AMYP_PIG_16_511

Pancreatic alpha-amylase [Glycosyl hydrolase 13 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (AMYP_PIG):68,73,74,77,78,116,119:122,160,162,166,177:180,210,212,213,215,216,248,250,252:255,314,315,320:322,371,37268,73,74,77,78,116,119:122,160,162,166,177:180,210,212,213,215,216,248,250,252:255,314,315,320:322,371,372
Metals (Me):Ca

Full PDB list

1bvn,1dhk,1hx0,1jfh,1kxq,1kxt,1kxv,1ose,1pif,1pig,1ppi,1ua3,1vah,1wo2,3l2l,3l2m,4x0n (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1 Me
N
6
8
W
7
3
W
7
4
Y
7
7
Q
7
8
H
1
1
6
G
1
1
9
S
1
2
0
G
1
2
1
A
1
2
2
S
1
6
0
G
1
6
2
Y
1
6
6
L
1
7
7
V
1
7
8
G
1
7
9
L
1
8
0
R
2
1
0
D
2
1
2
A
2
1
3
K
2
1
5
H
2
1
6
E
2
4
8
I
2
5
0
L
2
5
2
G
2
5
3
G
2
5
4
E
2
5
5
H
3
1
4
D
3
1
5
H
3
2
0
G
3
2
1
A
3
2
2
D
3
7
1
W
3
7
2
[1]1hx0.a ac1.glc,glc.ac1 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1ppi.a bgc.daf.glc.glc 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1jfh.a glc.ma1,ma2.ma3 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1ua3.a mlr 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1pig.a bgc.glc.agl.hmc.glc.agl 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1vah.a npo 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1bvn.p SWRYSQ-ITTVGDGYIGS 133 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1ose.a bgc.ac1.glc.ac1 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1dhk.a DS-V-F-SGAYQW 82 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kxq.b YRRTGYT-VR 82 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kxq.d YRRTGYT-V 71 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kxv.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1wo2.a bgc.glc.glc 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3l2l.a glc,glc.glc.glc.glc.glc 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3l2m.a glc.glc.glc.glc.glc.glc 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]4x0n.a YIYHG-MGV-YKTPW 115 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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