If you see this message after the page is completely loaded, then JavaScript is not supported or disabled in your browser. Please consider enabling JavaScript for this site.

ALBU_HUMAN_25_609_halothaneSite

Serum albumin [ALB/AFP/VDB family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer [domain annotation]
A1 (ALBU_HUMAN):D: Albumin 2 (219, 220, 222:224, 226, 227, 230, 231, 233:240, 242, 243, 246, 247, 252, 256, 259, 260, 262, 265, 266, 281, 284, 285, 288, 311, 314, 315, 317, 348, 349, 351, 352, 355, 368, 371, 374, 375, 378)
D: Albumin 3 (474:479, 481, 503:506, 508, 509)
174, 219, 220, 222:224, 226, 227, 230, 231, 233:240, 242, 243, 246, 247, 252, 256, 259, 260, 262, 265, 266, 281, 284, 285, 288, 311, 314, 315, 317, 348, 349, 351, 352, 355, 368, 371, 374, 375, 378, 474:479, 481, 503:506, 508, 509

Full PDB list

1ao6, 1bj5, 1bke, 1bm0, 1e78, 1e7a, 1e7b, 1e7c, 1e7e, 1e7f, 1e7g, 1e7h, 1e7i, 1gni, 1gnj, 1h9z, 1ha2, 1hk1, 1hk2, 1hk3, 1hk4, 1hk5, 1n5u, 1o9x, 1tf0, 1uor, 2bx8, 2bxa, 2bxb, 2bxc, 2bxd, 2bxe, 2bxf, 2bxg, 2bxh, 2bxi, 2bxk, 2bxl, 2bxm, 2bxn, 2bxo, 2bxp, 2bxq, 2i2z, 2i30, 2vdb, 2vue, 2vuf, 2xsi, 2xvq, 2xvu, 2xvv, 2xvw, 2xw0, 2xw1, 3a73, 3b9l, 3b9m, 3cx9, 3jqz, 3lu6, 3lu7, 3lu8, 3tdl, 3uiv, 4e99, 4iw1, 4iw2, 4l8u, 4l9k, 4l9q, 4la0, 4lb2, 4lb9, 4z69, 5id7, 5ujb, 5x52, 5yoq, 6ezq (redundant Pocketome entry); 2ydf, 3jry, 3sqj, 4bke, 4emx, 4g03, 4g04, 4hgk, 4hgm, 4k2c, 4k71, 4n0f, 4s1y, 5gix, 5giy, 5ifo, 5ijf, 5vnw (unprocessed)

Pocket contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
   
ligand
A1
Y
1
7
4
K
2
1
9
L
2
2
2
K
2
2
3
S
2
2
6
L
2
2
7
F
2
3
0
G
2
3
1
R
2
3
3
A
2
3
4
F
2
3
5
K
2
3
6
A
2
3
7
W
2
3
8
A
2
3
9
V
2
4
0
R
2
4
2
L
2
4
3
R
2
4
6
F
2
4
7
F
2
5
2
S
2
5
6
V
2
5
9
L
2
6
2
V
2
6
5
H
2
6
6
R
2
8
1
L
2
8
4
I
2
8
8
S
3
1
1
I
3
1
4
A
3
1
5
D
3
4
8
V
3
4
9
L
3
5
1
G
3
5
2
L
3
5
5
V
3
6
8
L
3
7
1
A
3
7
4
K
3
7
5
E
3
7
8
E
4
7
4
L
4
7
7
S
4
7
8
L
4
8
1
S
5
0
4
L
5
0
5
V
5
0
6
R
5
0
8
R
5
0
9
[1]1bm0.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7b.a hlt,hlt14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7c.a hlt,hlt,hlt21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7e.a dka,dka,dka31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7f.a dao14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7h.a plm18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7i.a ste19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gni.a ola17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1gnj.a acd22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1h9z.a myr,rwf39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ha2.a myr,swf39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hk2.a none . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hk3.a none . . . . . . . . . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hk5.a myr16 . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1n5u.a myr16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tf0.a dka,dka,E33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxe.a 1fl18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxg.a ibp15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxk.a imn,myr41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxn.a idb,myr50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxp.a myr,myr25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2i2z.a none . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vdb.a dka,E21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xw0.a 9nf26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3lu6.a imx,imx52 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3lu7.a ipx28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3tdl.a 11d,11d60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4z69.a dif19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5id7.a 6a424 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]6ezq.a c7k27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4e99.a p8s29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

[download in TSV format]
   
