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ALBU_HUMAN_25_609_warfarinSite

Serum albumin [ALB/AFP/VDB family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (ALBU_HUMAN):D: Albumin 1 (172:178)
D: Albumin 2 (215, 216, 219, 220, 222, 223, 225:227, 230, 231, 233:240, 242, 243, 246, 247, 252, 256, 258:260, 262, 265, 266, 269, 277, 281, 284, 285, 288, 310:312, 314:318, 348, 349, 351, 352, 355, 368, 371, 374, 375, 378)
D: Albumin 3 (474:479, 481, 503:509)
172:178, 215, 216, 219, 220, 222, 223, 225:227, 230, 231, 233:240, 242, 243, 246, 247, 252, 256, 258:260, 262, 265, 266, 269, 277, 281, 284, 285, 288, 310:312, 314:318, 348, 349, 351, 352, 355, 368, 371, 374, 375, 378, 474:479, 481, 503:509

Full PDB list

1ao6, 1bj5, 1bke, 1bm0, 1e78, 1e7a, 1e7b, 1e7c, 1e7e, 1e7f, 1e7g, 1e7h, 1e7i, 1gni, 1gnj, 1h9z, 1ha2, 1hk1, 1hk2, 1hk3, 1hk4, 1hk5, 1n5u, 1o9x, 1tf0, 1uor, 2bx8, 2bxa, 2bxb, 2bxc, 2bxd, 2bxe, 2bxf, 2bxg, 2bxh, 2bxi, 2bxk, 2bxl, 2bxm, 2bxn, 2bxo, 2bxp, 2bxq, 2i2z, 2i30, 2vdb, 2vue, 2vuf, 2xsi, 2xvq, 2xvu, 2xvv, 2xvw, 2xw0, 2xw1, 3a73, 3b9l, 3b9m, 3cx9, 3jqz, 3lu6, 3lu7, 3lu8, 3tdl, 3uiv, 4e99, 4iw1, 4iw2, 4l8u, 4l9k, 4l9q, 4la0, 4lb2, 4lb9, 4z69, 5id7, 5ujb, 5x52, 5yoq, 6ezq (redundant Pocketome entry); 2ydf, 3jry, 3sqj, 4bke, 4emx, 4g03, 4g04, 4hgk, 4hgm, 4k2c, 4k71, 4n0f, 4s1y, 5gix, 5giy, 5ifo, 5ijf, 5vnw (unprocessed)

Pocket contact map

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PDB.ch
   
ligand
A1
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0
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[1]1bke.a b3i12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7c.a hlt,hlt,hlt21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7e.a dka,dka,dka33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7f.a dao,dao26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7h.a plm,plm28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7i.a ste,ste30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gni.a ola,ola30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gnj.a acd,acd35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h9z.a myr,rwf39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ha2.a myr,swf39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hk5.a myr,myr28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1n5u.a myr16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxi.a azq,myr38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxk.a azq,imn,myr63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxl.a diu,myr28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxm.a imn,myr,myr50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxn.a idb,myr50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxo.a myr,opb40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxp.a myr,myr,p1z48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxq.a imn,myr,p1z64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i2z.a sal10 . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i30.a sal10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xsi.a 9ne,myr42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xvv.a 9dn,myr41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xvw.a 9nr,myr44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3a73.a myr,myr28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3b9l.a azz,myr,myr51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3b9m.a azz,myr,sal45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3cx9.a lpx,myr46 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3tdl.a 11d,11d60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3uiv.h 308,myr,myr43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4z69.a dif,dif38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4z69.i dif19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5id7.a 6a4,pge34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5id7.b 6a424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1e7b.a hlt,hlt14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1hk1.a t4424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1hk2.a t4424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1hk3.a t4424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1tf0.a dka,dka24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bx8.a azq22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxa.b c1f17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxb.a opb24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxc.a p1z23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxd.a rwf23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxe.a 1fl,1fl36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxg.a ibp15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2bxh.a ios14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2xvu.a 9dn25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]2xw0.a 9nf26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3lu6.a imx,imx52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3lu7.a ipx28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4e99.a p8s29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4iw1.a fru,fud24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4iw2.a glc,glo23 . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]5x52.a oca10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]6ezq.a c7k27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]1uor.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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PDB.ch
A1
Y
1
7
