1A02_HUMAN_25_199_pep

HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain [MHC class I family]

ActiveICM:

L C E

Composition of the binding pockets

Protein chains monomer[show domain annotation]
 • A1 (1A02_HUMAN):R: Alpha-1 (29,31,33,69,83,86,87,89:91,93,94,96:98,100,101,104,105,108)
R: Alpha-2 (121,123,138,140,147,167,170,171,174:176,179,180,182,183,187,191,195)
29,31,33,69,83,86,87,89:91,93,94,96:98,100,101,104,105,108,121,123,138,140,147,167,170,171,174:176,179,180,182,183,187,191,195

Full PDB list

1akj,1ao7,1b0g,1b0r,1bd2,1duy,1duz,1eey,1eez,1hhg,1hhh,1hhi,1hhj,1hhk,1i1f,1i1y,1i4f,1i7r,1i7t,1i7u,1im3,1jf1,1jht,1lp9,1oga,1p7q,1qew,1qr1,1qrn,1qse,1qsf,1s8d,1s9w,1s9x,1s9y,1t1w,1t1x,1t1y,1t1z,1t20,1t21,1t22,1tvb,1tvh,2av1,2av7,2bnq,2bnr,2c7u,2clr,2f53,2f54,2git,2gj6,2gt9,2gtw,2gtz,2guo,2j8u,2jcc,2p5e,2p5w,2pye,2uwe,2v2w,2v2x,2vlj,2vlk,2vll,2vlr,2x4n,2x4o,2x4p,2x4q,2x4r,2x4s,2x4t,2x4u,4uq3,4wj5 (redundant pocketome entry); 1hla,2x70,3bgm,3bh8,3bh9,3bhb,3d25,3d39,3d3v,3fqn,3fqr,3fqt,3fqu,3fqw,3fqx,3ft2,3ft3,3ft4,3giv,3gjf,3gsn,3gso,3gsq,3gsr,3gsu,3gsv,3gsw,3gsx,3h7b,3h9h,3h9s,3hae,3hg1,3hla,3hpj,3i6g,3i6k,3ixa,3kla,3mgo,3mgt,3mr9,3mrb,3mrc,3mrd,3mre,3mrf,3mrg,3mrh,3mri,3mrj,3mrk,3mrl,3mrm,3mrn,3mro,3mrp,3mrq,3mrr,3myj,3o3a,3o3b,3o3d,3o3e,3o4l,3ox8,3oxr,3oxs,3pwj,3pwl,3pwn,3pwp,3qdg,3qdj,3qdm,3qeq,3qfd,3qfj,3rew,3to2,3utq,3uts,3utt,3v5d,3v5h,3v5k,4e5x,4eup,4ftv,4gkn,4gks,4i4w,4jfd,4jfe,4jff,4jfo,4jfp,4jfq,4k7f,4l3e,4mnq,4nnx,4nny,4no0,4no2,4no3,4no5,4qok,4u6x,4u6y,4wuu,4zez,5c07,5c08,5c09,5c0a,5c0b,5c0c,5c0d,5c0e,5c0f,5c0g,5c0h,5c0i,5c0j,5d2n,5d9s,5ddh,5e9d,5enw,5eu3,5eu4,5eu5,5eu6,5euo,5hhm,5hhn,5hho,5hhp,5hhq,5hyj,5iro,5swq (unprocessed)

