8ODP_HUMAN_42_197

7,8-dihydro-8-oxoguanine triphosphatase [Nudix hydrolase family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (8ODP_HUMAN):D: Nudix hydrolase (48:50,52,61,64,68,69,74:79,93,97,113,115,118,122,124,157,158,160,161,164,165)
R: Substrate binding (76:79)
R: Substrate binding (158,160,161)
180
48:50,52,61,64,68,69,74:79,93,97,113,115,118,122,124,157,158,160,161,164,165,180

Full PDB list

3q93,3whw,3zr0,3zr1,4c9w,4c9x,4n1t,4n1u,5ans,5ant,5anu,5anv,5anw,5fsi,5fsk,5fsl,5fsm,5fsn (redundant pocketome entry)

Contact map

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ligand
A1
Y
4
8
T
4
9
L
5
0
L
5
2
L
6
1
K
6
4
F
6
8
G
6
9
N
7
4
G
7
5
F
7
6
G
7
7
G
7
8
K
7
9
E
9
3
E
9
7
F
1
1
3
F
1
1
5
E
1
1
8
M
1
2
2
V
1
2
4
M
1
5
7
W
1
5
8
D
1
6
0
D
1
6
1
W
1
6
4
F
1
6
5
F
1
8
0
[1]5anu.a 58t 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5anv.a rgj 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ant.a rje 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5anw.a 9cq 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4c9w.a vgh 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n1u.a 2ge 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5ans.a rx8 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4n1t.a 2gd 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fsm.a n91 14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fsn.a 6q3 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fsl.a uan 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fsk.a h6y 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zr0.b 8og 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]5fsi.a 8dg 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4c9x.a vhs 30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3whw.a rux 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]3zr1.b none . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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