ACRB_ECOLI_1_1048_doxorubicin

Multidrug efflux pump subunit AcrB [Resistance-nodulation-cell division (RND) (TC 2.A.6) family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer
 • A1 (ACRB_ECOLI):46,79,89,91,130,134:136,139,176:180,274,277,279,287,292,326,327,566,571,573,575:577,610,612,615:620,624,626,628,664,666:669,672,674,676,679,681,683,717,719,720,722,815,826,828,830,86246,79,89,91,130,134:136,139,176:180,274,277,279,287,292,326,327,566,571,573,575:577,610,612,615:620,624,626,628,664,666:669,672,674,676,679,681,683,717,719,720,722,815,826,828,830,862

Full PDB list

1iwg,1oye,1t9t,1t9u,1t9w,1t9x,2dhh,2dr6,2drd,2gif,2hqf,2hqg,2i6w,2j8s,2rdd,3aoa,3aob,3aoc,3aod,3d9b,3noc,3nog,3w9h,4c48,4dx5,4dx6,4dx7,4k7q,4u8v,4u8y,4u95,4u96,4zlj,4zll,5en5,5eno,5enp,5enq,5enr,5ens,5ent (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
S
4
6
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7
9
Q
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9
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1
3
0
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[1]4dx7.b dm2,lmu 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4dx7.a dm2,dm2 78 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eno.c 5qg 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[2]1t9w.a nfn 29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enq.c 5qe 35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5enr.c mbx 36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5enp.c 5qf 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5ens.c rhq 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[2]1t9x.a et 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]2dr6.a dm2 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3w9h.b p9d 49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3aoc.c ery 51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]2j8s.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3aod.c rfp 59 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1t9u.a cpf 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[1]4dx5.b lmu,miy 68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4dx6.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4u8v.b miy 33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4zll.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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