PDB.ch
A1
Y
1
7
4
K
2
1
9
Q
2
2
0
L
2
2
2
K
2
2
3
C
2
2
4
S
2
2
6
L
2
2
7
F
2
3
0
G
2
3
1
R
2
3
3
A
2
3
4
F
2
3
5
K
2
3
6
A
2
3
7
W
2
3
8
A
2
3
9
V
2
4
0
R
2
4
2
L
2
4
3
R
2
4
6
F
2
4
7
F
2
5
2
S
2
5
6
V
2
5
9
T
2
6
0
L
2
6
2
V
2
6
5
H
2
6
6
R
2
8
1
L
2
8
4
A
2
8
5
I
2
8
8
S
3
1
1
I
3
1
4
A
3
1
5
V
3
1
7
D
3
4
8
V
3
4
9
L
3
5
1
G
3
5
2
L
3
5
5
V
3
6
8
L
3
7
1
A
3
7
4
K
3
7
5
E
3
7
8
E
4
7
4
D
4
7
5
Y
4
7
6
L
4
7
7
S
4
7
8
V
4
7
9
L
4
8
1
E
5
0
3
S
5
0
4
L
5
0
5
V
5
0
6
R
5
0
8
R
5
0
9
[1]1bm0.b . . . * . . * . . . * . . . . * . . . * * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . .
[1]1e7b.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[1]1e7c.a . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7e.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1e7f.a . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1e7h.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1e7i.a . . . . * . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1gni.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]1gnj.a . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . .
[1]1h9z.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ha2.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . .
[1]1hk2.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . H . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[1]1hk3.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . P . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[1]1hk5.a . . . . . . . . . . * . . . . * . . H . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1n5u.a . . . . * . . . . . * . . . . * . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . .
[1]1tf0.a . . . * . . * . . . * . . . . * . . . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . * . . . . * . . .
[1]2bxe.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[1]2bxg.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . * . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . .
[1]2bxk.a . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . .
[1]2bxn.a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bxp.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . .
[1]2i2z.a . . . . aly . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . .
[1]2vdb.a . . . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . .
[1]2xw0.a . . . * . . * . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . .
[1]3lu6.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * . . . . * . . .
[1]3lu7.a . . . * . . * . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[1]3tdl.a . . . . * . * . . . . . . . . * . . * . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * * . . .
[1]4z69.a . . . . * . . . . . . . . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5id7.a . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . .
[1]6ezq.a . . . * . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . * . . .
[2]4e99.a * . . * . . * . . . . . . . . * . . . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . * * . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1bm0.b is apo
1e7b.a:hlt
1e7c.a:hlt
1e7e.a:dka
1e7f.a:dao
1e7h.a:plm
1e7i.a:ste
1gni.a:ola
1gnj.a:acd
1h9z.a:myr,rwf
1ha2.a:myr,swf
1hk2.a is apo
1hk3.a is apo
1hk5.a:myr
1n5u.a:myr
1tf0.a:E,dka
2bxe.a:1fl
2bxg.a:ibp
2bxk.a:imn,myr
2bxn.a:idb,myr
2bxp.a:myr
2i2z.a is apo
2vdb.a:E,dka
2xw0.a:9nf
3lu6.a:imx
3lu7.a:ipx
3tdl.a:11d
4z69.a:dif
5id7.a:6a4
6ezq.a:c7k
4e99.a:p8s
[1] 1bm0.b
-
0 0.1 3.4 0 0.2 0.2 0.1 1.4 0.9 0.9 - - 0.6 0 0.5 1.6 0.2 4.5 5.0 2.0 - 0 4.0 5.1 3.4 6.1 3.4 5.2 2.1 0
[1] 1e7b.a -
0.1
0.4 3.1 0 0 0.1 0 0 0.8 0.5 - - 0 0.1 0.1 0.2 0.1 4.2 4.2 2.0 - 0 4.5 5.3 4.4 6.0 3.2 5.8 3.0 0
[1] 1e7c.a - 0.1
0.1
0.4 0 0 0.1 0 0 1.2 0.7 - - 0 0 0.2 0.1 0 4.6 4.1 0 - 0 4.2 4.7 4.1 2.0 1.1 2.2 4.3 0.1
[1] 1e7e.a - 0.1 0.1
0