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F
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[1]1bke.a . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]1e7c.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7e.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7f.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]1e7h.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . . .
[1]1e7i.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]1gni.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]1gnj.a . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1h9z.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ha2.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1hk5.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . H . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1n5u.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . . .
[1]2bxi.a . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]2bxk.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . . .
[1]2bxl.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxm.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]2bxn.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxo.a . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]2bxp.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]2bxq.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . . .
[1]2i2z.a . . . . . . . . . . . . aly . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]2i30.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]2xsi.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]2xvv.a . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]2xvw.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]3a73.a . . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3b9l.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . * . . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3b9m.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]3cx9.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]3tdl.a . . . . . * . . . . . . * . * . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . * * . . . .
[1]3uiv.h . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . .
[1]4z69.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4z69.i . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5id7.a . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]5id7.b . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[2]1e7b.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]1hk1.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]1hk2.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . H . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]1hk3.a . . * . . * . . . * . * * . * . . . . . . . . * . . P . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]1tf0.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2bx8.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxa.b . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxb.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxc.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxd.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxe.a . . * . . * . . . . . . * . * . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxg.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . . .
[2]2bxh.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]2xvu.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . . .
[2]2xw0.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . * . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]3lu6.a . . * . . . . . . * . * * . * . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[2]3lu7.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . . .
[2]4e99.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * * . . . .
[2]4iw1.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . * . . . * * . . . .
[2]4iw2.a . . * . . * . . . * . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . .
[2]5x52.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * * . . . .
[2]6ezq.a . . * . . * . . . . . * * . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . . .
[3]1uor.a . . * . . * . . * . . * * . * . . . * . . . . * . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . * . . . . * . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1bke.a:b3i
1e7c.a:hlt
1e7e.a:dka
1e7f.a:dao
1e7h.a:plm
1e7i.a:ste
1gni.a:ola
1gnj.a:acd
1h9z.a:myr,rwf
1ha2.a:myr,swf
1hk5.a:myr
1n5u.a:myr
2bxi.a:azq,myr
2bxk.a:azq,imn,myr
2bxl.a:diu,myr
2bxm.a:imn,myr
2bxn.a:idb,myr
2bxo.a:myr,opb
2bxp.a:myr,p1z
2bxq.a:imn,myr,p1z
2i2z.a:sal
2i30.a:sal
2xsi.a:9ne,myr
2xvv.a:9dn,myr
2xvw.a:9nr,myr
3a73.a:myr
3b9l.a:azz,myr
3b9m.a:azz,myr,sal
3cx9.a:lpx,myr
3tdl.a:11d
3uiv.h:308,myr
4z69.a:dif
4z69.i:dif
5id7.a:6a4,pge
5id7.b:6a4
1e7b.a:hlt
1hk1.a:t44
1hk2.a:t44
1hk3.a:t44
1tf0.a:dka
2bx8.a:azq
2bxa.b:c1f
2bxb.a:opb
2bxc.a:p1z
2bxd.a:rwf
2bxe.a:1fl
2bxg.a:ibp
2bxh.a:ios
2xvu.a:9dn
2xw0.a:9nf
3lu6.a:imx
3lu7.a:ipx
4e99.a:p8s
4iw1.a:fru,fud
4iw2.a:glc,glo
5x52.a:oca
6ezq.a:c7k
1uor.a is apo
[1] 1bke.a
0.1
0 1.1 0 0 0 0 0.2 0.3 0.1 0 0 0 2.8 0 2.7 2.4 1.7 0.5 3.8 0 0 0 0 0 0 3.0 1.1 1.1 2.0 2.1 1.2 0 1.2 1.6 0.1 0.1 0.4 0.4 0.6 0.1 0.1 0.1 0.1 0.3 0.4 0.1 0.2 0 3.0 3.6 2.7 0.2 0.5 0.3 0 2.8 -
[1] 1e7c.a 0.1
0.1
0.2 0 0 0.1 0 0.1 1.0 0.8 0.1 0 0.4 4.9 0 4.6 4.1 1.4 0.7 6.3 0 0 0.3 0.1 0.2 0 2.6 0.3 1.1 1.6 3.4 0.9 0.2 2.1 2.2 0.1 2.3 2.5 3.7 0.4 0.2 0.1 0.6 0.1 1.1 0.3 0 2.0 0.1 4.5 4.2 3.7 0.3 1.9 1.2 0 4.3 -
[1] 1e7e.a 0 0
0
0 0 0 0 0 0.3 0.3 0 0 0.7 5.0 0 4.2 3.0 1.5 0.6 5.9 0 0 0.5 0.1 0.4 0 2.2 0.4 0.8 2.0 2.0 0.5 0.2 2.1 1.8 0.1 2.1 2.5 3.6 0.2 0.4 0.1 0.3 0.2 0.3 0.3 0 1.5 0.2 4.1 4.0 3.2 0.2 1.4 1.3 0 3.3 -
