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ACRB_ECOLI_1_1048_doxorubicin

Multidrug efflux pump subunit AcrB [Resistance-nodulation-cell division (RND) (TC 2.A.6) family]

Composition of the binding site

Protein chains monomer
A1 (ACRB_ECOLI):46, 77, 79:81, 89, 91, 130, 134:139, 151, 163, 174:180, 273, 274, 276, 277, 279, 287, 288, 290, 292, 326:329, 566, 571, 573, 575:577, 610, 612, 615:620, 624, 626, 628, 662, 664, 666:669, 672:683, 703, 714:722, 815, 817, 818, 826:831, 860:86346, 77, 79:81, 89, 91, 130, 134:139, 151, 163, 174:180, 273, 274, 276, 277, 279, 287, 288, 290, 292, 326:329, 566, 571, 573, 575:577, 610, 612, 615:620, 624, 626, 628, 662, 664, 666:669, 672:683, 703, 714:722, 815, 817, 818, 826:831, 860:863

Full PDB list

1iwg, 1oye, 1t9t, 1t9u, 1t9w, 1t9x, 2dhh, 2dr6, 2drd, 2gif, 2hqf, 2hqg, 2i6w, 2j8s, 2rdd, 3aoa, 3aob, 3aoc, 3aod, 3d9b, 3noc, 3nog, 3w9h, 4c48, 4dx5, 4dx6, 4dx7, 4k7q, 4u8v, 4u8y, 4u95, 4u96, 4zlj, 4zll, 5en5, 5eno, 5enp, 5enq, 5enr, 5ens, 5ent, 5jmn, 5nc5, 5yil (redundant Pocketome entry)

Pocket contact map

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ligand
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[1]3w9h.b p9d49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dx5.b lmu,miy68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dx7.b dm2,lmu74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4u8v.b miy33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eno.c 5qg29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5enp.c 5qf37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5enq.c 5qe35 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5enr.c mbx36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5ens.c rhq33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . . . . . . . . . . .
[1]5nc5.b puy34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1t9u.a cpf24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]1t9w.a nfn29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1t9x.a et24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -
[2]3aoc.c ery51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3aod.c rfp59 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4dx7.a dm2,dm278 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4zll.a none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]2j8s.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]4dx6.c none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
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 no contact C covalent bond
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Site contact map

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[1]3w9h.b . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . * . * * . . . . . . . * . . . . . . . * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dx5.b . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4dx7.b . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4u8v.b . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * * * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5eno.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . - . * * . . . . * . * * . . . . . . . . . * - - - - - - - . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enp.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . - . * . . . . . * . * * . . . . . . . . . * - - - - - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enq.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . - . * * . . . . * . * * . . . . . . . . . * - - - - - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5enr.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . . . . * . * * . . . . . . . . . * - - - - - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ens.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . * * . . . . . . * * . . . . . . . . . * - - - - - - . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5nc5.b . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . * * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1t9u.a . . . . . . . . . * * . . . . . . . * * * * . . . . * . . . . . . * . . * . . . . . . . * . * * . * . . * . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . * . . . . . . . . . . . . . . - .
[2]1t9w.a . . . . . . . . . * * . . . . . . . * * * * . . . . * . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * * . * . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]1t9x.a . . . . . . . . . * * . . . . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * * . * . . . . . . * . . . * . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . - .
[2]3aoc.c . . . . . . . . . * * . . * . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . * . . * . . * . * * . . * . . * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]3aod.c . . . . . . . . . * * . . * . . . . * * * * . . . . . . . . . * . * . . . . * . . . . . * . * . . . . . . . * . * . . . . * . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[2]4dx7.a . . . . . . . . . * * . . * . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . * . * * . * . . * * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . . .
[2]4zll.a . . . . . . . . . . * . . . . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . * . . A . A * . A . . * . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[3]2j8s.c . . . . . . . . . * * . . * . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * . * * . * . . . . . . . . . . . * * * * * . * * . . * . . * * * * * . . . . . . . * * * . . . . .
[3]4dx6.c . . . . . . . . . * * . . * . . . . * * * * . . . . . . . . . . . * . . . . . . . . . . * N * * . . . . . . . . . . . . . . . * * * . * * . . * . . * * * * * . . * . . . . * * * . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)