0 0 0 0 0 0.3 0.5 - - 0 0 0.1 0.1 0 4.1 2.5 0 - 0 3.7 4.1 3.2 2.6 0.5 1.9 3.1 0.2
[1] 1e7f.a - 0.2 0.4 1.0
0
0 0.2 0 0 1.7 1.9 - - 0 0 0.4 0.2 0.1 3.1 4.5 0 - 0 4.1 5.1 3.6 4.1 1.3 2.0 3.1 0.3
[1] 1e7h.a - 0.2 0.6 1.3 0
0
0.1 0 0 0.2 0.2 - - 0 0 0.4 0.2 0.1 1.6 1.7 0.1 - 0 2.4 3.0 1.4 1.8 1.8 0.8 1.3 0.2
[1] 1e7i.a - 0.1 0.1 1.3 0 0
0
0 0 0.4 0.3 - - 0 0 0.5 0.5 0.6 1.9 1.7 0 - 0 2.1 2.3 1.3 1.6 2.0 0.6 0.9 0.1
[1] 1gni.a - 0.1 0.4 1.4 0 0 0.1
0
0 0.1 0.2 - - 0 0 0.5 0.2 0.3 1.6 1.1 0.1 - 0 1.6 2.2 1.5 1.8 1.5 0.7 1.0 0.1
[1] 1gnj.a - 0.2 0.2 0.7 0 0 0 0
0
0.4 0.2 - - 0 0 0.1 0 0 2.7 2.0 0.1 - 0 3.5 3.8 2.5 1.5 1.3 0.9 1.8 0.2
[1] 1h9z.a - 0.1 0.5 0.8 0 0 0.1 0 0
0
0 - - 0 0 0.3 0 0.1 1.4 1.5 0 - 0 2.3 3.3 2.0 3.2 1.4 0.8 1.0 0.1
[1] 1ha2.a - 0.2 0.5 1.4 0 0 0.2 0 0 0
0
- - 0 0 0.5 0.1 0 1.4 1.6 0.5 - 0 2.6 3.6 2.0 3.6 2.5 1.1 1.5 0.1
[1] 1hk2.a - 0 0.2 4.6 0 0 0.1 0 0 0.1 0.1
-
- 0 0 0.3 0 0 4.9 5.6 2.6 - 0 3.5 3.8 3.2 3.7 4.4 5.3 3.0 0.2
[1] 1hk3.a - 0 0.3 3.6 0 0 0 0 0 0 0 -
-
0 0 0.1 0 0 3.9 4.4 2.1 - 0 2.9 3.3 3.0 3.5 3.4 4.9 2.6 0.2
[1] 1hk5.a - 0.2 0.3 0.7 0 0 0.1 0 0 0.4 0.3 - -
0
0 0.4 0 0.1 2.6 2.8 0 - 0 4.0 4.0 2.8 2.6 1.1 1.2 2.2 0
[1] 1n5u.a - 0.2 0.5 1.4 0 0 0.2 0.1 0 2.0 1.8 - - 0
0
0.7 0.4 0.4 3.4 4.2 0.4 - 0 6.4 6.9 5.3 4.6 2.1 4.9 4.7 0.3
[1] 1tf0.a - 0.3 0.3 3.6 0.4 0.6 0.1 0.2 0.1 1.4 1.0 - - 0.4 0
0.2
0.3 0.6 5.3 5.4 2.9 - 0 3.8 5.3 4.0 5.5 3.4 5.3 3.4 0.2
[1] 2bxe.a - 0.1 0.3 3.3 0 0 0.1 0 0 0.6 0.5 - - 0 0 0.3
0.1
0.1 4.0 4.8 1.6 - 0 3.2 3.3 3.4 3.7 3.0 6.1 2.4 0.1
[1] 2bxg.a - 0.1 0.2 2.9 0 0.2 0.1 0 0 0.8 0.7 - - 0 0 0.1 0.1
0.1
5.9 4.6 1.0 - 0 3.9 4.3 4.2 5.0 2.7 6.9 3.1 0
[1] 2bxk.a - 0.2 0.3 1.0 0 0 0.1 0 0 0.1 0.1 - - 0 0 0.5 0.1 0.3
0.2
0.3 0.1 - 0 0.7 1.1 0.2 2.1 2.4 0.2 0 0
[1] 2bxn.a - 0.2 0.4 0.9 0 0 0 0 0 0.1 0.3 - - 0 0 0.4 0.1 0 0.7
0
0 - 0 1.1 1.2 0.2 2.3 1.6 0.5 0.2 0.1
[1] 2bxp.a - 0.1 0.3 1.0 0 0 0 0 0 1.9 1.7 - - 0 0 0.3 0.2 0.1 2.5 4.1
0
- 0 4.3 5.2 3.9 4.9 1.1 2.0 3.1 0.2
[1] 2i2z.a - 0.2 0.3 0.6 0 0 0.1 0 0 1.4 1.4 - - 0 0 0.4 0 0 3.1 3.1 0
-
0 5.4 5.0 3.6 4.0 2.0 3.0 2.9 0.1
[1] 2vdb.a - 0.1 0.4 0.7 0.1 0.2 0.2 0.1 0 0.7 0.7 - - 0 0 0.5 0 0.7 4.2 3.0 0.3 -
0
3.7 4.2 3.1 2.4 1.0 1.9 3.2 0.2
[1] 2xw0.a - 2.3 3.7 5.1 1.2 1.6 1.7 1.3 2.3 1.4 1.7 - - 1.2 1.0 1.9 0.2 0.2 2.9 3.7 2.6 - 1.4
0.4
2.1 0.3 7.2 5.0 4.8 0.1 2.3
[1] 3lu6.a - 0.2 0.9 4.7 0 0.1 0.5 0 0.1 0.2 0.4 - - 0 0.1 1.0 0.2 0.3 3.2 2.8 1.9 - 0.1 0.9
0
0 3.4 4.8 5.4 0.4 0.1
[1] 3lu7.a - 0.1 0.3 3.7 0 0 0 0 0.1 0.1 0.4 - - 0 0.1 0.5 0.1 0 2.6 3.0 2.0 - 0.1 0.9 0.8
0
4.2 5.2 4.0 0.3 0
[1] 3tdl.a - 0.5 1.5 6.6 0.2 0.1 0.5 0.1 0.1 0.4 0.5 - - 0.1 0.1 1.4 0.6 0.9 6.3 5.1 3.7 - 0.1 4.6 5.9 3.7
0.1
6.2 4.2 3.5 0.8
[1] 4z69.a - 0.1 0.2 0.5 0 0 0.3 0 0 0.4 0.7 - - 0 0 0.5 0.2 0.1 4.3 4.0 0.1 - 0 3.7 4.0 3.3 0.6
0.5
2.4 3.5 0.3
[1] 5id7.a - 0.1 0.3 3.2 0 0.3 0 0 0 0.4 0.5 - - 0 0 0.6 0 0.2 1.5 0.6 1.5 - 0 2.5 2.5 1.2 1.6 3.5
0.2
0.7 0.2
[1] 6ezq.a - 0.1 0.4 5.7 0.5 0.7 2.0 2.0 0.1 0.6 0.7 - - 0.1 0.9 1.4 1.7 1.4 3.0 3.2 2.2 - 0 1.0 1.1 0.6 4.6 5.5 2.0
0
0
[2] 4e99.a - 0.1 1.0 7.7 0.1 0 0.3 0 0 1.3 1.1 - - 0 0 1.0 0.5 0.7 7.3 8.9 5.4 - 0 5.3 6.4 5.3 7.4 6.4 9.2 4.5
0.3
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (2 clusters)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
1bm0.b
1e7b.a
1e7c.a
1e7e.a
1e7f.a
1e7h.a
1e7i.a
1gni.a
1gnj.a
1h9z.a
1ha2.a
1hk2.a
1hk3.a
1hk5.a
1n5u.a
1tf0.a
2bxe.a
2bxg.a
2bxk.a
2bxn.a
2bxp.a
2i2z.a
2vdb.a
2xw0.a
3lu6.a
3lu7.a
3tdl.a
4z69.a
5id7.a
6ezq.a
4e99.a
[1] 1bm0.b
0
.08 .25 .24 .26 .24 .25 .26 .23 .22 .20 .13 .12 .24 .29 .09 .12 .11 .25 .25 .25 .23 .23 .14 .17 .14 .30 .26 .26 .20 .21
[1] 1e7b.a .08
0
.21 .22 .24 .23 .23 .24 .22 .21 .19 .12 .11 .22 .28 .09 .08 .08 .24 .24 .23 .20 .22 .16 .15 .12 .31 .24 .26 .19 .20
[1] 1e7c.a .25 .21
0
.08 .10 .10 .10 .11 .06 .12 .14 .20 .19 .06 .17 .22 .20 .19 .10 .11 .10 .08 .07 .30 .24 .23 .23 .09 .14 .26 .36