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ligand
A1
M
2
9
Y
3
1
F
3
3
M
6
9
Y
8
3
G
8
6
E
8
7
R
8
9
K
9
0
V
9
1
A
9
3
H
9
4
Q
9
6
T
9
7
H
9
8
V
1
0
0
D
1
0
1
T
1
0
4
L
1
0
5
Y
1
0
8
R
1
2
1
Y
1
2
3
H
1
3
8
Y
1
4
0
Y
1
4
7
T
1
6
7
K
1
7
0
W
1
7
1
A
1
7
4
H
1
7
5
V
1
7
6
Q
1
7
9
L
1
8
0
A
1
8
2
Y
1
8
3
T
1
8
7
W
1
9
1
Y
1
9
5
[1]2gj6.a 3ib,GL,LLFGKPVYV,Q-TDS 130 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4uq3.c GLSxy1.xfwL 56 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]4wj5.a grn.nvaAGIGILTlph 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i4f.a GVYDGREHTV 80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2pye.a E-LG,SLLMWITQC,Y-L-Y 128 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1ao7.a GLAGG,LLFGYPVYV,Q-TDS 132 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1b0g.a ALWGFFPVL 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1b0r.a GIL-VFTcde 51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1bd2.a LLFGYPVYV,M-MEGA,YPG-Y 146 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1duy.d LFGYPVYV 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1duz.d LLFGYPVYV 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1eey.a ILSALVGIV 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1eez.a ILSALVGIL 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hhg.d TLTSCNTSV 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hhh.a FLPSDFFPSV 83 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1hhj.a ILKEPVHGV 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i1f.a FLKEPVHGV 73 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i1y.a YLKEPVHGV 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i7r.a FAPGFFPYL 77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i7t.a ALWGVFPVL 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1i7u.a ALWGFVPVL 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jf1.a ELAGIGILTV 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1jht.a ALGIGILTV 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1lp9.h ALWGFFPVL,F-LASSSFS,WVS 162 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1oga.a D-QI-RSS,GILGFVFTL,GSQGN 148 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qew.a FLWGPRALV 76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qr1.a IISAV-IL 50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qrn.a GLAGGRP,LLFGYAVYV,Q-TDS 148 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qse.a GLA-P,LLFGYPRYV,Q-TDS 135 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1qsf.a GLAGGRP,LLFGYPVAV,Q-TDS 136 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s8d.a SLANTVATL 62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s9w.a SLLMWITQC 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s9x.a SLLMWITQA 74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1s9y.a SLLMWITQS 75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1t1w.a SLFNTIAVL 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1t1x.a SLYLTVATL 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1t1y.a SLYNVVATL 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1t1z.a ALYNTAAAL 64 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1t20.a SLYNTIATL 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tvb.a ITDQVPFSV 71 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]1tvh.a IMDQVPFSV 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2av1.a LLFGYPVYV 77 . . . . . . Q . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2av7.d LLFGYPVYV 77 . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bnq.a E-YVGN,SLLMWITQV,Y-Y 140 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2bnr.a E-YVGN,SLLMWITQC,Y-Y 139 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2clr.a MLLSVPLLLG 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2f53.a E-VGN,na,SLLMWITQC,Y-Y 128 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2f54.a E-VGN,SLLMWITQC,Y-Y 127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2git.a LLFGKPVYV 72 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2gt9.a EAAGIGILTV 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2gtw.a LAGIGILTV 60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2guo.a AAGIGILTV 57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2j8u.a ALWGFFPVL,F-LASSSFS,WVS 162 . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2jcc.h ALWGFFPVL,F-LASSSFS,WVS 162 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
[1]2p5e.a E-LGN,SLLMWITQC,Y-L-Y 136 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2p5w.a E-LGN,SLLMWITQC,Y-Y 128 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2uwe.h ALWGFFPVL,F-LASSSFS,WVS 162 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
[1]2v2w.a SLYNTVATL 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2v2x.a SLFNTVATL 68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vlk.a GILGFVFTL,GSQGN,QI-RS 133 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vll.d GILGFVFTL 69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vlr.a GILGFVFTL,GSQGN,QI-RA 132 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2vlr.f GILGFVFTL,GSQG,QI-RA 124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4n.a KILGprv,V 38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4o.d KLTPLCVTL 68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4q.a mseILGprvVFprqV 81 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4r.d NLVPMVATV 65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4s.a AMDSNTLEL 68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
[1]2x4t.a NLVprwMVATV 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Legend

B backbone contact  S side chain contact  F BB + SCh
.
 no contact C covalent bond
X X X X X  clash
X mutation to X * complex cases - deletion
M contact with cofactors/metals (if any)
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