[1] 1e7f.a 0.1 1.5 1.4
0
1.0 1.1 1.8 1.0 2.0 1.7 0.9 0.1 2.1 4.4 0 3.2 4.3 2.0 0.9 3.6 0 0 1.6 1.1 1.6 0.7 4.0 0.6 3.0 3.3 1.8 3.0 1.9 2.0 1.7 0.1 3.2 3.9 3.5 0.8 2.4 1.9 0.9 0.5 0.9 0.3 0.1 1.6 1.0 4.0 4.9 4.2 0.2 1.6 1.6 2.0 2.6 -
[1] 1e7h.a 0.1 0.3 1.5 0.2
0
0.1 0 0 0.1 0.2 0.1 0.1 0.3 2.0 0.1 1.9 1.7 1.7 1.1 3.9 0 0 0.2 0.1 0.1 0 2.9 0.2 0.6 1.8 0.8 2.3 0.3 0.9 0.8 0.1 1.2 1.5 2.6 0.7 0.1 0.1 0.4 0.5 0.3 0.6 0.1 1.7 0.2 2.2 2.4 1.4 0.4 0.9 0.6 0 1.2 -
[1] 1e7i.a 0.1 0.2 1.2 0 0
0
0 0 0.4 0.2 0 0 0.3 2.1 0 1.7 1.7 1.4 0.5 3.3 0 0 0.3 0.1 0.3 0 2.4 0.7 1.1 1.5 1.1 1.6 0.1 0.8 0.3 0.1 1.6 1.8 2.8 0.6 0.1 0.1 0.2 0.3 0.4 0.6 0.4 1.5 0.3 2.2 2.3 1.3 0.3 2.2 1.2 0 0.8 -
[1] 1gni.a 0.1 0.1 1.7 0 0 0.1
0
0 0.1 0.1 0.1 0 0.4 2.2 0.1 1.9 1.1 1.0 0.5 3.6 0 0 0.5 0.5 0.4 0 2.5 1.2 0.4 1.5 1.4 1.2 0 0.9 0.7 0.1 1.8 1.7 2.8 0.5 0.2 0 0.7 0.4 0.3 0.2 0.3 1.3 0.2 2.2 2.2 1.5 0.3 0.9 1.1 0 1.0 -
[1] 1gnj.a 0.1 0.1 0.5 0 0 0 0
0
0.4 0.2 0 0 0.5 2.8 0 2.5 2.4 1.3 0.6 4.9 0 0 0.7 0.2 0.5 0 2.2 1.0 0.8 1.0 1.8 1.3 0.3 1.3 1.1 0.2 2.4 2.3 2.9 0.2 0.2 0.1 0.3 0.2 0.3 0.3 0 2.1 0.2 2.8 3.1 2.5 0.3 2.2 1.7 0 2.1 -
[1] 1h9z.a 0.1 0.8 0.9 0.6 0.2 0.3 0.3 0.4
0
0 0.5 0 0.3 1.9 0.1 1.1 1.6 0.2 0.5 1.8 0 0 0.1 0.1 0 0.5 1.4 0.8 1.3 3.0 1.2 1.7 1.5 1.0 0.9 0.1 1.2 1.0 1.7 0.2 0.3 0.1 0.2 0.3 0.1 1.2 0.1 0.1 0.2 2.3 3.0 2.0 0.2 0.1 0.3 0.1 0.8 -
[1] 1ha2.a 0.2 0.7 1.5 0.5 0.1 0.3 0.3 0.3 0
0
0.3 0 0.4 2.5 0.1 1.2 1.6 0.3 1.0 2.1 0 0 0.2 0.2 0.1 0.1 1.7 1.4 2.0 3.2 1.7 3.1 1.1 0.9 0.7 0.2 0.9 1.1 1.5 0.4 0.2 0.2 0.3 0.3 0 1.1 0.1 0.2 0.2 2.5 3.4 1.9 0.4 0.1 0.3 0 1.4 -
[1] 1hk5.a 0.1 0.2 0.8 0 0.6 0.5 0.4 0 0.4 0.2
0
0 0.9 3.1 0 2.5 2.8 1.7 0.6 3.4 0 0 0.5 0.2 0.5 0.2 2.7 0.5 1.2 2.7 1.2 1.4 0.3 0.9 1.0 0.1 2.1 2.6 3.3 0.4 0.7 0.2 0.6 0.3 0.2 0.2 0.1 0.5 0.1 3.9 3.4 2.9 0.2 1.1 0.6 0.4 1.9 -
[1] 1n5u.a 0 2.3 2.6 1.2 2.1 2.5 2.0 1.7 2.0 2.1 1.4
0
2.3 5.1 0.2 4.3 4.2 1.1 1.3 5.2 0.3 0.2 2.3 2.2 2.6 2.3 2.9 0.6 2.2 4.6 3.3 3.8 1.8 5.4 5.8 0.2 3.5 3.6 4.3 1.3 2.1 0.4 3.0 0.9 1.6 2.8 0.6 0.2 2.4 6.9 6.7 6.0 0.2 0.7 0.2 1.9 5.3 -
[1] 2bxi.a 0.1 0.3 1.0 0.2 0 0.1 0 0.1 0.2 0.2 0 0.1
0
1.6 0 1.4 1.9 1.8 0.6 2.8 0 0 0.2 0.3 0 0 2.5 1.3 1.1 2.0 1.5 1.7 0.6 0.8 0.8 0.2 0.6 1.2 1.5 0.4 0.1 0.1 0.2 0.3 0.4 1.1 0.3 0.4 0.1 2.5 3.2 1.6 0.4 1.0 0.4 0 1.4 -
[1] 2bxk.a 0.1 0.3 1.2 0 0 0.1 0 0.1 0.1 0.1 0 0 0
0.2
0 0 0.3 1.4 0.7 1.6 0 0 0 0 0 0 2.3 0.8 1.0 2.2 0.6 2.8 0.2 0.3 0.2 0.2 0.8 1.0 1.8 0.6 0.2 0 0.3 0.1 0.1 0.6 0.3 0.9 0.1 0.7 0.8 0.2 0.3 0.8 0.3 0 0.1 -
[1] 2bxl.a 0.2 0.8 1.2 0.6 0.1 0 0.1 0.2 0.2 0.3 0.3 0.1 0.5 2.5
0
1.8 1.9 1.2 0.3 2.5 0 0 0.4 0.3 0.1 0.2 2.3 0.9 1.6 3.5 1.0 2.4 1.4 1.0 1.4 0.1 1.2 1.6 1.7 0.3 0.2 0.1 0.6 0.2 0.2 1.2 0.1 0.1 0 2.1 3.7 2.4 0.3 0.6 0.3 0.1 1.7 -
[1] 2bxm.a 0.1 0.2 0.9 0.3 0.2 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0 0.1 0.2 0.2
0
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[1] 2bxn.a 0 0.1 0.9 0 0 0 0.1 0.1 0.1 0.3 0 0.1 0 0.9 0.1 0.8
0
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[1] 2bxo.a 0 0.7 1.0 0.5 0.1 0.2 0.1 0.3 0.1 0.1 0.3 0 0.2 2.2 0 1.6 1.3
0
0.1 2.1 0 0 0 0 0 0.3 2.3 0.8 0.9 2.6 1.5 1.7 1.0 0.9 0.8 0.2 0.8 1.4 1.8 0.4 0.2 0 0.2 0.1 0.2 0.7 0 0.2 0 2.9 2.9 2.2 0.2 0.2 0.1 0 1.6 -
[1] 2bxp.a 0.4 1.6 1.7 0.2 1.9 1.7 2.0 1.2 1.7 1.6 1.4 0 2.8 4.8 0 2.7 3.9 0.2
0
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[1] 2bxq.a 0.4 1.0 2.8 0.9 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.1 0.7 0 0.6 1.1 0 0.4 0.3 0.4 1.7
0.1
0.1 0 0.3 0.3 0.1 0.6 1.7 2.1 1.5 3.4 0.6 4.5 1.4 0.8 0.4 0.2 1.2 1.5 1.7 0.2 0.2 0 0.4 0.2 0.2 1.3 0.1 0 0 0.8 1.7 0.7 0.3 0.2 0.2 0.1 0.3 -
[1] 2i2z.a 0.6 0.1 0.9 0.8 0 0.1 0 0.1 1.3 1.5 0 0 1.7 4.4 0.1 3.7 3.1 3.2 2.5 8.2
0
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[1] 2i30.a 0.1 0.1 1.0 0 0 0 0 0 0.2 0.4 0 0.1 0.4 5.0 0 4.5 3.0 1.8 0.9 6.8 0.1
0
0.4 0.1 0.6 0 2.6 0.4 1.1 2.1 2.5 1.2 0.2 1.6 1.8 0.1 1.9 2.9 3.1 0.6 0.3 0.1 0.2 0.4 0.4 0.4 0.3 1.2 0.1 3.7 4.4 3.1 0.3 1.9 1.3 0 3.2 -
[1] 2xsi.a 0.2 0.5 1.2 0.4 0 0.1 0 0.1 0.7 0.3 0.3 0 0.4 3.0 0 2.4 2.4 1.9 0.8 4.2 0 0
0.1
0 0.1 0.1 3.2 0.8 1.1 3.1 2.3 1.9 1.0 1.4 1.3 0.2 1.2 1.4 1.9 0.7 0.2 0.1 0.5 0.3 0.6 0.9 0.3 0.4 0 3.2 4.3 3.3 0.3 0.5 0.7 0 2.7 -
[1] 2xvv.a 0.1 0.5 1.3 0.6 0.1 0.1 0.1 0.1 0.6 0.3 0.4 0 0.5 3.6 0 3.2 3.0 1.6 0.8 5.0 0.1 0 0.1
0
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[1] 2xvw.a 0.3 0.6 1.2 0.5 0 0.1 0 0 0.3 0.3 0.3 0 0.4 3.5 0 3.0 3.0 2.0 1.1 4.4 0 0 0 0
0.1
0.1 3.0 1.0 1.3 2.5 2.5 2.1 1.2 1.6 1.2 0.2 1.2 1.5 2.2 0.5 0.3 0.1 0.5 0.3 0.4 1.1 0.3 0.5 0 3.5 4.5 2.8 0.2 0.5 0.5 0 2.4 -
[1] 3a73.a 0.1 0.3 3.1 0.1 0.1 0.2 0 0 0.1 0.2 0 0 0.2 2.3 0.3 2.1 2.1 1.9 2.2 3.5 0 0.1 0.1 0.1 0
0.1
1.4 1.6 1.2 1.2 3.0 4.1 0.7 1.3 1.2 0.1 0.7 1.0 1.5 0.3 0.2 0 0.5 0.6 0.1 0.8 0.1 0.2 0.4 3.2 2.7 2.4 0.2 0.3 0.1 0 1.6 -
[1] 3b9l.a 0 0.3 2.2 0.1 0 0.1 0 0 0.1 0.3 0 0 0.1 2.1 0.1 1.9 2.2 0.8 1.8 2.4 0 0 0.1 0 0 0.1
0.2
0.4 0.2 0.7 0.9 3.1 0.4 0.7 0.7 0.2 0.6 0.8 1.2 0.1 0.4 0 0.4 0.2 0.1 0.9 0 0.1 0.2 2.6 2.9 2.0 0.2 0.4 0.3 0 1.6 -
[1] 3b9m.a 0 0.5 1.0 0.4 0 0.1 0.1 0 0.9 1.4 0 0 1.2 4.8 0.1 4.7 3.7 1.7 1.7 5.8 0 0 1.9 1.5 2.3 0.2 2.6
0.1
1.0 2.2 1.8 2.8 1.0 1.4 1.6 0.2 3.6 4.5 4.2 0.2 1.1 0.6 0.5 0.2 0.4 1.0 0 2.1 1.2 3.7 5.6 3.0 0.2 2.7 2.0 0.1 2.6 -
[1] 3cx9.a 0.2 0.3 1.4 0.3 0 0.1 0 0.1 0.3 0.3 0.1 0 0.2 2.6 0.1 2.2 2.1 1.8 1.0 3.6 0 0 0.2 0 0.1 0.1 2.8 0.1
0.5
2.2 1.6 1.9 0.5 1.8 1.6 0.2 0.8 0.9 1.1 0.6 0.3 0 0.5 0.4 0.7 0.8 0.3 0.2 0.2 2.9 3.6 2.5 0.3 0.2 0.3 0 2.4 -
[1] 3tdl.a 0.2 0.8 6.7 0.3 0.1 0.6 0.3 0.2 0.7 0.8 0.3 0.2 1.3 7.1 0.4 6.4 5.6 1.5 5.1 8.0 0 0 1.6 1.1 1.6 0.2 1.6 2.3 2.0