[1] 1e7e.a .24 .22 .08
0
.10 .12 .13 .12 .08 .13 .16 .23 .20 .07 .16 .22 .22 .20 .12 .13 .08 .10 .08 .30 .26 .22 .25 .07 .16 .26 .39
[1] 1e7f.a .26 .24 .10 .10
0
.08 .09 .10 .10 .10 .13 .23 .22 .06 .12 .24 .23 .24 .10 .10 .07 .10 .10 .27 .23 .21 .22 .11 .12 .24 .37
[1] 1e7h.a .24 .23 .10 .12 .08
0
.04 .05 .07 .06 .08 .20 .20 .07 .16 .21 .20 .23 .05 .07 .12 .11 .09 .23 .19 .18 .21 .13 .08 .19 .35
[1] 1e7i.a .25 .23 .10 .13 .09 .04
0
.05 .07 .10 .11 .21 .20 .09 .17 .22 .21 .22 .06 .08 .13 .12 .11 .24 .18 .18 .21 .13 .10 .20 .36
[1] 1gni.a .26 .24 .11 .12 .10 .05 .05
0
.07 .08 .10 .21 .21 .08 .17 .23 .21 .23 .05 .05 .11 .11 .10 .25 .21 .19 .23 .13 .08 .19 .37
[1] 1gnj.a .23 .22 .06 .08 .10 .07 .07 .07
0
.10 .11 .20 .18 .05 .15 .20 .20 .20 .07 .08 .10 .08 .06 .27 .21 .22 .22 .09 .10 .24 .36
[1] 1h9z.a .22 .21 .12 .13 .10 .06 .10 .08 .10
0
.04 .20 .20 .08 .20 .21 .20 .21 .06 .06 .10 .13 .10 .22 .22 .19 .25 .16 .11 .19 .35
[1] 1ha2.a .20 .19 .14 .16 .13 .08 .11 .10 .11 .04
0
.18 .18 .10 .21 .19 .19 .20 .09 .08 .12 .12 .13 .20 .20 .18 .24 .18 .10 .16 .33
[1] 1hk2.a .13 .12 .20 .23 .23 .20 .21 .21 .20 .20 .18
0
.06 .20 .29 .12 .09 .13 .21 .22 .20 .20 .19 .17 .13 .11 .26 .24 .21 .17 .23
[1] 1hk3.a .12 .11 .19 .20 .22 .20 .20 .21 .18 .20 .18 .06
0
.19 .29 .12 .09 .13 .20 .21 .20 .19 .19 .17 .13 .11 .26 .22 .21 .17 .26
[1] 1hk5.a .24 .22 .06 .07 .06 .07 .09 .08 .05 .08 .10 .20 .19
0
.15 .22 .20 .20 .06 .07 .08 .06 .06 .27 .21 .20 .22 .09 .10 .23 .37
[1] 1n5u.a .29 .28 .17 .16 .12 .16 .17 .17 .15 .20 .21 .29 .29 .15
0
.28 .29 .28 .19 .20 .14 .14 .16 .36 .30 .29 .20 .11 .18 .33 .38
[1] 1tf0.a .09 .09 .22 .22 .24 .21 .22 .23 .20 .21 .19 .12 .12 .22 .28
0
.11 .12 .23 .23 .24 .20 .18 .18 .15 .15 .28 .24 .24 .18 .20
[1] 2bxe.a .12 .08 .20 .22 .23 .20 .21 .21 .20 .20 .19 .09 .09 .20 .29 .11
0
.11 .21 .21 .20 .20 .19 .17 .12 .11 .28 .22 .23 .17 .22
[1] 2bxg.a .11 .08 .19 .20 .24 .23 .22 .23 .20 .21 .20 .13 .13 .20 .28 .12 .11
0
.24 .23 .21 .20 .20 .18 .17 .15 .30 .23 .25 .20 .24
[1] 2bxk.a .25 .24 .10 .12 .10 .05 .06 .05 .07 .06 .09 .21 .20 .06 .19 .23 .21 .24
0
.03 .11 .11 .09 .24 .21 .18 .25 .14 .09 .18 .38
[1] 2bxn.a .25 .24 .11 .13 .10 .07 .08 .05 .08 .06 .08 .22 .21 .07 .20 .23 .21 .23 .03
0
.11 .11 .10 .24 .22 .18 .26 .16 .09 .17 .38
[1] 2bxp.a .25 .23 .10 .08 .07 .12 .13 .11 .10 .10 .12 .20 .20 .08 .14 .24 .20 .21 .11 .11
0
.12 .09 .28 .26 .21 .24 .11 .14 .24 .38
[1] 2i2z.a .23 .20 .08 .10 .10 .11 .12 .11 .08 .13 .12 .20 .19 .06 .14 .20 .20 .20 .11 .11 .12
0
.08 .28 .23 .23 .19 .10 .13 .25 .36
[1] 2vdb.a .23 .22 .07 .08 .10 .09 .11 .10 .06 .10 .13 .19 .19 .06 .16 .18 .19 .20 .09 .10 .09 .08
0
.27 .22 .21 .23 .09 .11 .24 .35
[1] 2xw0.a .14 .16 .30 .30 .27 .23 .24 .25 .27 .22 .20 .17 .17 .27 .36 .18 .17 .18 .24 .24 .28 .28 .27
0
.19 .16 .35 .33 .24 .20 .30
[1] 3lu6.a .17 .15 .24 .26 .23 .19 .18 .21 .21 .22 .20 .13 .13 .21 .30 .15 .12 .17 .21 .22 .26 .23 .22 .19
0
.11 .28 .25 .21 .21 .26
[1] 3lu7.a .14 .12 .23 .22 .21 .18 .18 .19 .22 .19 .18 .11 .11 .20 .29 .15 .11 .15 .18 .18 .21 .23 .21 .16 .11
0
.31 .26 .21 .14 .27
[1] 3tdl.a .30 .31 .23 .25 .22 .21 .21 .23 .22 .25 .24 .26 .26 .22 .20 .28 .28 .30 .25 .26 .24 .19 .23 .35 .28 .31
0
.20 .19 .27 .37
[1] 4z69.a .26 .24 .09 .07 .11 .13 .13 .13 .09 .16 .18 .24 .22 .09 .11 .24 .22 .23 .14 .16 .11 .10 .09 .33 .25 .26 .20
0
.16 .29 .39
[1] 5id7.a .26 .26 .14 .16 .12 .08 .10 .08 .10 .11 .10 .21 .21 .10 .18 .24 .23 .25 .09 .09 .14 .13 .11 .24 .21 .21 .19 .16
0
.17 .38
[1] 6ezq.a .20 .19 .26 .26 .24 .19 .20 .19 .24 .19 .16 .17 .17 .23 .33 .18 .17 .20 .18 .17 .24 .25 .24 .20 .21 .14 .27 .29 .17
0
.30
[2] 4e99.a .21 .20 .36 .39 .37 .35 .36 .37 .36 .35 .33 .23 .26 .37 .38 .20 .22 .24 .38 .38 .38 .36 .35 .30 .26 .27 .37 .39 .38 .30
0
[Pocket clash dissimilarity matrix]

