AMPC_ECOLI_20_377

Beta-lactamase [Class-C beta-lactamase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (AMPC_ECOLI):R: Substrate binding (331:333)
79,80,83,135,136,139,164,166,168,220,225:228,237,305:309,334:336,359,362,365
79,80,83,135,136,139,164,166,168,220,225:228,237,305:309,331:336,359,362,365

Full PDB list

1c3b,1fcm,1fcn,1fco,1fsw,1fsy,1ga9,1i5q,1iel,1iem,1kds,1kdw,1ke0,1ke3,1ke4,1kvl,1kvm,1l0d,1l0e,1l0f,1l0g,1l2s,1ll5,1ll9,1llb,1mxo,1my8,1o07,1pi4,1pi5,1xgi,1xgj,2bls,2ffy,2hdq,2hdr,2hds,2hdu,2i72,2p9v,2pu2,2pu4,2r9w,2r9x,2rcx,2zj9,3bls,3bm6,3fkv,3fkw,3gqz,3gr2,3grj,3gsg,3gtc,3gv9,3gvb,3iwi,3iwo,3iwq,3ixh,4jxg,4jxs,4jxv,4jxw,4ken,4kg2,4kg5,4kz3,4kz4,4kz5,4kz6,4kz7,4kz8,4kz9,4kza,4kzb,4okp,4old,4olg (redundant pocketome entry); 3ixb,3ixd,3ixg,3o86,3o87,3o88,4e3i,4e3j,4e3k,4e3l,4e3m,4e3n,4e3o,4kg6,4lv0,4lv1,4lv2,4lv3 (unprocessed)

Contact map

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ligand
A1
G
7
9
S
8
0
K
8
3
L
1
3
5
Q
1
3
6
D
1
3
9
R
1
6
4
Y
1
6
6
N
1
6
8
R
2
2
0
V
2
2
5
H
2
2
6
V
2
2
7
S
2
2
8
Y
2
3
7
N
3
0
5
K
3
0
6
I
3
0
7
A
3
0
8
L
3
0
9
K
3
3
1
T
3
3
2
G
3
3
3
A
3
3
4
T
3
3
5
G
3
3
6
N
3
5
9
N
3
6
2
R
3
6
5
[1]2r9w.b 23c 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2pu2.a dk2 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1llb.b pcn 26 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2r9x.b wh6 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jxg.b 1s6 28 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fco.a mox 29 . * . . . . . . . . . . . . . - - - . . . . . . . . . . .
[1]1kvl.a cls 26 . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kvl.b thn 23 . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fcm.b cxu 29 . * . . L . . E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jxw.a 1mw 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4ken.b 1s7 24 . * . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fcn.b lor 24 . * . . L . . E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jxv.b 1mu 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1iel.a caz 31 . * . . . . . . . . . . . . . D N . . . . . . . . . . . .
[1]1iel.b caz 31 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4jxs.b 18u 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1xgj.b htc 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ll9.b axl 25 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1xgi.b nst 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kvm.a none . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . .
[1]1kvm.b ceo 22 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz5.b 1u3 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4olg.b 2tv 20 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ixh.b pcz 26 . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
[1]3ixh.a none . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l2s.b stc 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gqz.a gf7 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3gsg.a gf1 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]3gvb.a 3gv 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz4.b 4a1 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2pu4.a ox6 17 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2pu4.b ox7 17 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gtc.a gtc,gtc 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gtc.b gtc 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kza.b nz9,nz9 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz6.b zb6 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kzb.b nz2,nz2 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz7.b 1u5 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4old.b 2uz 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hds.a 4mb,suc 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hds.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gr2.a gf4 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ll5.b im2 20 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz3.a 1u1 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kz8.a 1u6 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3grj.b g14 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hdu.a f12 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hdu.b f12,f12 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3gv9.b gv9 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hdr.b 4a3 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1o07.b mxg 40 . . . . L . . E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l0g.a suc 23 . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l0g.b none . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1c3b.a bzb 12 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i5q.a mox 29 . * . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i5q.b mox 29 . * . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kg2.a pcz 26 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fsw.a ctb 13 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4kg5.a pcz 26 . * . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1fsy.a 105 20 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ga9.b etp 27 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1iem.a cb4 22 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kds.b npb 12 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1kdw.b 4cb 12 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ke0.b cvb 14 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ke3.a bdb 18 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l0d.a none . D . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . .
[1]1l0e.b none . . Q . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1l0f.b none . . . . . . . . H . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1mxo.a sm2 22 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1my8.a sm3 19 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1pi4.a sm3 19 . * . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
[1]1pi5.a sm2 22 . * . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
[1]2hdq.a c21,c21 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2hdq.b c21 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i72.a va1 18 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p9v.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . .
[1]2rcx.a sm4.po4 29 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2rcx.b sm4 24 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2zj9.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3bls.b apb 10 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3bm6.b c9p 27 . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3fkv.a bzb 12 . * R . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . .
[1]3fkw.b none . . R . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3iwi.a none . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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