0.1
5.0 6.3 0.3 4.3 3.7 0.5 2.9 3.4 3.4 0.8 1.0 0.5 1.1 1.2 0.2 0.9 0.9 1.9 1.1 4.8 6.0 4.0 0.8 2.4 2.6 0.1 3.5 -
[1] 3uiv.h 0.1 0.4 1.4 0.4 0 0.1 0 0 0.1 0.1 0 0 0.1 1.3 0.1 1.0 0.9 1.1 0.6 2.0 0 0 0 0 0 0.1 1.9 0.1 0.2 1.6
0.2
1.9 0.7 0.4 0.3 0.1 0.4 0.7 1.1 0.5 0.3 0 0.2 0.3 0.2 1.1 0.3 0 0.3 2.1 2.3 1.1 0.2 0.1 0.1 0 0.5 -
[1] 4z69.a 0.2 0 0.5 0 0 0.1 0 0 0.7 0.9 0 0 0.9 5.2 0.2 4.9 4.3 0.9 0.5 6.3 0 0 1.3 0.8 1.3 0 0.5 0.3 0.5 0.8 2.8
0.5
0.1 2.2 2.3 0.2 2.9 2.7 3.1 0.1 1.0 0.2 0.4 0.7 0.2 0.1 0.2 1.3 0.8 4.5 4.6 3.4 0.3 1.8 1.5 0 3.4 -
[1] 4z69.i 0.4 0 0.5 0 0 0 0 0 0.8 0.7 0 0 1.3 5.6 0.2 5.6 4.7 0.8 0.6 6.2 0 0 1.2 0.6 1.3 0 0.4 0.1 0.4 0.9 2.8 0.7
0
2.6 2.6 0.2 2.7 3.0 3.5 0 1.1 0 0.5 0.7 0.2 0.2 0.1 1.6 0.8 4.2 4.6 3.3 0.2 1.7 1.5 0 3.7 -
[1] 5id7.a 0.1 0 3.0 0.1 0.4 0 0 0 0.3 0.3 0.1 0.1 0.8 2.4 0.4 2.0 1.0 1.6 2.1 4.9 0 0 1.0 0.7 0.6 0.1 3.3 0.6 0.6 1.5 1.0 3.7 0.4
0.2
0.1 0.2 2.7 2.5 3.9 0.3 0.5 0 0.7 0.4 0.5 0.2 0.1 1.5 0.4 2.5 2.6 1.2 0.3 1.5 1.6 0 0.7 -
[1] 5id7.b 0.1 0.1 3.0 0.1 0.4 0.1 0 0.1 0.3 0.3 0.1 0 0.5 2.1 0.3 1.5 1.2 1.6 2.6 4.8 0 0.1 0.5 0.1 0.1 0 3.0 1.5 0.9 1.6 1.2 3.8 0.1 0.3
0
0.2 2.1 2.0 3.1 0.4 0.2 0.1 0.4 0.4 0.3 0.2 0.2 1.7 0.3 2.5 2.4 1.2 0.2 1.4 1.2 0 1.0 -
[2] 1e7b.a 0.1 1.4 4.1 1.5 0.8 1.3 1.4 1.3 0.9 0.8 1.2 0 1.4 7.0 0 5.8 4.3 2.4 3.0 6.4 0.1 0.1 0.2 0.2 0.4 1.6 8.1 7.5 8.4 5.7 9.3 6.1 2.4 7.4 6.4
0.1
2.1 2.7 3.1 0.1 0.9 0.1 0.8 0.3 0.5 2.2 0.2 0.5 0.2 4.4 5.0 4.4 0.3 0.5 0.2 0.4 3.3 -
[2] 1hk1.a 0.2 0.1 4.5 0 0.1 0.7 0.7 0.3 0.2 0.2 0.1 0 0.5 5.2 0 4.1 4.2 2.3 3.8 5.3 0 0 0.2 0.1 0 0.4 6.5 7.1 7.2 3.8 8.8 4.7 0 5.5 4.7 0
0
0.3 0.3 0.2 0.3 0.2 0.3 0.2 0.2 0.3 0.1 0.2 0 2.5 1.9 1.6 0.4 0.8 0.3 0 1.5 -
[2] 1hk2.a 0.2 0.1 5.1 0 0.2 0.6 0.6 0.4 0.1 0.3 0.1 0 0.5 7.0 0 6.3 5.8 2.4 4.6 7.5 0 0.1 0.1 0.2 0 0.3 6.9 6.8 6.8 3.9 10 4.9 0.1 7.0 6.0 0 0.2
0
0.2 0.3 0.6 0.1 0.3 0.4 0.2 0.4 0.1 0.5 0 3.2 3.2 3.2 0.6 0.6 0.1 0 2.6 -
[2] 1hk3.a 0.5 0 4.3 0 0.1 0.5 0.7 0.5 0.1 0.1 0.1 0 0.6 5.5 0 4.3 5.2 2.3 3.3 5.0 0 0 0.1 0.2 0 0.4 7.6 7.2 6.7 3.8 8.8 3.9 0 5.9 5.0 0 0.2 0.2
0
0 0.5 0 0.5 0.5 0.2 0.4 0.2 0.3 0 2.8 3.0 3.0 0.8 1.2 1.1 0 2.3 -
[2] 1tf0.a 0.5 1.1 4.3 2.0 1.4 1.0 1.1 1.4 1.8 1.1 1.2 0 2.0 7.6 0.7 6.8 6.2 2.6 4.0 7.2 0 0 0.4 0.3 0.2 1.1 9.8 7.7 8.1 6.2 9.8 5.3 2.2 7.2 6.4 0.3 2.7 2.4 2.9
0.3
1.2 0.1 0.9 0.7 0.7 2.0 0.5 0.3 0.1 4.3 5.2 4.3 0.3 0.5 0.5 0 3.4 -
[2] 2bx8.a 0.1 0.1 3.5 0 0 0.1 0 0.2 0.3 0.3 0.1 0.1 0 4.3 0 3.9 4.2 2.0 2.6 5.6 0 0 0.2 0.1 0.1 0.1 6.5 5.9 5.9 3.1 8.4 4.1 0.2 5.7 5.2 0.1 0.6 1.4 1.6 0.2
0
0.1 0.4 0.1 0.4 0.2 0.2 0.4 0 4.0 2.8 2.4 0.3 0.7 0.3 0 2.0 -
[2] 2bxa.b 0.6 1.2 4.1 1.0 0.5 1.0 0.9 1.1 0.8 0.9 0.5 0 0.9 6.8 0.2 5.5 5.3 2.1 2.9 6.1 0 0 0.1 0.1 0.1 1.0 7.8 7.4 7.4 6.0 9.8 5.5 1.7 6.7 5.9 0.1 1.7 2.2 2.6 0.1 1.1
0
0.8 0.7 0.8 1.7 0.2 0.2 0.2 4.1 4.4 3.8 0.3 0.1 0.3 0 3.0 -
[2] 2bxb.a 0.3 1.3 4.2 1.2 0.9 1.4 1.3 1.3 0.3 0.3 1.3 0.1 1.6 5.3 0 3.7 3.9 2.4 2.5 4.3 0.1 0 0.3 0.5 0.2 1.4 7.9 6.9 7.9 4.7 7.3 5.1 1.7 5.6 5.0 0.1 1.8 2.3 2.5 0 0.9 0.1
0.1
0.3 0.2 1.9 0.2 0.4 0.2 3.0 2.7 2.4 0.2 0.9 0.7 0.3 1.4 -
[2] 2bxc.a 0.2 1.0 3.9 1.0 0.4 0.8 0.9 0.8 0.2 0.1 0.9 0 1.2 5.4 0 4.2 3.5 2.2 2.9 4.8 0 0 0.3 0.2 0.2 0.8 7.3 7.2 7.5 5.1 8.3 5.0 1.7 6.2 5.0 0.1 1.6 1.6 2.2 0 0.7 0.1 0.4
0.1
0.1 1.4 0.1 0.4 0.1 2.8 2.8 2.3 0.2 0.8 0.9 0.3 1.6 -
[2] 2bxd.a 0.3 1.1 4.6 1.2 0.6 1.4 1.2 1.3 0.3 0.2 1.2 0.1 1.7 5.6 0 4.6 4.0 2.3 2.5 4.3 0.1 0 0.2 0.3 0.2 1.3 7.9 7.4 8.0 5.9 7.9 4.8 1.7 6.5 5.3 0.1 1.7 2.2 2.5 0.1 1.1 0.1 0.4 0.7
0
2.0 0.2 0.3 0.3 2.8 3.5 2.7 0.3 0.8 0.6 0.3 1.6 -
[2] 2bxe.a 0.3 0 3.3 0 0.1 0.6 0.8 0.4 0.7 0.5 0.3 0 0.8 5.8 0 4.5 4.1 2.0 2.3 6.5 0 0 0.3 0.4 0.1 0.3 6.6 7.3 7.5 3.8 8.9 3.6 0.5 6.8 6.9 0.2 1.9 1.5 2.1 0 0.5 0 0.9 0.2 0.6
0.3
0.2 1.6 0.1 3.7 3.5 3.1 0.3 1.7 0.2 0.1 2.7 -
[2] 2bxg.a 0.1 1.1 3.2 1.0 0.8 0.9 1.0 0.9 1.0 0.7 0.9 0 1.5 7.7 0.2 6.6 4.4 2.2 2.2 8.5 0.1 0 0.7 0.5 0.8 1.0 7.7 7.4 7.8 5.1 9.1 4.1 2.1 7.2 7.2 0.1 3.6 4.1 4.6 0 0.6 0.1 0.8 0.2 0.6 1.5
0.1
2.1 0.2 3.8 4.6 4.8 0.3 1.6 1.3 0.5 3.4 -
[2] 2bxh.a 0.6 1.1 5.0 1.0 0.5 1.1 1.1 1.1 0.7 0.5 0.8 0 1.4 7.0 0 5.2 4.8 2.3 3.2 6.3 0 0.1 0.1 0.3 0.2 1.3 7.6 7.3 7.6 6.1 9.1 5.8 1.8 6.9 6.2 0 1.8 2.4 2.5 0.2 0.9 0 0.9 0.5 0.5 1.8 0.2
0.3
0.1 3.3 4.1 4.0 0.2 0.3 0.5 0.2 2.9 -
[2] 2xvu.a 0.1 0.8 3.9 0.6 0.4 0.8 0.8 0.7 0.7 0.8 0.6 0 0.7 6.7 0 5.2 4.7 2.2 3.1 6.1 0 0 0.1 0.2 0.1 0.6 7.2 6.4 6.9 5.2 9.0 5.0 1.6 6.7 6.1 0 1.9 1.9 2.7 0.1 0.5 0.1 0.8 0.2 0.6 1.4 0.2 0.6
0.1
4.1 4.1 3.9 0.3 0.7 0.3 0.3 2.9 -
[2] 2xw0.a 0.3 0.9 4.1 2.0 1.5 2.2 2.5 2.8 1.3 1.3 1.7 1.4 2.2 4.3 1.6 3.7 3.8 3.3 4.3 5.0 0 0 1.7 1.3 1.5 2.4 7.7 8.4 8.7 6.4 7.6 6.4 1.3 5.5 4.4 2.1 1.1 1.0 1.3 0.1 0.5 0 0.2 0.2 0.2 1.4 0.1 0.3 0
0.4
2.6 0.2 2.3 0.3 0.2 0.1 0.1 -
[2] 3lu6.a 0.4 0.1 4.5 0.1 0.2 0.9 0.7 0.5 0.3 0.3 0.1 0.1 0.6 4.0 0 3.2 2.8 2.2 3.0 5.0 0 0 0.3 0.2 0 0.5 8.3 7.5 7.1 4.4 8.6 5.3 0 5.5 5.0 0.4 1.8 1.6 2.1 0.4 0.5 0 0.6 0.7 0.3 0.3 0.2 1.1 0.1 0.9
0
0.2 0.1 1.4 0.9 0 0.4 -
[2] 3lu7.a 0.4 0.2 4.4 0.2 0 0.5 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0.1 0.4 3.8 0.2 3.1 3.2 2.4 3.0 4.0 0 0 0.1 0.3 0.1 0.4 7.4 7.7 7.4 3.9 8.4 6.3 0.5 4.5 4.2 0.1 0.9 1.1 1.5 0.1 0.2 0.2 0.4 0.6 0.3 0.5 0.1 0.1 0.1 1.2 0.5
0
0.4 0.8 0.7 0 0.4 -
[2] 4e99.a 1.6 1.8 8.4 1.5 0.9 1.8 2.0 2.2 0.9 0.7 1.8 0 2.1 11 0.9 8.8 8.6 3.5 6.6 9.9 0.2 0.2 0.9 0.7 0.8 1.5 11 9.0 9.8 7.7 15 7.8 1.8 9.6 8.3 0.4 3.1 3.2 3.2 1.3 1.7 0.4 1.9 1.6 1.3 2.9 0.7 0.8 0.8 4.4 7.3 5.7
0.3
1.2 1.2 0.4 4.1 -
[2] 4iw1.a 0.6 2.1 7.5 2.1 1.8 1.8 2.0 2.1 1.0 0.8 1.9 0 2.3 8.3 0.8 6.8 6.8 2.6 5.4 7.4 0.3 0.1 0.8 0.6 0.9 2.2 8.9 8.0 8.8 7.6 12 8.1 2.6 7.9 7.8 0 2.5 2.6 2.9 0.8 1.8 0.3 0.9 1.0 0.2 2.8 0.3 0.2 0.6 4.0 6.2 5.3 0.2
