AMP1_PLAFQ_195_1084

M1 family aminopeptidase [Peptidase M1 family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (AMP1_PLAFQ):R: Substrate binding (460:463)
304,305,317,319,320,458,459,489,492,493,496,497,500,518,519,571,572,575,580,1034,1038,1073
304,305,317,319,320,458:463,489,492,493,496,497,500,518,519,571,572,575,580,1034,1038,1073
Metals (Me):Zn

Full PDB list

3ebg,3ebh,3ebi,3q43,3q44,3t8v,4j3b,4k5l,4k5m,4k5n,4k5o,4k5p,4r5t,4r5v,4r5x,4x2u,4zqt,4zw3,4zw5,4zw6,4zw7,4zw8,4zx3,4zx4,4zx5,4zx6

Contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
   
ligand
A1 Me
L
3
0
4
T
3
0
5
Q
3
1
7
E
3
1
9
A
3
2
0
N
4
5
8
V
4
5
9
G
4
6
0
A
4
6
1
M
4
6
2
E
4
6
3
R
4
8
9
T
4
9
2
V
4
9
3
H
4
9
6
E
4
9
7
H
5
0
0
K
5
1
8
E
5
1
9
M
5
7
1
E
5
7
2
Y
5
7
5
Y
5
8
0
M
1
0
3
4
Q
1
0
3
8
N
1
0
7
3
[1]4zw7.a 4sz 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zw8.a 4t2 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx4.a 4tl 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx6.a 4u6 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . Zn
[1]3q44.a d50 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4r5x.a r5x 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3ebi.a bey 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zw5.a 4sa 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zw6.a 4sy 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3q43.a d66 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4r5t.a r5t 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4x2u.a tod 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx5.a 4tm 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4r5v.a r5v 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zqt.a 4qp 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zw3.a 4s9 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4zx3.a 4tk 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4k5o.a 1ot 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4k5n.a 1ou 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3ebh.a bes 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4k5p.a 1os 15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4k5l.a 19n 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]4k5m.a 1ov 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3ebg.a mg 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn
[1]3t8v.a btj 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . Zn
[1]4j3b.a R 12 . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zn

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
[icb] Download ICM binary file
[xml] Download XML file
Similar entries
Feedback