Pocket-ligand steric compatibility

Ligands (x) vs pockets (y) colored by number of steric clashes

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketligand
≥10
9
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3aoc.c:ery
3aod.c:rfp
4dx7.a:dm2
4zll.a is apo
2j8s.c is apo
4dx6.c is apo
[1] 2dr6.a
0.9
2.1 3.0 1.2 0.8 2.1 1.9 2.3 2.8 3.1 1.3 0.1 0.7 0.1 3.3 4.7 6.2 - - -
[1] 3w9h.b 1.3
0
4.2 3.4 0.2 0.3 0.4 0.7 0.7 0.8 1.8 0.8 1.6 0.6 1.0 7.1 8.1 - - -
[1] 4dx5.b 1.6 1.5
0.1
0.2 0 0.9 1.0 0.8 0.9 2.9 0.1 0 0.7 0.1 2.9 5.4 5.4 - - -
[1] 4dx7.b 2.3 1.7 0.4
0.1
0.1 0.8 1.0 0.7 0.8 3.1 0.5 0 1.0 0.1 3.1 5.6 5.4 - - -
[1] 4u8v.b 1.5 1.3 0.9 0.5
0
0.3 0.5 0.2 0.3 2.8 0.1 0.2 1.4 0.8 3.4 6.5 7.3 - - -
[1] 5eno.c 4.4 1.7 1.9 1.8 0
0
0.2 0.1 0 4.0 1.5 0 0.9 0.1 4.6 6.1 5.1 - - -
[1] 5enp.c 2.4 1.3 2.3 1.8 1.2 0.1
0
1.0 1.1 3.0 1.0 0 1.2 0.3 3.7 6.7 5.0 - - -
[1] 5enq.c 3.5 1.6 2.1 1.5 0.1 0.1 0.5
0
0 4.0 0.8 0 1.1 0.3 4.5 5.5 5.7 - - -
[1] 5enr.c 4.1 2.3 1.9 1.9 0.1 0.3 0.9 0.1
0
3.5 1.1 0 0.8 0.1 4.7 4.6 4.9 - - -
[1] 5ens.c 0.4 1.3 4.2 5.5 0.1 0.8 0.5 1.5 1.3
0
1.9 0 0.9 0 1.3 9.4 6.7 - - -
[1] 5nc5.b 1.8 1.4 0.4 0.4 0.1 0.7 1.1 0.6 0.6 1.7
0
0 0.9 0.1 3.7 6.8 6.6 - - -
[2] 1t9u.a 11 18 14 12 9.0 11 15 15 15 12 7.4
0.6
1.0 0.4 6.5 6.4 9.0 - - -
[2] 1t9w.a 10 18 13 11 8.8 11 15 14 14 12 7.0 0.3
0
0.8 7.5 2.9 6.6 - - -
[2] 1t9x.a 10 17 12 11 8.0 11 15 13 14 12 6.8 0.2 1.0
0.1
6.5 3.3 7.5 - - -
[2] 3aoc.c 11 20 12 12 8.9 13 17 16 16 13 8.1 1.2 5.0 2.9
0.2
10 8.7 - - -
[2] 3aod.c 13 20 12 14 8.3 13 18 17 17 16 7.9 0.7 2.1 0.9 7.8
0.2
1.3 - - -
[2] 4dx7.a 12 22 15 14 11 14 18 18 17 14 8.0 0.8 4.1 0.7 5.0 5.6
0.7
- - -
[2] 4zll.a 8.8 17 7.6 8.7 6.7 10 14 12 13 10 5.2 0.3 2.8 1.2 0.5 5.0 4.9
-
- -
[3] 2j8s.c 11 19 25 24 11 14 17 16 18 17 15 11 12 14 11 20 26 -
-
-
[3] 4dx6.c 9.4 19 22 24 9.0 14 18 17 17 15 11 12 11 15 8.2 21 27 - -
-
[Pocket-ligand steric clashes matrix]

Pocket clash dissimilarity (3 clusters)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by ligand clash profile difference