0.5
0.2 0.7 4.2 -
[2] 4iw2.a 0.8 2.0 7.5 2.0 1.5 2.2 1.9 2.1 0.7 0.3 1.7 0 2.0 9.2 0 7.2 7.4 2.9 5.5 7.2 0.3 0.2 0.4 0.5 0.7 2.3 8.7 7.6 8.4 6.1 11 8.3 2.8 7.2 7.2 0.1 2.8 2.9 3.0 0.4 1.5 0.2 0.9 1.1 0.1 2.9 0.1 0.6 0.5 4.1 6.3 5.0 0.2 0.8
0.9
0.3 4.2 -
[2] 5x52.a 0.4 0.6 4.8 0.7 0.1 0.9 0.7 0.8 1.2 0.7 0.4 0 0.8 7.3 0.1 6.1 5.2 2.4 3.1 7.0 0 0 0.3 0.2 0.2 0.8 8.1 7.5 7.4 4.1 10 4.5 1.5 6.6 6.1 0.1 1.5 2.3 2.4 0.7 0.5 0.2 1.5 0.6 1.1 1.6 0.6 0.6 0.1 3.8 4.5 4.0 0.2 0.7 0.8
0
3.6 -
[2] 6ezq.a 0.5 1.0 5.9 1.3 0.6 2.6 2.4 0.8 0.8 0.6 0.6 0.9 1.2 5.7 0.3 3.7 3.5 2.0 3.1 5.0 0 0 1.4 1.9 1.0 1.7 7.4 7.4 8.0 4.5 7.9 6.8 1.6 3.2 2.1 0.1 1.8 1.6 1.8 1.2 1.0 0.2 0.9 0.7 0.3 2.8 1.6 0.4 0.1 1.1 1.5 0.8 0.2 0.5 1.0 0.1
0
-
[3] 1uor.a 3.4 4.9 9.3 4.8 5.4 5.8 6.2 6.1 6.0 6.2 4.9 2.3 5.4 14 5.8 12 11 7.1 10 14 2.6 3.1 7.2 6.8 7.6 5.8 11 11 13 11 13 8.3 3.0 8.6 5.4 2.8 5.7 6.3 7.0 4.5 3.5 3.3 3.4 4.1 4.0 5.2 1.8 2.9 5.4 4.7 5.8 4.5 3.2 5.9 6.9 1.2 5.4
-
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (3 clusters)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
1bke.a
1e7c.a
1e7e.a
1e7f.a
1e7h.a
1e7i.a
1gni.a
1gnj.a
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2bxp.a
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2xvv.a
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4z69.i
5id7.a
5id7.b
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2xw0.a
3lu6.a
3lu7.a
4e99.a
4iw1.a
4iw2.a
5x52.a
6ezq.a
1uor.a
[1] 1bke.a
0
.09 .09 .09 .08 .09 .09 .10 .09 .10 .09 .15 .07 .09 .08 .11 .11 .08 .10 .13 .11 .08 .05 .06 .06 .13 .14 .12 .06 .25 .09 .13 .13 .15 .13 .26 .26 .26 .25 .28 .24 .27 .27 .28 .28 .25 .29 .28 .26 .30 .30 .28 .40 .28 .27 .26 .27 .44
[1] 1e7c.a .09
0
.05 .09 .09 .11 .08 .07 .12 .14 .07 .13 .12 .10 .11 .11 .10 .11 .08 .15 .10 .06 .09 .10 .12 .18 .14 .08 .11 .24 .12 .09 .09 .13 .14 .30 .32 .32 .30 .31 .28 .30 .30 .32 .31 .26 .24 .31 .28 .35 .32 .31 .42 .32 .30 .30 .33 .43
[1] 1e7e.a .09 .05
0
.06 .09 .10 .08 .06 .11 .14 .06 .11 .11 .09 .10 .10 .10 .11 .08 .16 .09 .05 .10 .10 .11 .17 .14 .08 .11 .23 .11 .08 .08 .12 .13 .29 .32 .31 .30 .30 .27 .30 .30 .32 .31 .26 .25 .30 .28 .34 .32 .31 .43 .32 .31 .31 .33 .43
[1] 1e7f.a .09 .09 .06
0
.06 .06 .06 .06 .10 .11 .04 .11 .07 .07 .08 .08 .08 .09 .07 .14 .09 .06 .09 .11 .09 .15 .14 .09 .10 .20 .10 .10 .11 .09 .10 .29 .29 .31 .30 .31 .26 .30 .28 .29 .29 .27 .26 .31 .28 .32 .28 .28 .42 .32 .31 .30 .29 .43
[1] 1e7h.a .08 .09 .09 .06
0
.05 .05 .09 .09 .10 .06 .15 .08 .06 .08 .07 .08 .10 .10 .13 .11 .08 .09 .10 .09 .15 .13 .11 .07 .23 .07 .13 .13 .10 .11 .28 .27 .29 .29 .30 .26 .29 .26 .28 .27 .26 .27 .30 .27 .30 .27 .26 .40 .31 .30 .28 .27 .43
[1] 1e7i.a .09 .11 .10 .06 .05
0
.05 .07 .09 .09 .07 .14 .07 .06 .07 .07 .06 .09 .10 .12 .11 .09 .09 .11 .09 .16 .13 .13 .10 .22 .08 .12 .13 .09 .10 .28 .27 .29 .29 .30 .25 .29 .26 .28 .28 .26 .27 .30 .27 .29 .26 .26 .40 .30 .29 .29 .27 .41
[1] 1gni.a .09 .08 .08 .06 .05 .05
0
.07 .08 .09 .06 .13 .08 .06 .07 .07 .06 .09 .08 .12 .09 .08 .10 .11 .10 .16 .12 .11 .09 .23 .07 .11 .12 .10 .11 .30 .28 .31 .30 .32 .27 .30 .27 .29 .29 .27 .28 .31 .28 .31 .29 .27 .42 .32 .31 .29 .28 .44
[1] 1gnj.a .10 .07 .06 .06 .09 .07 .07
0
.10 .10 .05 .13 .07 .06 .08 .07 .07 .07 .08 .13 .09 .06 .08 .12 .09 .16 .11 .08 .11 .22 .11 .10 .10 .10 .11 .29 .30 .32 .30 .30 .27 .30 .29 .30 .30 .26 .25 .31 .28 .31 .31 .30 .42 .32 .31 .30 .30 .42
[1] 1h9z.a .09 .12 .11 .10 .09 .09 .08 .10
0
.06 .08 .17 .08 .08 .04 .08 .09 .05 .10 .09 .14 .11 .09 .09 .08 .15 .11 .13 .09 .27 .06 .14 .14 .13 .14 .26 .29 .30 .29 .28 .27 .28 .24 .26 .26 .26 .28 .28 .27 .29 .30 .28 .41 .29 .28 .29 .26 .47
[1] 1ha2.a .10 .14 .14 .11 .10 .09 .09 .10 .06
0
.10 .17 .08 .09 .06 .09 .11 .05 .12 .09 .13 .12 .08 .11 .08 .13 .10 .12 .10 .24 .09 .16 .18 .11 .11 .26 .26 .28 .27 .27 .25 .26 .25 .26 .26 .26 .29 .27 .24 .28 .29 .26 .37 .29 .28 .26 .25 .43
[1] 1hk5.a .09 .07 .06 .04 .06 .07 .06 .05 .08 .10
0
.13 .07 .07 .07 .06 .07 .08 .08 .12 .08 .05 .08 .10 .08 .15 .13 .08 .08 .22 .08 .10 .10 .09 .09 .27 .28 .29 .28 .29 .25 .28 .26 .28 .27 .26 .25 .29 .27 .30 .27 .27 .42 .31 .29 .28 .28 .42
[1] 1n5u.a .15 .13 .11 .11 .15 .14 .13 .13 .17 .17 .13
0
.15 .14 .16 .16 .14 .17 .13 .19 .12 .12 .15 .15 .16 .14 .15 .12 .14 .19 .14 .08 .08 .14 .15 .34 .36 .36 .36 .34 .30 .34 .34 .36 .36 .31 .31 .35 .32 .38 .36 .34 .43 .34 .34 .32 .37 .44
[1] 2bxi.a .07 .12 .11 .07 .08 .07 .08 .07 .08 .08 .07 .15
0
.06 .05 .07 .09 .06 .12 .11 .10 .08 .05 .08 .05 .13 .10 .11 .08 .23 .08 .13 .14 .12 .10 .26 .26 .27 .27 .27 .24 .26 .25 .26 .25 .25 .27 .28 .25 .28 .27 .25 .38 .29 .27 .26 .25 .42
[1] 2bxk.a .09 .10 .09 .07 .06 .06 .06 .06 .08 .09 .07 .14 .06
0
.07 .04 .06 .08 .11 .09 .11 .10 .08 .11 .08 .14 .11 .11 .09 .24 .07 .13 .13 .11 .11 .29 .29 .31 .29 .30 .27 .29 .26 .29 .28 .26 .29 .30 .28 .28 .28 .26 .41 .31 .30 .29 .26 .44
[1] 2bxl.a .08 .11 .10 .08 .08 .07 .07 .08 .04 .06 .07 .16 .05 .07
0
.07 .08 .05 .12 .08 .12 .08 .07 .08 .06 .14 .10 .11 .08 .25 .06 .14 .14 .12 .12 .25 .27 .29 .27 .26 .25 .26 .24 .24 .24 .25 .27 .27 .24 .27 .29 .26 .38 .28 .27 .26 .25 .44
[1] 2bxm.a .11 .11 .10 .08 .07 .07 .07 .07 .08 .09 .06 .16 .07 .04 .07
0
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[1] 2bxn.a .11 .10 .10 .08 .08 .06 .06 .07 .09 .11 .07 .14 .09 .06 .08 .05
0
.09 .10 .09 .11 .09 .11 .13 .12 .17 .11 .12 .11 .25 .09 .12 .13 .11 .12 .31 .30 .32 .32 .32 .27 .32 .29 .31 .31 .29 .30 .33 .30 .31 .30 .29 .44 .35 .33 .32 .28 .44
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0