Site backbone RMSD (median 1.4 Å)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by RMSD of site residue backbone atoms

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥10 Å
9 Å
8 Å
7 Å
6 Å
5 Å
4 Å
3 Å
2 Å
1 Å
0 Å
1bm0.b
1e7b.a
1e7c.a
1e7e.a
1e7f.a
1e7h.a
1e7i.a
1gni.a
1gnj.a
1h9z.a
1ha2.a
1hk2.a
1hk3.a
1hk5.a
1n5u.a
1tf0.a
2bxe.a
2bxg.a
2bxk.a
2bxn.a
2bxp.a
2i2z.a
2vdb.a
2xw0.a
3lu6.a
3lu7.a
3tdl.a
4z69.a
5id7.a
6ezq.a
4e99.a
[1] 1bm0.b
0
0.4 1.4 1.2 1.4 1.3 1.3 1.2 1.4 1.3 1.3 0.4 0.4 1.4 1.5 0.4 0.6 0.6 1.3 1.3 1.3 1.4 1.3 0.6 0.6 0.4 1.2 1.5 1.3 0.8 0.8
[1] 1e7b.a 0.4
0
1.4 1.3 1.4 1.4 1.3 1.3 1.4 1.4 1.4 0.6 0.5 1.4 1.6 0.4 0.4 0.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 0.5 0.6 0.4 1.3 1.6 1.4 0.8 0.8
[1] 1e7c.a 1.4 1.4
0
0.4 0.4 0.5 0.4 0.4 0.3 0.3 0.4 1.3 1.3 0.2 0.6 1.4 1.6 1.5 0.3 0.3 0.3 0.3 0.6 1.6 1.7 1.3 0.9 0.7 0.6 1.1 1.7
[1] 1e7e.a 1.2 1.3 0.4
0
0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 0.4 0.6 1.2 1.2 0.4 0.6 1.2 1.4 1.4 0.5 0.4 0.4 0.4 0.6 1.4 1.5 1.2 0.9 0.7 0.7 1.0 1.6
[1] 1e7f.a 1.4 1.4 0.4 0.5
0
0.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.5 1.3 1.3 0.3 0.5 1.4 1.6 1.6 0.4 0.4 0.4 0.3 0.7 1.6 1.7 1.3 0.8 0.7 0.6 1.2 1.6
[1] 1e7h.a 1.3 1.4 0.5 0.6 0.4
0
0.3 0.3 0.4 0.4 0.3 1.2 1.3 0.4 0.7 1.3 1.6 1.5 0.4 0.4 0.5 0.4 0.7 1.6 1.6 1.3 0.7 0.8 0.6 1.1 1.6
[1] 1e7i.a 1.3 1.3 0.4 0.5 0.3 0.3
0
0.2 0.4 0.4 0.4 1.2 1.2 0.4 0.7 1.2 1.5 1.4 0.4 0.3 0.5 0.4 0.7 1.5 1.6 1.2 0.7 0.8 0.6 1.0 1.5
[1] 1gni.a 1.2 1.3 0.4 0.5 0.4 0.3 0.2
0
0.3 0.4 0.4 1.2 1.2 0.4 0.6 1.2 1.4 1.4 0.4 0.3 0.4 0.4 0.7 1.4 1.6 1.2 0.7 0.8 0.5 1.0 1.5
[1] 1gnj.a 1.4 1.4 0.3 0.5 0.4 0.4 0.4 0.3
0
0.4 0.4 1.3 1.3 0.3 0.7 1.4 1.6 1.5 0.3 0.3 0.4 0.3 0.7 1.6 1.7 1.3 0.8 0.8 0.5 1.1 1.7
[1] 1h9z.a 1.3 1.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4
0
0.2 1.2 1.2 0.3 0.5 1.3 1.5 1.5 0.3 0.3 0.2 0.2 0.5 1.5 1.6 1.2 0.8 0.7 0.6 1.1 1.6
[1] 1ha2.a 1.3 1.4 0.4 0.6 0.5 0.3 0.4 0.4 0.4 0.2
0
1.2 1.2 0.4 0.6 1.3 1.5 1.5 0.3 0.3 0.3 0.3 0.6 1.5 1.5 1.2 0.7 0.8 0.6 1.1 1.5
[1] 1hk2.a 0.4 0.6 1.3 1.2 1.3 1.2 1.2 1.2 1.3 1.2 1.2
0
0.4 1.3 1.4 0.6 0.7 0.7 1.3 1.2 1.2 1.3 1.3 0.7 0.8 0.5 1.2 1.5 1.3 0.8 0.9
[1] 1hk3.a 0.4 0.5 1.3 1.2 1.3 1.3 1.2 1.2 1.3 1.2 1.2 0.4
0
1.3 1.4 0.5 0.7 0.6 1.3 1.2 1.2 1.3 1.2 0.7 0.8 0.5 1.2 1.4 1.3 0.8 0.9
[1] 1hk5.a 1.4 1.4 0.2 0.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.3 0.3 0.4 1.3 1.3
0
0.5 1.4 1.6 1.5 0.3 0.3 0.3 0.3 0.6 1.5 1.6 1.3 0.9 0.6 0.6 1.1 1.7