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥1.
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
.2
.1
.0
2dr6.a
3w9h.b
4dx5.b
4dx7.b
4u8v.b
5eno.c
5enp.c
5enq.c
5enr.c
5ens.c
5nc5.b
1t9u.a
1t9w.a
1t9x.a
3aoc.c
3aod.c
4dx7.a
4zll.a
2j8s.c
4dx6.c
[1] 2dr6.a
0
.10 .08 .08 .11 .12 .12 .12 .10 .14 .08 .33 .30 .27 .34 .33 .35 .28 .67 .66
[1] 3w9h.b .10
0
.09 .09 .09 .09 .08 .11 .09 .11 .08 .37 .34 .29 .36 .36 .37 .31 .70 .68
[1] 4dx5.b .08 .09
0
.02 .06 .08 .08 .08 .08 .10 .03 .36 .32 .29 .38 .38 .39 .30 .69 .67
[1] 4dx7.b .08 .09 .02
0
.07 .07 .08 .08 .08 .10 .04 .36 .32 .28 .37 .37 .38 .30 .69 .68
[1] 4u8v.b .11 .09 .06 .07
0
.10 .08 .09 .09 .12 .05 .37 .34 .31 .39 .40 .41 .31 .68 .66
[1] 5eno.c .12 .09 .08 .07 .10
0
.05 .03 .03 .07 .08 .36 .31 .28 .36 .36 .37 .32 .71 .69
[1] 5enp.c .12 .08 .08 .08 .08 .05
0
.04 .04 .08 .08 .37 .32 .29 .37 .38 .38 .32 .70 .69
[1] 5enq.c .12 .11 .08 .08 .09 .03 .04
0
.04 .08 .08 .36 .32 .29 .36 .37 .38 .32 .71 .69
[1] 5enr.c .10 .09 .08 .08 .09 .03 .04 .04
0
.08 .07 .34 .31 .27 .35 .35 .37 .30 .69 .67
[1] 5ens.c .14 .11 .10 .10 .12 .07 .08 .08 .08
0
.10 .40 .35 .32 .39 .37 .39 .35 .75 .72
[1] 5nc5.b .08 .08 .03 .04 .05 .08 .08 .08 .07 .10
0
.36 .32 .29 .38 .37 .39 .31 .69 .68
[2] 1t9u.a .33 .37 .36 .36 .37 .36 .37 .36 .34 .40 .36
0
.08 .10 .22 .23 .23 .21 .51 .52
[2] 1t9w.a .30 .34 .32 .32 .34 .31 .32 .32 .31 .35 .32 .08
0
.05 .20 .19 .21 .19 .56 .57
[2] 1t9x.a .27 .29 .29 .28 .31 .28 .29 .29 .27 .32 .29 .10 .05
0
.20 .19 .20 .18 .56 .56
[2] 3aoc.c .34 .36 .38 .37 .39 .36 .37 .36 .35 .39 .38 .22 .20 .20
0
.13 .14 .18 .52 .54
[2] 3aod.c .33 .36 .38 .37 .40 .36 .38 .37 .35 .37 .37 .23 .19 .19 .13
0
.16 .21 .53 .56
[2] 4dx7.a .35 .37 .39 .38 .41 .37 .38 .38 .37 .39 .39 .23 .21 .20 .14 .16
0
.20 .55 .56
[2] 4zll.a .28 .31 .30 .30 .31 .32 .32 .32 .30 .35 .31 .21 .19 .18 .18 .21 .20
0
.53 .50
[3] 2j8s.c .67 .70 .69 .69 .68 .71 .70 .71 .69 .75 .69 .51 .56 .56 .52 .53 .55 .53
0
.15
[3] 4dx6.c .66 .68 .67 .68 .66 .69 .69 .69 .67 .72 .68 .52 .57 .56 .54 .56 .56 .50 .15
0
[Pocket clash dissimilarity matrix]

Site backbone RMSD (median 2.5 Å)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by RMSD of site residue backbone atoms