.09 .10 .13 .10 .06 .09 .07 .15 .10 .12 .09 .27 .08 .13 .14 .14 .13 .26 .28 .29 .28 .28 .25 .27 .26 .27 .27 .26 .28 .28 .26 .29 .30 .28 .41 .29 .28 .27 .27 .45
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0
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[1] 2bxq.a .13 .15 .16 .14 .13 .12 .12 .13 .09 .09 .12 .19 .11 .09 .08 .08 .09 .10 .16
0
.15 .15 .12 .13 .12 .14 .09 .14 .12 .26 .09 .19 .18 .11 .12 .27 .27 .30 .29 .28 .27 .27 .25 .26 .27 .28 .31 .28 .28 .24 .31 .27 .40 .31 .31 .30 .21 .46
[1] 2i2z.a .11 .10 .09 .09 .11 .11 .09 .09 .14 .13 .08 .12 .10 .11 .12 .12 .11 .13 .11 .15
0
.07 .10 .13 .11 .17 .14 .08 .11 .21 .12 .12 .12 .12 .12 .28 .29 .28 .29 .29 .25 .29 .28 .30 .29 .26 .25 .29 .27 .32 .29 .29 .39 .31 .31 .29 .31 .41
[1] 2i30.a .08 .06 .05 .06 .08 .09 .08 .06 .11 .12 .05 .12 .08 .10 .08 .10 .09 .10 .07 .15 .07
0
.06 .09 .08 .16 .14 .07 .09 .21 .12 .10 .10 .11 .12 .27 .30 .30 .29 .29 .26 .27 .29 .30 .29 .25 .24 .29 .26 .33 .30 .29 .41 .31 .29 .28 .31 .42
[1] 2xsi.a .05 .09 .10 .09 .09 .09 .10 .08 .09 .08 .08 .15 .05 .08 .07 .09 .11 .06 .10 .12 .10 .06
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[1] 2xvv.a .06 .10 .10 .11 .10 .11 .11 .12 .09 .11 .10 .15 .08 .11 .08 .12 .13 .09 .12 .13 .13 .09 .05
0
.06 .15 .15 .12 .08 .23 .10 .14 .13 .16 .16 .24 .27 .26 .26 .25 .24 .24 .25 .26 .26 .23 .26 .25 .22 .28 .30 .27 .36 .25 .24 .23 .26 .43
[1] 2xvw.a .06 .12 .11 .09 .09 .09 .10 .09 .08 .08 .08 .16 .05 .08 .06 .10 .12 .07 .11 .12 .11 .08 .04 .06
0
.14 .12 .11 .08 .23 .09 .14 .14 .14 .14 .25 .26 .27 .27 .26 .24 .25 .25 .25 .26 .24 .27 .27 .24 .28 .29 .26 .36 .27 .26 .23 .26 .43
[1] 3a73.a .13 .18 .17 .15 .15 .16 .16 .16 .15 .13 .15 .14 .13 .14 .14 .15 .17 .15 .18 .14 .17 .16 .13 .15 .14
0
.11 .16 .11 .16 .13 .14 .15 .14 .14 .28 .28 .28 .29 .30 .25 .28 .28 .29 .29 .27 .31 .29 .28 .31 .32 .28 .39 .30 .31 .29 .25 .45
[1] 3b9l.a .14 .14 .14 .14 .13 .13 .12 .11 .11 .10 .13 .15 .10 .11 .10 .11 .11 .10 .15 .09 .14 .14 .12 .15 .12 .11
0
.12 .12 .22 .08 .13 .13 .13 .13 .29 .29 .31 .30 .30 .28 .29 .28 .29 .30 .28 .32 .31 .30 .29 .33 .29 .42 .34 .34 .31 .27 .46
[1] 3b9m.a .12 .08 .08 .09 .11 .13 .11 .08 .13 .12 .08 .12 .11 .11 .11 .13 .12 .12 .10 .14 .08 .07 .10 .12 .11 .16 .12
0
.10 .22 .12 .12 .12 .11 .12 .29 .32 .32 .30 .30 .27 .29 .29 .30 .30 .26 .25 .29 .27 .32 .32 .30 .41 .32 .31 .30 .32 .42
[1] 3cx9.a .06 .11 .11 .10 .07 .10 .09 .11 .09 .10 .08 .14 .08 .09 .08 .10 .11 .09 .10 .12 .11 .09 .06 .08 .08 .11 .12 .10
0
.25 .05 .13 .13 .12 .13 .26 .27 .27 .26 .28 .24 .26 .27 .27 .28 .25 .29 .28 .25 .29 .29 .26 .39 .28 .27 .25 .28 .44
[1] 3tdl.a .25 .24 .23 .20 .23 .22 .23 .22 .27 .24 .22 .19 .23 .24 .25 .24 .25 .27 .24 .26 .21 .21 .23 .23 .23 .16 .22 .22 .25
0
.26 .21 .20 .19 .20 .33 .34 .33 .35 .33 .31 .32 .34 .35 .35 .31 .30 .33 .32 .35 .34 .34 .36 .34 .35 .31 .30 .43
[1] 3uiv.h .09 .12 .11 .10 .07 .08 .07 .11 .06 .09 .08 .14 .08 .07 .06 .08 .09 .08 .11 .09 .12 .12 .09 .10 .09 .13 .08 .12 .05 .26
0
.13 .14 .12 .13 .28 .28 .29 .28 .29 .26 .28 .25 .27 .27 .26 .30 .29 .27 .28 .29 .26 .41 .28 .29 .26 .26 .46
[1] 4z69.a .13 .09 .08 .10 .13 .12 .11 .10 .14 .16 .10 .08 .13 .13 .14 .13 .12 .13 .11 .19 .12 .10 .13 .14 .14 .14 .13 .12 .13 .21 .13
0
.03 .15 .14 .31 .34 .34 .33 .32 .28 .32 .33 .34 .34 .29 .28 .33 .30 .38 .33 .33 .44 .35 .33 .32 .36 .44
[1] 4z69.i .13 .09 .08 .11 .13 .13 .12 .10 .14 .18 .10 .08 .14 .13 .14 .14 .13 .14 .11 .18 .12 .10 .13 .13 .14 .15 .13 .12 .13 .20 .14 .03
0
.15 .16 .32 .34 .34 .33 .31 .29 .31 .32 .34 .34 .29 .29 .33 .30 .37 .34 .33 .42 .34 .32 .32 .35 .43
[1] 5id7.a .15 .13 .12 .09 .10 .09 .10 .10 .13 .11 .09 .14 .12 .11 .12 .10 .11 .14 .11 .11 .12 .11 .13 .16 .14 .14 .13 .11 .12 .19 .12 .15 .15
0
.04 .31 .29 .31 .31 .31 .28 .29 .29 .30 .30 .29 .28 .31 .29 .31 .29 .28 .41 .33 .32 .31 .27 .43
[1] 5id7.b .13 .14 .13 .10 .11 .10 .11 .11 .14 .11 .09 .15 .10 .11 .12 .10 .12 .13 .14 .12 .12 .12 .13 .16 .14 .14 .13 .12 .13 .20 .13 .14 .16 .04
0
.31 .28 .31 .31 .31 .27 .29 .29 .30 .30 .30 .29 .30 .29 .31 .29 .28 .41 .33 .32 .31 .26 .41
[2] 1e7b.a .26 .30 .29 .29 .28 .28 .30 .29 .26 .26 .27 .34 .26 .29 .25 .29 .31 .26 .32 .27 .28 .27 .25 .24 .25 .28 .29 .29 .26 .33 .28 .31 .32 .31 .31
0
.11 .11 .09 .06 .08 .07 .08 .06 .07 .08 .12 .06 .07 .11 .14 .11 .19 .11 .11 .09 .17 .28
[2] 1hk1.a .26 .32 .32 .29 .27 .27 .28 .30 .29 .26 .28 .36 .26 .29 .27 .29 .30 .28 .32 .27 .29 .30 .28 .27 .26 .28 .29 .32 .27 .34 .28 .34 .34 .29 .28 .11
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0
.07 .12 .09 .10 .13 .11 .11 .12 .18 .09 .10 .13 .14 .11 .19 .14 .14 .12 .16 .28
[2] 1hk3.a .25 .30 .30 .30 .29 .29 .30 .30 .29 .27 .28 .36 .27 .29 .27 .30 .32 .28 .32 .29 .29 .29 .26 .26 .27 .29 .30 .30 .26 .35 .28 .33 .33 .31 .31 .09 .07 .07
0
.10 .09 .09 .09 .08 .09 .11 .16 .10 .09 .13 .12 .10 .21 .14 .14 .12 .17 .29
[2] 1tf0.a .28 .31 .30 .31 .30 .30 .32 .30 .28 .27 .29 .34 .27 .30 .26 .29 .32 .28 .33 .28 .29 .29 .26 .25 .26 .30 .30 .30 .28 .33 .29 .32 .31 .31 .31 .06 .14 .12 .10
0
.11 .08 .09 .09 .10 .09 .12 .08 .10 .13 .14 .12 .17 .10 .11 .09 .18 .27
[2] 2bx8.a .24 .28 .27 .26 .26 .25 .27 .27 .27 .25 .25 .30 .24 .27 .25 .27 .27 .25 .29 .27 .25 .26 .24 .24 .24 .25 .28 .27 .24 .31 .26 .28 .29 .28 .27 .08 .09 .09 .09 .11
0
.06 .09 .08 .06 .08 .15 .08 .06 .12 .12 .09 .22 .13 .13 .11 .17 .26
[2] 2bxa.b .27 .30 .30 .30 .29 .29 .30 .30 .28 .26 .28 .34 .26 .29 .26 .30 .32 .27 .31 .27 .29 .27 .25 .24 .25 .28 .29 .29 .26 .32 .28 .32 .31 .29 .29 .07 .10 .10 .09 .08 .06
0
.09 .07 .06 .07 .13 .04 .06 .10 .13 .09 .18 .12 .10 .08 .16 .28
