AMYP_HUMAN_16_511

Pancreatic alpha-amylase [Glycosyl hydrolase 13 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (AMYP_HUMAN):66,73,74,77,78,116,119:122,162,166,177:180,210,212,213,215,216,248,250,252,255,314,315,320:32266,73,74,77,78,116,119:122,162,166,177:180,210,212,213,215,216,248,250,252,255,314,315,320:322
Metals (Me):Ca

Full PDB list

1b2y,1bsi,1cpu,1hny,1kb3,1kbb,1kbk,1kgu,1kgw,1kgx,1u2y,1u30,1u33,1xcw,1xcx,1xd0,1xd1,1xgz,1xh0,1xh1,1xh2,2cpu,2qmk,2qv4,3bai,3baj,3bak,3baw,3bax,3bay,3cpu,3ij7,3ij8,3ij9,3old,3ole,3olg,3oli,4gqq,4gqr,4w93,4x9y,5e0f,5emy,5td4 (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1 Me
I
6
6
W
7
3
W
7
4
Y
7
7
Q
7
8
H
1
1
6
G
1
1
9
N
1
2
0
A
1
2
1
V
1
2
2
D
1
6
2
Y
1
6
6
L
1
7
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1
7
8
G
1
7
9
L
1
8
0
R
2
1
0
D
2
1
2
A
2
1
3
K
2
1
5
H
2
1
6
E
2
4
8
I
2
5
0
L
2
5
2
E
2
5
5
H
3
1
4
D
3
1
5
H
3
2
0
G
3
2
1
A
3
2
2
[1]1xcw.a 3sa 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1b2y.a glc.g6d 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]5emy.a 5qp 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . Ca
[1]4gqr.a myc 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1xcx.a iab 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3ij8.a b0d,b9d 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1u2y.a gox 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3old.a glc.glc.aci.g6d.glc.glc 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1cpu.a glc.agl.hmc.glc.glc 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]5e0f.a 5j7 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]5td4.a cey 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . Ca
[1]3ij9.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1u30.a gox,lag 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3ole.a aci.g6d.glc.aci.g6d.glc.glc 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3olg.a bgc.glc.g6d.hsd.glc.g6d.hsd 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kb3.a none . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3oli.a hsd.g6d.glc.hsd.g6d.glc.glc 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kbb.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . Ca
[1]1kbk.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1kgx.a none . . . . . . . . . . . . . . . . Q . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1u33.a lm2 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1xd0.a are 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1xd1.a 6sa 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]1xh0.a aao 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2cpu.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . Ca
[1]2qv4.a qv4 55 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3bax.a na 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]3cpu.a glc.glc 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . Ca
[1]4w93.a 3l9 86 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca
[1]4x9y.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ca

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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