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥10 Å
9 Å
8 Å
7 Å
6 Å
5 Å
4 Å
3 Å
2 Å
1 Å
0 Å
2dr6.a
3w9h.b
4dx5.b
4dx7.b
4u8v.b
5eno.c
5enp.c
5enq.c
5enr.c
5ens.c
5nc5.b
1t9u.a
1t9w.a
1t9x.a
3aoc.c
3aod.c
4dx7.a
4zll.a
2j8s.c
4dx6.c
[1] 2dr6.a
0
1.2 1.3 1.4 1.3 1.2 1.4 1.3 1.4 1.3 1.2 2.3 2.2 2.2 2.3 2.2 2.4 1.9 4.6 4.6
[1] 3w9h.b 1.2
0
0.8 0.8 1.4 0.9 0.9 0.9 1.0 0.9 0.6 2.0 2.0 2.0 2.3 2.2 2.2 1.9 4.8 4.9
[1] 4dx5.b 1.3 0.8
0
0.2 1.5 0.8 0.9 0.9 0.9 0.9 0.4 2.1 2.1 2.0 2.4 2.3 2.3 2.1 4.9 5.0
[1] 4dx7.b 1.4 0.8 0.2
0
1.6 0.8 0.9 0.9 0.9 0.9 0.5 2.1 2.1 2.0 2.5 2.3 2.3 2.1 4.9 5.0
[1] 4u8v.b 1.3 1.4 1.5 1.6
0
1.0 1.1 0.9 1.1 1.2 1.4 2.6 2.6 2.6 2.6 2.5 2.7 2.0 4.2 4.3
[1] 5eno.c 1.2 0.9 0.8 0.8 1.0
0
0.5 0.7 0.3 0.5 0.8 2.0 2.0 1.9 2.3 2.1 2.2 1.9 4.8 4.9
[1] 5enp.c 1.4 0.9 0.9 0.9 1.1 0.5
0
0.5 0.7 0.7 0.9 2.1 2.1 2.0 2.5 2.4 2.4 2.1 4.8 4.9
[1] 5enq.c 1.3 0.9 0.9 0.9 0.9 0.7 0.5
0
0.7 0.8 0.9 2.1 2.1 2.0 2.4 2.3 2.3 2.0 4.7 4.7
[1] 5enr.c 1.4 1.0 0.9 0.9 1.1 0.3 0.7 0.7
0
0.6 0.9 2.1 2.1 2.0 2.5 2.2 2.3 2.0 5.0 5.0
[1] 5ens.c 1.3 0.9 0.9 0.9 1.2 0.5 0.7 0.8 0.6
0
0.9 2.0 2.0 1.9 2.3 2.2 2.2 1.9 5.0 5.1
[1] 5nc5.b 1.2 0.6 0.4 0.5 1.4 0.8 0.9 0.9 0.9 0.9
0
2.1 2.1 2.1 2.5 2.4 2.4 2.1 4.9 4.9
[2] 1t9u.a 2.3 2.0 2.1 2.1 2.6 2.0 2.1 2.1 2.1 2.0 2.1
0
0.5 0.5 1.7 1.6 1.6 1.8 4.6 4.7
[2] 1t9w.a 2.2 2.0 2.1 2.1 2.6 2.0 2.1 2.1 2.1 2.0 2.1 0.5
0
0.4 1.7 1.5 1.6 1.7 4.6 4.7
[2] 1t9x.a 2.2 2.0 2.0 2.0 2.6 1.9 2.0 2.0 2.0 1.9 2.1 0.5 0.4
0
1.6 1.5 1.6 1.6 4.6 4.6
[2] 3aoc.c 2.3 2.3 2.4 2.5 2.6 2.3 2.5 2.4 2.5 2.3 2.5 1.7 1.7 1.6
0
1.0 1.4 1.5 3.9 4.0
[2] 3aod.c 2.2 2.2 2.3 2.3 2.5 2.1 2.4 2.3 2.2 2.2 2.4 1.6 1.5 1.5 1.0
0
1.3 1.5 4.3 4.4
[2] 4dx7.a 2.4 2.2 2.3 2.3 2.7 2.2 2.4 2.3 2.3 2.2 2.4 1.6 1.6 1.6 1.4 1.3
0
1.7 4.3 4.4
[2] 4zll.a 1.9 1.9 2.1 2.1 2.0 1.9 2.1 2.0 2.0 1.9 2.1 1.8 1.7 1.6 1.5 1.5 1.7
0
4.0 4.1
[3] 2j8s.c 4.6 4.8 4.9 4.9 4.2 4.8 4.8 4.7 5.0 5.0 4.9 4.6 4.6 4.6 3.9 4.3 4.3 4.0
0
0.8
[3] 4dx6.c 4.6 4.9 5.0 5.0 4.3 4.9 4.9 4.7 5.0 5.1 4.9 4.7 4.7 4.6 4.0 4.4 4.4 4.1 0.8
0
[Binding site backbone RMSD matrix]

Site full-atom RMSD (median 2.0 Å)

Pockets (x) vs pockets (y) colored by RMSD of all site residue atoms

zoom: [−] [+]; [view as image]; [download as text]