[2] 2bxb.a .27 .30 .30 .28 .26 .26 .27 .29 .24 .25 .26 .34 .25 .26 .24 .27 .29 .26 .31 .25 .28 .29 .27 .25 .25 .28 .28 .29 .27 .34 .25 .33 .32 .29 .29 .08 .10 .13 .09 .09 .09 .09
0
.05 .05 .09 .12 .08 .08 .11 .12 .08 .20 .11 .12 .12 .13 .31
[2] 2bxc.a .28 .32 .32 .29 .28 .28 .29 .30 .26 .26 .28 .36 .26 .29 .24 .29 .31 .27 .32 .26 .30 .30 .27 .26 .25 .29 .29 .30 .27 .35 .27 .34 .34 .30 .30 .06 .09 .11 .08 .09 .08 .07 .05
0
.03 .09 .14 .07 .08 .10 .11 .08 .18 .12 .12 .10 .14 .29
[2] 2bxd.a .28 .31 .31 .29 .27 .28 .29 .30 .26 .26 .27 .36 .25 .28 .24 .28 .31 .27 .33 .27 .29 .29 .28 .26 .26 .29 .30 .30 .28 .35 .27 .34 .34 .30 .30 .07 .08 .11 .09 .10 .06 .06 .05 .03
0
.09 .14 .06 .08 .10 .11 .08 .19 .13 .13 .13 .16 .29
[2] 2bxe.a .25 .26 .26 .27 .26 .26 .27 .26 .26 .26 .26 .31 .25 .26 .25 .27 .29 .26 .28 .28 .26 .25 .24 .23 .24 .27 .28 .26 .25 .31 .26 .29 .29 .29 .30 .08 .13 .12 .11 .09 .08 .07 .09 .09 .09
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.11 .07 .08 .12 .13 .11 .21 .13 .13 .10 .18 .28
[2] 2bxg.a .29 .24 .25 .26 .27 .27 .28 .25 .28 .29 .25 .31 .27 .29 .27 .28 .30 .28 .28 .31 .25 .24 .27 .26 .27 .31 .32 .25 .29 .30 .30 .28 .29 .28 .29 .12 .19 .18 .16 .12 .15 .13 .12 .14 .14 .11
0
.13 .13 .18 .18 .17 .23 .14 .15 .14 .21 .30
[2] 2bxh.a .28 .31 .30 .31 .30 .30 .31 .31 .28 .27 .29 .35 .28 .30 .27 .31 .33 .28 .33 .28 .29 .29 .27 .25 .27 .29 .31 .29 .28 .33 .29 .33 .33 .31 .30 .06 .09 .09 .10 .08 .08 .04 .08 .07 .06 .07 .13
0
.06 .10 .13 .10 .18 .10 .10 .10 .17 .29
[2] 2xvu.a .26 .28 .28 .28 .27 .27 .28 .28 .27 .24 .27 .32 .25 .28 .24 .28 .30 .26 .30 .28 .27 .26 .24 .22 .24 .28 .30 .27 .25 .32 .27 .30 .30 .29 .29 .07 .11 .10 .09 .10 .06 .06 .08 .08 .08 .08 .13 .06
0
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[2] 2xw0.a .30 .35 .34 .32 .30 .29 .31 .31 .29 .28 .30 .38 .28 .28 .27 .28 .31 .29 .35 .24 .32 .33 .29 .28 .28 .31 .29 .32 .29 .35 .28 .38 .37 .31 .31 .11 .11 .13 .13 .13 .12 .10 .11 .10 .10 .12 .18 .10 .13
0
.16 .11 .23 .17 .17 .13 .15 .28
[2] 3lu6.a .30 .32 .32 .28 .27 .26 .29 .31 .30 .29 .27 .36 .27 .28 .29 .27 .30 .30 .33 .31 .29 .30 .29 .30 .29 .32 .33 .32 .29 .34 .29 .33 .34 .29 .29 .14 .11 .14 .12 .14 .12 .13 .12 .11 .11 .13 .18 .13 .14 .16
0
.09 .22 .16 .16 .15 .19 .28
[2] 3lu7.a .28 .31 .31 .28 .26 .26 .27 .30 .28 .26 .27 .34 .25 .26 .26 .27 .29 .28 .31 .27 .29 .29 .27 .27 .26 .28 .29 .30 .26 .34 .26 .33 .33 .28 .28 .11 .08 .11 .10 .12 .09 .09 .08 .08 .08 .11 .17 .10 .10 .11 .09
0
.20 .14 .12 .12 .14 .28
[2] 4e99.a .40 .42 .43 .42 .40 .40 .42 .42 .41 .37 .42 .43 .38 .41 .38 .42 .44 .41 .44 .40 .39 .41 .38 .36 .36 .39 .42 .41 .39 .36 .41 .44 .42 .41 .41 .19 .21 .19 .21 .17 .22 .18 .20 .18 .19 .21 .23 .18 .19 .23 .22 .20
0
.19 .17 .16 .24 .32
[2] 4iw1.a .28 .32 .32 .32 .31 .30 .32 .32 .29 .29 .31 .34 .29 .31 .28 .32 .35 .29 .35 .31 .31 .31 .28 .25 .27 .30 .34 .32 .28 .34 .28 .35 .34 .33 .33 .11 .15 .14 .14 .10 .13 .12 .11 .12 .13 .13 .14 .10 .11 .17 .16 .14 .19
0
.07 .09 .17 .29
[2] 4iw2.a .27 .30 .31 .31 .30 .29 .31 .31 .28 .28 .29 .34 .27 .30 .27 .31 .33 .28 .32 .31 .31 .29 .26 .24 .26 .31 .34 .31 .27 .35 .29 .33 .32 .32 .32 .11 .15 .14 .14 .11 .13 .10 .12 .12 .13 .13 .15 .10 .11 .17 .16 .12 .17 .07
0
.09 .16 .29
[2] 5x52.a .26 .30 .31 .30 .28 .29 .29 .30 .29 .26 .28 .32 .26 .29 .26 .30 .32 .27 .31 .30 .29 .28 .25 .23 .23 .29 .31 .30 .25 .31 .26 .32 .32 .31 .31 .09 .13 .12 .12 .09 .11 .08 .12 .10 .13 .10 .14 .10 .09 .13 .15 .12 .16 .09 .09
0
.17 .30
[2] 6ezq.a .27 .33 .33 .29 .27 .27 .28 .30 .26 .25 .28 .37 .25 .26 .25 .26 .28 .27 .32 .21 .31 .31 .27 .26 .26 .25 .27 .32 .28 .30 .26 .36 .35 .27 .26 .17 .16 .16 .17 .18 .17 .16 .13 .14 .16 .18 .21 .17 .18 .15 .19 .14 .24 .17 .16 .17
0
.34
[3] 1uor.a .44 .43 .43 .43 .43 .41 .44 .42 .47 .43 .42 .44 .42 .44 .44 .44 .44 .45 .45 .46 .41 .42 .43 .43 .43 .45 .46 .42 .44 .43 .46 .44 .43 .43 .41 .28 .29 .28 .29 .27 .26 .28 .31 .29 .29 .28 .30 .29 .27 .28 .28 .28 .32 .29 .29 .30 .34
0
[Pocket clash dissimilarity matrix]

Site backbone RMSD (median 1.4 Å)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by RMSD of site residue backbone atoms

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥10 Å
9 Å
8 Å
7 Å
6 Å
5 Å
4 Å
3 Å
2 Å
1 Å
0 Å
1bke.a
1e7c.a
1e7e.a
1e7f.a
1e7h.a
1e7i.a
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1gnj.a
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1n5u.a
2bxi.a
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2bxm.a
2bxn.a
2bxo.a
2bxp.a
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2xvv.a
2xvw.a
3a73.a
3b9l.a
3b9m.a
3cx9.a
3tdl.a
3uiv.h
4z69.a
4z69.i
5id7.a
5id7.b
1e7b.a
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1hk3.a
1tf0.a
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2bxd.a
2bxe.a
2bxg.a
2bxh.a
2xvu.a
2xw0.a
3lu6.a
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4e99.a
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4iw2.a
5x52.a
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1uor.a
[1] 1bke.a
0
0.3 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.6 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.4 0.4 0.5 0.3 0.5 0.5 0.5 0.5 0.8 0.5 0.7 0.7 0.6 0.6 1.7 1.6 1.7 1.7 1.6 1.7 1.6 1.7 1.7 1.7 1.8 1.7 1.7 1.7 1.7 1.8 1.7 1.9 1.6 1.6 1.6 1.5 1.8
[1] 1e7c.a 0.3
0
0.3 0.4 0.5 0.4 0.4 0.4 0.3 0.4 0.3 0.6 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.4 0.6 0.4 0.5 0.4 0.4 0.4 0.9 0.5 0.7 0.7 0.6 0.6 1.7 1.7 1.8 1.7 1.7 1.8 1.7 1.8 1.8 1.8 1.8 1.7 1.7 1.7 1.7 1.8 1.7 2.0 1.6 1.7 1.7 1.6 1.9
[1] 1e7e.a 0.4 0.3
0