[1] 1n5u.a 1.5 1.6 0.6 0.6 0.5 0.7 0.7 0.6 0.7 0.5 0.6 1.4 1.4 0.5
0
1.5 1.8 1.7 0.5 0.6 0.5 0.5 0.5 1.7 1.8 1.4 1.0 0.4 0.7 1.3 1.7
[1] 1tf0.a 0.4 0.4 1.4 1.2 1.4 1.3 1.2 1.2 1.4 1.3 1.3 0.6 0.5 1.4 1.5
0
0.6 0.5 1.3 1.3 1.3 1.4 1.3 0.7 0.6 0.4 1.2 1.5 1.3 0.8 0.7
[1] 2bxe.a 0.6 0.4 1.6 1.4 1.6 1.6 1.5 1.4 1.6 1.5 1.5 0.7 0.7 1.6 1.8 0.6
0
0.3 1.6 1.5 1.5 1.6 1.5 0.5 0.5 0.6 1.4 1.8 1.6 1.0 1.0
[1] 2bxg.a 0.6 0.4 1.5 1.4 1.6 1.5 1.4 1.4 1.5 1.5 1.5 0.7 0.6 1.5 1.7 0.5 0.3
0
1.5 1.5 1.5 1.6 1.5 0.5 0.6 0.6 1.4 1.7 1.5 0.9 1.0
[1] 2bxk.a 1.3 1.4 0.3 0.5 0.4 0.4 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 1.3 1.3 0.3 0.5 1.3 1.6 1.5
0
0.2 0.3 0.3 0.6 1.5 1.6 1.3 0.8 0.7 0.6 1.1 1.6
[1] 2bxn.a 1.3 1.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 1.2 1.2 0.3 0.6 1.3 1.5 1.5 0.2
0
0.3 0.3 0.6 1.5 1.6 1.3 0.8 0.7 0.5 1.1 1.6
[1] 2bxp.a 1.3 1.4 0.3 0.4 0.4 0.5 0.5 0.4 0.4 0.2 0.3 1.2 1.2 0.3 0.5 1.3 1.5 1.5 0.3 0.3
0
0.3 0.5 1.5 1.6 1.3 0.8 0.6 0.6 1.1 1.6
[1] 2i2z.a 1.4 1.4 0.3 0.4 0.3 0.4 0.4 0.4 0.3 0.2 0.3 1.3 1.3 0.3 0.5 1.4 1.6 1.6 0.3 0.3 0.3
0
0.6 1.6 1.7 1.3 0.8 0.7 0.6 1.1 1.6
[1] 2vdb.a 1.3 1.4 0.6 0.6 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.5 0.6 1.3 1.2 0.6 0.5 1.3 1.5 1.5 0.6 0.6 0.5 0.6
0
1.5 1.6 1.3 0.9 0.6 0.8 1.2 1.5
[1] 2xw0.a 0.6 0.5 1.6 1.4 1.6 1.6 1.5 1.4 1.6 1.5 1.5 0.7 0.7 1.5 1.7 0.7 0.5 0.5 1.5 1.5 1.5 1.6 1.5
0
0.7 0.7 1.4 1.8 1.5 0.8 1.0
[1] 3lu6.a 0.6 0.6 1.7 1.5 1.7 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 1.5 0.8 0.8 1.6 1.8 0.6 0.5 0.6 1.6 1.6 1.6 1.7 1.6 0.7
0
0.6 1.5 1.8 1.6 1.0 0.9
[1] 3lu7.a 0.4 0.4 1.3 1.2 1.3 1.3 1.2 1.2 1.3 1.2 1.2 0.5 0.5 1.3 1.4 0.4 0.6 0.6 1.3 1.3 1.3 1.3 1.3 0.7 0.6
0
1.2 1.5 1.3 0.8 0.9
[1] 3tdl.a 1.2 1.3 0.9 0.9 0.8 0.7 0.7 0.7 0.8 0.8 0.7 1.2 1.2 0.9 1.0 1.2 1.4 1.4 0.8 0.8 0.8 0.8 0.9 1.4 1.5 1.2
0
1.1 0.7 1.0 1.2
[1] 4z69.a 1.5 1.6 0.7 0.7 0.7 0.8 0.8 0.8 0.8 0.7 0.8 1.5 1.4 0.6 0.4 1.5 1.8 1.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.6 1.8 1.8 1.5 1.1
0
0.9 1.4 1.8
[1] 5id7.a 1.3 1.4 0.6 0.7 0.6 0.6 0.6 0.5 0.5 0.6 0.6 1.3 1.3 0.6 0.7 1.3 1.6 1.5 0.6 0.5 0.6 0.6 0.8 1.5 1.6 1.3 0.7 0.9
0
1.0 1.5
[1] 6ezq.a 0.8 0.8 1.1 1.0 1.2 1.1 1.0 1.0 1.1 1.1 1.1 0.8 0.8 1.1 1.3 0.8 1.0 0.9 1.1 1.1 1.1 1.1 1.2 0.8 1.0 0.8 1.0 1.4 1.0
0
1.1
[2] 4e99.a 0.8 0.8 1.7 1.6 1.6 1.6 1.5 1.5 1.7 1.6 1.5 0.9 0.9 1.7 1.7 0.7 1.0 1.0 1.6 1.6 1.6 1.6 1.5 1.0 0.9 0.9 1.2 1.8 1.5 1.1
0
[Binding site backbone RMSD matrix]

