 3.9 6.1 2.9 3.3 3.7 4.9 4.1 2.9 4.1 2.7 4.6 2.8 4.9 3.4 6.2
0
1.4 0.5 1.2
[2] 3ivh.a 5.1 6.0 4.4 5.2 5.8 6.6 4.0 3.2 1.5 0.2 0.4 0.9 8.3 4.6 5.1 6.5 5.0 4.2 4.0 2.4 5.9 6.3 3.3 3.1 2.6 3.6 4.5 3.0 3.3 2.0 2.8 2.7 2.4 2.4 2.5 3.3 2.8 2.3 2.9 2.6 3.7 4.2 4.2 2.0 3.5 3.8 1.9 1.9 2.2 2.2 3.2 3.5 4.0 4.0 4.0 3.7 3.4 3.9 4.4 4.0 3.5 4.1 6.1 2.5 2.9 2.8 4.0 3.6 2.6 3.7 2.9 3.6 2.8 3.9 2.8 6.7 0.3
0
0.3 0.3
[2] 3pi5.a 5.5 5.8 4.5 5.7 5.5 6.4 4.3 2.9 1.2 0.4 0.3 1.1 8.3 4.9 5.1 6.0 4.9 4.4 4.4 2.3 6.6 7.0 5.6 5.1 2.6 4.4 4.6 3.5 3.5 2.9 3.6 3.6 3.1 3.7 4.5 4.6 2.7 2.3 2.9 2.2 3.1 4.1 3.9 2.2 4.2 3.9 2.0 2.1 2.5 2.1 3.9 3.7 4.1 4.1 4.3 3.9 3.3 3.7 5.7 5.5 4.5 3.8 6.1 2.8 2.9 3.1 4.4 3.9 3.0 3.9 3.0 3.9 2.7 4.0 2.6 6.1 0.5 0.2
0
0.1
[2] 3vf3.a 4.9 6.1 4.3 5.1 4.9 6.0 4.2 3.8 1.3 0.3 0.3 0.8 8.2 4.6 4.6 5.6 4.7 4.5 4.3 2.5 6.9 6.6 4.2 4.0 2.6 3.8 4.3 2.7 3.0 2.1 2.9 2.7 2.6 3.1 3.4 3.5 4.2 3.4 4.0 3.4 4.3 3.7 3.7 1.9 3.6 4.1 1.8 1.8 2.5 2.1 3.8 3.5 3.8 3.8 4.3 4.1 3.7 4.0 4.1 4.1 3.3 3.7 5.1 3.4 4.0 2.7 3.7 3.8 3.0 3.7 2.4 3.7 2.7 4.1 3.4 6.1 0.4 0.3 0.1
0
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (2 clusters)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
2qu3.a
2ze1.a
3in3.a
3inh.a
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4i0e.a
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4l7j.a
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4rcf.a
4rrn.a
4rro.a
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4xkx.a
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