0.4 0.5 0.4 0.4 0.5 0.3 0.5 0.4 0.6 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.5 0.4 0.3 0.4 0.5 0.4 0.6 0.5 0.5 0.5 0.9 0.6 0.7 0.7 0.7 0.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 1.8 1.5 1.6 1.6 1.4 1.8
[1] 1e7f.a 0.3 0.4 0.4
0
0.3 0.3 0.3 0.5 0.3 0.3 0.3 0.6 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.4 0.3 0.4 0.3 0.5 0.3 0.5 0.5 0.5 0.5 0.8 0.5 0.7 0.7 0.6 0.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 1.8 1.5 1.6 1.6 1.4 1.8
[1] 1e7h.a 0.4 0.5 0.5 0.3
0
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[1] 1e7i.a 0.3 0.4 0.4 0.3 0.3
0
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[1] 1gni.a 0.3 0.4 0.4 0.3 0.3 0.2
0
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[1] 1gnj.a 0.4 0.4 0.5 0.5 0.4 0.4 0.4
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[1] 1h9z.a 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4
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[1] 1ha2.a 0.3 0.4 0.5 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.2
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[1] 1hk5.a 0.3 0.3 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4 0.3 0.4
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[1] 1n5u.a 0.6 0.6 0.6 0.6 0.7 0.7 0.6 0.7 0.6 0.6 0.6
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[1] 2bxl.a 0.3 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.7 0.3 0.3
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[1] 2bxm.a 0.3 0.3 0.4 0.3 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.5 0.3 0.2 0.3
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[1] 2bxn.a 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.2 0.6 0.3 0.3 0.3 0.2
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[1] 2bxo.a 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.2 0.3 0.3 0.6 0.3 0.3 0.3 0.2 0.2
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[1] 2bxq.a 0.4 0.3 0.5 0.4 0.5 0.4 0.4 0.3 0.3 0.4 0.3 0.6 0.4 0.2 0.4 0.2 0.3 0.3 0.3
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[1] 2i2z.a 0.3 0.3 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4 0.2 0.3 0.2 0.6 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.2 0.3 0.3
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[1] 2i30.a 0.4 0.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 0.7 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4 0.4 0.3
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[1] 2xsi.a 0.4 0.4 0.4 0.3 0.4 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.6 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.4 0.4 0.3 0.3
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[1] 2xvv.a 0.5 0.6 0.5 0.5 0.6 0.5 0.6 0.6 0.4 0.5 0.6 0.7 0.5 0.6 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.6 0.5 0.5 0.4
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[1] 2xvw.a 0.3 0.4 0.4 0.3 0.4 0.3 0.4 0.4 0.2 0.3 0.3 0.6 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.2 0.3
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[1] 3a73.a 0.5 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.5 0.4 0.5 0.5 0.7 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.6 0.5
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[1] 3b9l.a 0.5 0.4 0.5 0.5 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.7 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.5 0.5 0.4 0.5 0.5 0.5 0.7 0.5 0.5
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[1] 3b9m.a 0.5 0.4 0.5 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.5 0.5 0.6 0.5 0.4 0.5 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.5 0.5 0.5 0.6 0.5 0.4 0.3
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[1] 3cx9.a 0.5 0.4 0.5 0.5 0.6 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.4 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.4 0.5 0.4 0.5 0.4 0.5 0.4 0.5 0.5 0.5
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[1] 3tdl.a 0.8 0.9 0.9 0.8 0.7 0.8 0.7 0.8 0.8 0.7 0.9 0.9 0.7 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.9 0.8 0.8 0.8 0.9 0.8 0.7 0.9 0.9 0.9
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[1] 3uiv.h 0.5 0.5 0.6 0.5 0.6 0.6 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.6 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.5 0.5 0.6 0.5 0.6 0.5 0.5 0.6 0.5 0.4 0.9
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[1] 4z69.a 0.7 0.7 0.7 0.7 0.8 0.8 0.8 0.8 0.7 0.8 0.7 0.4 0.8 0.7 0.8 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.8 0.7 0.6 1.1 0.5
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[1] 4z69.i 0.7 0.7 0.7 0.7 0.8 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.7 0.4 0.7 0.7 0.8 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.7 0.6 0.5 1.1 0.5 0.1
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[1] 5id7.a 0.6 0.6 0.7 0.6 0.6 0.6 0.5 0.6 0.6 0.6 0.7 0.7 0.6 0.6 0.7 0.5 0.6 0.5 0.6 0.6 0.6 0.6 0.6 0.7 0.6 0.4 0.6 0.6 0.7 0.7 0.6 0.8 0.8
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[1] 5id7.b 0.6 0.6 0.6 0.6 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0.6 0.7 0.7 0.6 0.5 0.6 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.6 0.6 0.6 0.7 0.5 0.4 0.6 0.5 0.6 0.7 0.6 0.8 0.8 0.2
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[2] 1e7b.a 1.7 1.7 1.6 1.6 1.5 1.6 1.6 1.7 1.6 1.6 1.7 1.9 1.6 1.7 1.6 1.7 1.6 1.6 1.7 1.7 1.6 1.6 1.6 1.5 1.6 1.7 1.8 1.8 1.7 1.6 1.8 1.9 1.9 1.8 1.7
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[2] 1hk1.a 1.6 1.7 1.6 1.6 1.5 1.6 1.6 1.7 1.6 1.5 1.7 1.9 1.5 1.7 1.5 1.7 1.6 1.6 1.7 1.7 1.6 1.5 1.5 1.5 1.6 1.7 1.7 1.8 1.7 1.6 1.8 1.9 1.8 1.7 1.7 0.4
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