Site full-atom RMSD (median 0.9 Å)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by RMSD of all site residue atoms

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥10 Å
9 Å
8 Å
7 Å
6 Å
5 Å
4 Å
3 Å
2 Å
1 Å
0 Å
1bm0.b
1e7b.a
1e7c.a
1e7e.a
1e7f.a
1e7h.a
1e7i.a
1gni.a
1gnj.a
1h9z.a
1ha2.a
1hk2.a
1hk3.a
1hk5.a
1n5u.a
1tf0.a
2bxe.a
2bxg.a
2bxk.a
2bxn.a
2bxp.a
2i2z.a
2vdb.a
2xw0.a
3lu6.a
3lu7.a
3tdl.a
4z69.a
5id7.a
6ezq.a
4e99.a
[1] 1bm0.b
0
0.9 2.0 2.0 2.1 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 0.8 2.0 2.3 0.9 1.0 1.0 2.1 2.1 2.1 2.0 2.0 1.3 1.2 1.0 2.1 2.2 2.0 1.5 1.2
[1] 1e7b.a 0.9
0
2.0 1.9 2.0 2.0 1.9 1.9 2.0 1.9 1.9 0.9 0.8 1.9 2.3 0.7 0.7 0.8 2.0 2.0 2.0 2.0 1.9 1.1 1.2 0.9 2.0 2.1 2.0 1.4 1.1
[1] 1e7c.a 2.0 2.0
0
0.6 0.7 0.7 0.8 0.9 0.7 0.7 0.8 1.9 1.9 0.6 1.2 1.9 2.1 2.0 1.0 0.9 0.8 0.7 0.9 2.2 2.3 2.0 1.4 1.0 1.1 1.6 2.2
[1] 1e7e.a 2.0 1.9 0.6
0
0.8 0.8 0.9 0.9 0.8 0.8 0.9 1.9 1.8 0.7 1.2 1.9 2.0 2.0 1.0 0.9 0.8 0.7 0.8 2.1 2.2 1.9 1.4 1.0 1.1 1.6 2.1
[1] 1e7f.a 2.1 2.0 0.7 0.8
0
0.7 0.7 0.9 0.7 0.8 0.8 1.9 1.9 0.6 1.1 1.9 2.1 2.1 1.0 0.8 0.7 0.7 0.9 2.2 2.3 2.0 1.3 1.0 1.0 1.6 2.2
[1] 1e7h.a 2.0 2.0 0.7 0.8 0.7
0
0.6 0.8 0.7 0.7 0.7 1.9 1.9 0.7 1.3 1.9 2.1 2.1 0.8 0.7 0.8 0.6 1.0 2.2 2.2 1.9 1.3 1.1 1.0 1.6 2.1
[1] 1e7i.a 2.0 1.9 0.8 0.9 0.7 0.6
0
0.8 0.7 0.7 0.7 1.9 1.9 0.7 1.3 1.9 2.1 2.1 0.9 0.8 0.9 0.7 1.1 2.1 2.2 1.9 1.3 1.1 1.0 1.6 2.1
[1] 1gni.a 2.0 1.9 0.9 0.9 0.9 0.8 0.8
0
0.8 0.9 0.9 1.9 1.9 0.8 1.3 1.9 2.1 2.0 0.8 0.8 0.9 0.8 1.1 2.1 2.2 1.9 1.4 1.2 1.1 1.6 2.1
[1] 1gnj.a 2.0 2.0 0.7 0.8 0.7 0.7 0.7 0.8
0
0.7 0.7 1.9 1.9 0.6 1.2 2.0 2.1 2.1 0.8 0.7 0.7 0.6 1.0 2.2 2.3 2.0 1.3 1.0 1.0 1.6 2.2
[1] 1h9z.a 2.0 1.9 0.7 0.8 0.8 0.7 0.7 0.9 0.7
0
0.3 1.9 1.9 0.6 1.2 1.9 2.1 2.1 0.8 0.8 0.8 0.6 1.0 2.2 2.2 1.9 1.4 1.1 1.1 1.6 2.1
[1] 1ha2.a 2.0 1.9 0.8 0.9 0.8 0.7 0.7 0.9 0.7 0.3
0
1.9 1.9 0.7 1.2 1.9 2.1 2.1 0.8 0.8 0.8 0.7 1.0 2.1 2.2 1.9 1.3 1.1 1.1 1.5 2.1
[1] 1hk2.a 1.0 0.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9
0
0.5 1.9 2.2 0.9 0.9 1.0 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.1 1.1 0.9 1.9 2.1 1.9 1.4 1.2
[1] 1hk3.a 0.8 0.8 1.9 1.8 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 0.5
0
1.9 2.1 0.8 0.8 0.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.0 1.1 0.9 2.0 2.0 1.9 1.4 1.1
[1] 1hk5.a 2.0 1.9 0.6 0.7 0.6 0.7 0.7 0.8 0.6 0.6 0.7 1.9 1.9
0
1.0 1.9 2.0 2.1 0.8 0.7 0.6 0.5 0.9 2.1 2.2 1.9 1.3 1.0 1.0 1.5 2.2