pocketpocket
≥10 Å
9 Å
8 Å
7 Å
6 Å
5 Å
4 Å
3 Å
2 Å
1 Å
0 Å
2dr6.a
3w9h.b
4dx5.b
4dx7.b
4u8v.b
5eno.c
5enp.c
5enq.c
5enr.c
5ens.c
5nc5.b
1t9u.a
1t9w.a
1t9x.a
3aoc.c
3aod.c
4dx7.a
4zll.a
2j8s.c
4dx6.c
[1] 2dr6.a
0
1.8 1.9 1.8 1.8 1.7 1.8 1.8 1.8 1.9 1.8 2.9 3.1 2.9 2.8 2.7 2.9 2.4 4.8 4.8
[1] 3w9h.b 1.8
0
1.1 1.2 1.7 1.4 1.4 1.4 1.5 1.4 1.0 2.7 2.8 2.6 2.7 2.6 2.5 2.3 4.9 5.0
[1] 4dx5.b 1.9 1.1
0
0.5 1.6 1.3 1.4 1.4 1.4 1.4 0.6 2.7 2.8 2.6 2.8 2.6 2.6 2.4 5.0 5.0
[1] 4dx7.b 1.8 1.2 0.5
0
1.7 1.3 1.4 1.3 1.4 1.4 0.8 2.6 2.8 2.6 2.8 2.6 2.6 2.4 5.0 5.0
[1] 4u8v.b 1.8 1.7 1.6 1.7
0
1.3 1.4 1.2 1.4 1.6 1.5 3.1 3.2 3.0 2.9 2.9 2.9 2.4 4.4 4.4
[1] 5eno.c 1.7 1.4 1.3 1.3 1.3
0
0.8 0.8 0.5 0.9 1.3 2.6 2.7 2.5 2.7 2.5 2.5 2.2 4.8 4.9
[1] 5enp.c 1.8 1.4 1.4 1.4 1.4 0.8
0
0.8 0.8 1.1 1.4 2.7 2.8 2.6 2.8 2.6 2.6 2.3 4.9 4.9
[1] 5enq.c 1.8 1.4 1.4 1.3 1.2 0.8 0.8
0
0.8 1.1 1.3 2.6 2.8 2.6 2.8 2.5 2.5 2.3 4.7 4.8
[1] 5enr.c 1.8 1.5 1.4 1.4 1.4 0.5 0.8 0.8
0
0.9 1.4 2.6 2.8 2.5 2.8 2.5 2.5 2.3 5.0 5.0
[1] 5ens.c 1.9 1.4 1.4 1.4 1.6 0.9 1.1 1.1 0.9
0
1.4 2.7 2.8 2.6 2.7 2.5 2.5 2.3 5.1 5.2
[1] 5nc5.b 1.8 1.0 0.6 0.8 1.5 1.3 1.4 1.3 1.4 1.4
0
2.7 2.8 2.7 2.8 2.7 2.7 2.4 4.9 5.0
[2] 1t9u.a 2.9 2.7 2.7 2.6 3.1 2.6 2.7 2.6 2.6 2.7 2.7
0
1.1 0.7 2.3 2.1 2.3 2.3 4.7 4.7
[2] 1t9w.a 3.1 2.8 2.8 2.8 3.2 2.7 2.8 2.8 2.8 2.8 2.8 1.1
0
0.8 2.5 2.3 2.4 2.4 4.8 4.9
[2] 1t9x.a 2.9 2.6 2.6 2.6 3.0 2.5 2.6 2.6 2.5 2.6 2.7 0.7 0.8
0
2.3 2.1 2.3 2.3 4.7 4.7
[2] 3aoc.c 2.8 2.7 2.8 2.8 2.9 2.7 2.8 2.8 2.8 2.7 2.8 2.3 2.5 2.3
0
1.4 2.0 2.0 4.2 4.3
[2] 3aod.c 2.7 2.6 2.6 2.6 2.9 2.5 2.6 2.5 2.5 2.5 2.7 2.1 2.3 2.1 1.4
0
1.9 2.0 4.5 4.6
[2] 4dx7.a 2.9 2.5 2.6 2.6 2.9 2.5 2.6 2.5 2.5 2.5 2.7 2.3 2.4 2.3 2.0 1.9
0
2.0 4.3 4.5
[2] 4zll.a 2.4 2.3 2.4 2.4 2.4 2.2 2.3 2.3 2.3 2.3 2.4 2.3 2.4 2.3 2.0 2.0 2.0
0
4.2 4.2
[3] 2j8s.c 4.8 4.9 5.0 5.0 4.4 4.8 4.9 4.7 5.0 5.1 4.9 4.7 4.8 4.7 4.2 4.5 4.3 4.2
0
1.0
[3] 4dx6.c 4.8 5.0 5.0 5.0 4.4 4.9 4.9 4.8 5.0 5.2 5.0 4.7 4.9 4.7 4.3 4.6 4.5 4.2 1.0
0
[Binding site full-atom RMSD matrix]







[show 3D visualization]

[ENTRY 2D visualization]

L C X E | Background Color: | Anaglyph Stereo:

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