[1] 1n5u.a 2.3 2.3 1.2 1.2 1.1 1.3 1.3 1.3 1.2 1.2 1.2 2.2 2.1 1.0
0
2.2 2.4 2.4 1.4 1.3 1.1 1.1 1.3 2.5 2.5 2.2 1.3 1.0 1.4 2.0 2.4
[1] 1tf0.a 0.9 0.7 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 1.9 2.0 1.9 1.9 0.9 0.8 1.9 2.2
0
0.9 0.9 2.0 2.0 2.0 1.9 1.9 1.2 1.2 0.9 1.9 2.1 1.9 1.4 1.0
[1] 2bxe.a 1.0 0.7 2.1 2.0 2.1 2.1 2.1 2.1 2.1 2.1 2.1 0.9 0.8 2.0 2.4 0.9
0
0.6 2.2 2.1 2.1 2.1 2.1 1.2 1.1 1.1 2.1 2.3 2.1 1.5 1.2
[1] 2bxg.a 1.0 0.8 2.0 2.0 2.1 2.1 2.1 2.0 2.1 2.1 2.1 1.0 0.9 2.1 2.4 0.9 0.6
0
2.2 2.1 2.1 2.1 2.0 1.2 1.1 1.1 2.1 2.2 2.1 1.6 1.3
[1] 2bxk.a 2.1 2.0 1.0 1.0 1.0 0.8 0.9 0.8 0.8 0.8 0.8 1.9 1.9 0.8 1.4 2.0 2.2 2.2
0
0.8 0.9 0.8 1.1 2.1 2.2 1.9 1.4 1.2 1.1 1.5 2.1
[1] 2bxn.a 2.1 2.0 0.9 0.9 0.8 0.7 0.8 0.8 0.7 0.8 0.8 1.9 1.9 0.7 1.3 2.0 2.1 2.1 0.8
0
0.8 0.8 1.0 2.2 2.2 2.0 1.3 1.1 1.0 1.6 2.2
[1] 2bxp.a 2.1 2.0 0.8 0.8 0.7 0.8 0.9 0.9 0.7 0.8 0.8 1.9 1.9 0.6 1.1 2.0 2.1 2.1 0.9 0.8
0
0.7 1.0 2.2 2.3 2.0 1.3 1.0 1.1 1.6 2.2
[1] 2i2z.a 2.0 2.0 0.7 0.7 0.7 0.6 0.7 0.8 0.6 0.6 0.7 1.9 1.9 0.5 1.1 1.9 2.1 2.1 0.8 0.8 0.7
0
0.9 2.2 2.3 2.0 1.3 1.0 1.0 1.6 2.2
[1] 2vdb.a 2.0 1.9 0.9 0.8 0.9 1.0 1.1 1.1 1.0 1.0 1.0 1.9 1.9 0.9 1.3 1.9 2.1 2.0 1.1 1.0 1.0 0.9
0
2.2 2.2 2.0 1.4 1.0 1.1 1.6 2.1
[1] 2xw0.a 1.3 1.1 2.2 2.1 2.2 2.2 2.1 2.1 2.2 2.2 2.1 1.1 1.0 2.1 2.5 1.2 1.2 1.2 2.1 2.2 2.2 2.2 2.2
0
1.2 1.1 2.2 2.4 2.1 1.5 1.4
[1] 3lu6.a 1.2 1.2 2.3 2.2 2.3 2.2 2.2 2.2 2.3 2.2 2.2 1.1 1.1 2.2 2.5 1.2 1.1 1.1 2.2 2.2 2.3 2.3 2.2 1.2
0
0.9 2.3 2.4 2.3 1.6 1.3
[1] 3lu7.a 1.0 0.9 2.0 1.9 2.0 1.9 1.9 1.9 2.0 1.9 1.9 0.9 0.9 1.9 2.2 0.9 1.1 1.1 1.9 2.0 2.0 2.0 2.0 1.1 0.9
0
2.0 2.1 2.0 1.4 1.1
[1] 3tdl.a 2.1 2.0 1.4 1.4 1.3 1.3 1.3 1.4 1.3 1.4 1.3 1.9 2.0 1.3 1.3 1.9 2.1 2.1 1.4 1.3 1.3 1.3 1.4 2.2 2.3 2.0
0
1.5 1.3 1.7 2.0
[1] 4z69.a 2.2 2.1 1.0 1.0 1.0 1.1 1.1 1.2 1.0 1.1 1.1 2.1 2.0 1.0 1.0 2.1 2.3 2.2 1.2 1.1 1.0 1.0 1.0 2.4 2.4 2.1 1.5
0
1.3 1.9 2.3
[1] 5id7.a 2.0 2.0 1.1 1.1 1.0 1.0 1.0 1.1 1.0 1.1 1.1 1.9 1.9 1.0 1.4 1.9 2.1 2.1 1.1 1.0 1.1 1.0 1.1 2.1 2.3 2.0 1.3 1.3
0
1.6 2.1
[1] 6ezq.a 1.5 1.4 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.6 1.5 1.4 1.4 1.5 2.0 1.4 1.5 1.6 1.5 1.6 1.6 1.6 1.6 1.5 1.6 1.4 1.7 1.9 1.6
0
1.6
[2] 4e99.a 1.2 1.1 2.2 2.1 2.2 2.1 2.1 2.1 2.2 2.1 2.1 1.2 1.1 2.2 2.4 1.0 1.2 1.3 2.1 2.2 2.2 2.2 2.1 1.4 1.3 1.1 2.0 2.3 2.1 1.6
0
[Binding site full-atom RMSD matrix]







[show 3D visualization]

[ENTRY 2D visualization]

L C X E | Background Color: | Anaglyph Stereo:

loading...